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Gene name: | VPS54 |
Databases ID: | DEG :DEG20231616 OrthoDB:EOG0937029K UniProt:Q9P1Q0 |
Organism: | Homo sapiens |
Function: | VPS54 GARP complex subunit |
Nucleotide sequence: | Length=2934bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGGCTTCAAGCCACAGTTCTTCACCAGTGCCTCAAGGAAGCAGCAGTGATGTTTTCTTTAAAATAGAGGTAGATCCGTCAAAACACATTCGACCTGTGCCATCACTGCCAGATGTGTGTCCCAAGGAACCCACAGGTGATTCACATAGTTTATATGTTGCCCCATCTCTAGTTACAGATCAACATAGATGGACTGTATATCATTCCAAAGTAAATCTCCCAGCAGCATTAAACGATCCTAGATTAGCAAAAAGAGAATCTGACTTCTTCACAAAAACATGGGGATTGGACTTTGTGGACACTGAAGTCATACCTTCATTCTACCTCCCACAGATCAGCAAGGAACATTTTACAGTATATCAACAGGAAATCTCTCAGAGAGAGAAGATTCATGAGAGATGCAAGAATATTTGTCCTCCTAAAGATACCTTCGAAAGGACTCTTTTACATACTCATGATAAATCCAGGACAGATCTGGAGCAAGTACCTAAGATTTTTATGAAACCAGATTTTGCCTTGGATGATTCCTTAACTTTTAATTCAGTTTTACCATGGTCTCATTTTAATACTGCTGGTGGAAAAGGAAATCGTGATGCAGCTTCCTCAAAGTTGCTTCAAGAAAAGCTGAGCCATTATCTGGATATTGTGGAAGTAAACATTGCTCACCAGATCTCTCTACGTTCAGAAGCATTTTTTCATGCAATGACCTCTCAACACGAGTTGCAGGACTACCTCAGGAAAACTTCCCAGGCTGTAAAAATGCTTCGAGATAAAATTGCACAGATTGATAAAGTAATGTGTGAAGGATCACTCCACATTTTAAGACTGGCACTTACCAGAAATAATTGTGTTAAAGTATACAATAAGCTGAAGTTAATGGCCACTGTACACCAGACTCAGCCTACAGTACAGGTGTTATTATCTACTTCTGAATTTGTTGGAGCATTGGACTTAATAGCAACAACACAAGAGGTTCTACAGCAGGAACTTCAGGGCATTCACAGTTTCCGGCATTTGGGATCACAGCTTTGTGAATTAGAAAAACTGATAGATAAAATGATGATTGCAGAATTTTCTACTTATTCTCACAGTGACTTAAATAGACCACTGGAAGATGACTGTCAAGTTTTAGAAGAGGAAAGACTAATATCTCTTGTATTTGGACTTTTAAAACAAAGAAAGCTTAATTTTTTAGAAATCTATGGTGAAAAAATGGTTATTACAGCAAAGAATATCATTAAACAGTGTGTGATTAATAAAGTTTCACAAACAGAAGAAATAGACACAGATGTTGTTGTGAAGCTTGCAGATCAGATGAGAATGTTGAATTTTCCCCAGTGGTTTGATCTGCTCAAGGATATTTTCTCTAAGTTTACAATTTTCCTACAGAGAGTGAAGGCAACATTAAATATCATTCACAGTGTTGTTCTCTCAGTTCTTGACAAAAACCAAAGGACTAGAGAATTGGAAGAGATTTCACAACAGAAGAATGCTGCAAAAGATAATTCACTGGACACAGAGGTGGCTTATTTAATCCATGAAGGCATGTTTATAAGTGATGCATTCGGTGAGGGTGAGCTAACACCTATAGCAGTTGACACTACCTCTCAAAGAAATGCATCTCCAAATAGTGAGCCCTGCAGCAGTGATTCTGTATCCGAGCCAGAATGTACTACTGATTCTTCATCCAGCAAAGAGCACACATCATCATCTGCTATTCCAGGAGGTGTGGATATTATGGTCAGTGAAGATATGAAATTAACTGACTCAGAGCTAGGAAAGCTGGCAAATAATATCCAGGAATTATTATATAGTGCCTCAGATATATGCCATGATCGAGCTGTCAAATTTCTCATGTCAAGAGCAAAGGATGGTTTTCTTGAGAAGCTAAATTCCATGGAATTCATAACACTTTCTAGATTAATGGAAACATTCATTTTAGACACCGAACAGATCTGTGGAAGAAAAAGCACGTCATTACTTGGAGCACTTCAGAGCCAAGCTATTAAGTTTGTAAATAGGTTTCATGAAGAGAGAAAAACCAAGCTCAGCCTCCTCTTAGACAATGAGCGCTGGAAGCAAGCAGATGTTCCTGCAGAATTTCAGGATCTTGTTGATTCTCTGTCAGATGGGAAGATTGCTTTACCTGAAAAAAAATCAGGAGCCACAGAAGAAAGGAAACCAGCTGAAGTTCTTATTGTCGAGGGACAACAGTATGCAGTTGTTGGAACCGTATTGCTGTTAATAAGAATTATCCTTGAATATTGCCAGTGTGTGGATAACATCCCATCTGTTACTACTGACATGCTTACTCGTCTGTCAGATTTATTGAAGTACTTCAATTCAAGAAGTTGCCAGTTAGTTCTTGGAGCTGGTGCACTGCAAGTTGTTGGACTAAAAACGATAACTACAAAAAATTTGGCTCTTTCTTCACGATGTTTGCAGTTAATTGTGCACTACATTCCTGTGATCCGGGCTCATTTTGAAGCTCGACTACCACCTAAGCAATATAGCATGCTTAGGCATTTTGATCATATCACTAAGGACTACCATGATCACATAGCTGAAATATCAGCTAAGCTTGTAGCGATAATGGATAGCTTATTTGACAAGCTGTTATCTAAGTATGAAGTGAAGGCTCCTGTTCCTTCTGCCTGTTTCAGGAATATTTGTAAGCAAATGACAAAAATGCACGAAGCTATATTTGATCTCCTTCCAGAAGAACAAACACAGATGTTATTTTTAAGAATTAATGCAAGTTATAAACTCCACTTGAAAAAGCAGTTATCTCACTTAAATGTGATAAATGATGGAGGACCTCAAAATGGGTTGGTCACAGCAGATGTAGCTTTTTACACTGGAAATCTTCAAGCCTTAAAAGGCCTTAAAGATTTGGACCTAAATATGGCCGAAATTTGGGAGCAGAAGAGGTGA | |
Amino acid sequence: | Length=977bp |
BlastP NCBI nr
MASSHSSSPVPQGSSSDVFFKIEVDPSKHIRPVPSLPDVCPKEPTGDSHSLYVAPSLVTDQHRWTVYHSKVNLPAALNDPRLAKRESDFFTKTWGLDFVDTEVIPSFYLPQISKEHFTVYQQEISQREKIHERCKNICPPKDTFERTLLHTHDKSRTDLEQVPKIFMKPDFALDDSLTFNSVLPWSHFNTAGGKGNRDAASSKLLQEKLSHYLDIVEVNIAHQISLRSEAFFHAMTSQHELQDYLRKTSQAVKMLRDKIAQIDKVMCEGSLHILRLALTRNNCVKVYNKLKLMATVHQTQPTVQVLLSTSEFVGALDLIATTQEVLQQELQGIHSFRHLGSQLCELEKLIDKMMIAEFSTYSHSDLNRPLEDDCQVLEEERLISLVFGLLKQRKLNFLEIYGEKMVITAKNIIKQCVINKVSQTEEIDTDVVVKLADQMRMLNFPQWFDLLKDIFSKFTIFLQRVKATLNIIHSVVLSVLDKNQRTRELEEISQQKNAAKDNSLDTEVAYLIHEGMFISDAFGEGELTPIAVDTTSQRNASPNSEPCSSDSVSEPECTTDSSSSKEHTSSSAIPGGVDIMVSEDMKLTDSELGKLANNIQELLYSASDICHDRAVKFLMSRAKDGFLEKLNSMEFITLSRLMETFILDTEQICGRKSTSLLGALQSQAIKFVNRFHEERKTKLSLLLDNERWKQADVPAEFQDLVDSLSDGKIALPEKKSGATEERKPAEVLIVEGQQYAVVGTVLLLIRIILEYCQCVDNIPSVTTDMLTRLSDLLKYFNSRSCQLVLGAGALQVVGLKTITTKNLALSSRCLQLIVHYIPVIRAHFEARLPPKQYSMLRHFDHITKDYHDHIAEISAKLVAIMDSLFDKLLSKYEVKAPVPSACFRNICKQMTKMHEAIFDLLPEEQTQMLFLRINASYKLHLKKQLSHLNVINDGGPQNGLVTADVAFYTGNLQALKGLKDLDLNMAEIWEQKR |