Information | |
Gene name: | SCN3A |
Databases ID: | DEG :DEG20101569 OrthoDB:EOG093700BU UniProt:Q9NY46 |
Organism: | Homo sapiens |
Function: | sodium channel, voltage gated, type III alpha subunit |
Nucleotide sequence: | Length=6003bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGGCACAGGCACTGTTGGTACCCCCAGGACCTGAAAGCTTCCGCCTTTTTACTAGAGAATCTCTTGCTGCTATCGAAAAACGTGCTGCAGAAGAGAAAGCCAAGAAGCCCAAAAAGGAACAAGATAATGATGATGAGAACAAACCAAAGCCAAATAGTGACTTGGAAGCTGGAAAGAACCTTCCATTTATTTATGGAGACATTCCTCCAGAGATGGTGTCAGAGCCCCTGGAGGACCTGGATCCCTACTATATCAATAAGAAAACTTTTATAGTAATGAATAAAGGAAAGGCAATTTTCCGATTCAGTGCCACCTCTGCCTTGTATATTTTAACTCCACTAAACCCTGTTAGGAAAATTGCTATCAAGATTTTGGTACATTCTTTATTCAGCATGCTTATCATGTGCACTATTTTGACCAACTGTGTATTTATGACCTTGAGCAACCCTCCTGACTGGACAAAGAATGTAGAGTACACATTCACTGGAATCTATACCTTTGAGTCACTTATAAAAATCTTGGCAAGAGGGTTTTGCTTAGAAGATTTTACGTTTCTTCGTGATCCATGGAACTGGCTGGATTTCAGTGTCATTGTGATGGCATATGTGACAGAGTTTGTGGACCTGGGCAATGTCTCAGCGTTGAGAACATTCAGAGTTCTCCGAGCACTGAAAACAATTTCAGTCATTCCAGGTTTAAAGACCATTGTGGGGGCCCTGATCCAGTCGGTAAAGAAGCTTTCTGATGTGATGATCCTGACTGTGTTCTGTCTGAGCGTGTTTGCTCTCATTGGGCTGCAGCTGTTCATGGGCAATCTGAGGAATAAATGTTTGCAGTGGCCCCCAAGCGATTCTGCTTTTGAAACCAACACCACTTCCTACTTTAATGGCACAATGGATTCAAATGGGACATTTGTTAATGTAACAATGAGCACATTTAACTGGAAGGATTACATTGGAGATGACAGTCACTTTTATGTTTTGGATGGGCAAAAAGACCCTTTACTCTGTGGAAATGGCTCAGATGCAGGCCAGTGTCCAGAAGGATACATCTGTGTGAAGGCTGGTCGAAACCCCAACTATGGCTACACAAGCTTTGACACCTTTAGCTGGGCTTTCCTGTCTCTATTTCGACTCATGACTCAAGACTACTGGGAAAATCTTTACCAGTTGACATTACGTGCTGCTGGGAAAACATACATGATATTTTTTGTCCTGGTCATTTTCTTGGGCTCATTTTATTTGGTGAATTTGATCCTGGCTGTGGTGGCCATGGCCTATGAGGAGCAGAATCAGGCCACCTTGGAAGAAGCAGAACAAAAAGAGGCCGAATTTCAGCAGATGCTCGAACAGCTTAAAAAGCAACAGGAAGAAGCTCAGGCAGTTGCGGCAGCATCAGCTGCTTCAAGAGATTTCAGTGGAATAGGTGGGTTAGGAGAGCTGTTGGAAAGTTCTTCAGAAGCATCAAAGTTGAGTTCCAAAAGTGCTAAAGAATGGAGGAACCGAAGGAAGAAAAGAAGACAGAGAGAGCACCTTGAAGGAAACAACAAAGGAGAGAGAGACAGCTTTCCCAAATCCGAATCTGAAGACAGCGTCAAAAGAAGCAGCTTCCTTTTCTCCATGGATGGAAACAGACTGACCAGTGACAAAAAATTCTGCTCCCCTCATCAGTCTCTCTTGAGTATCCGTGGCTCCCTGTTTTCCCCAAGACGCAATAGCAAAACAAGCATTTTCAGTTTCAGAGGTCGGGCAAAGGATGTTGGATCTGAAAATGACTTTGCTGATGATGAACACAGCACATTTGAAGACAGCGAAAGCAGGAGAGACTCACTGTTTGTGCCGCACAGACATGGAGAGCGACGCAACAGTAACGTTAGTCAGGCCAGTATGTCATCCAGGATGGTGCCAGGGCTTCCAGCAAATGGGAAGATGCACAGCACTGTGGATTGCAATGGTGTGGTTTCCTTGGTGGGTGGACCTTCAGCTCTAACGTCACCTACTGGACAACTTCCCCCAGAGGGCACCACCACAGAAACGGAAGTCAGAAAGAGAAGGTTAAGCTCTTACCAGATTTCAATGGAGATGCTGGAGGATTCCTCTGGAAGGCAAAGAGCCGTGAGCATAGCCAGCATTCTGACCAACACAATGGAAGAACTTGAAGAATCTAGACAGAAATGTCCGCCATGCTGGTATAGATTTGCCAATGTGTTCTTGATCTGGGACTGCTGTGATGCATGGTTAAAAGTAAAACATCTTGTGAATTTAATTGTTATGGATCCATTTGTTGATCTTGCCATCACTATTTGCATTGTCTTAAATACCCTCTTTATGGCCATGGAGCACTACCCCATGACTGAGCAATTCAGTAGTGTGTTGACTGTAGGAAACCTGGTCTTTACTGGGATTTTCACAGCAGAAATGGTTCTCAAGATCATTGCCATGGATCCTTATTACTATTTCCAAGAAGGCTGGAATATCTTTGATGGAATTATTGTCAGCCTCAGTTTAATGGAGCTTGGTCTGTCAAATGTGGAGGGATTGTCTGTACTGCGATCATTCAGACTGCTTAGAGTTTTCAAGTTGGCAAAATCCTGGCCCACACTAAATATGCTAATTAAGATCATTGGCAATTCTGTGGGGGCTCTAGGAAACCTCACCTTGGTGTTGGCCATCATCGTCTTCATTTTTGCTGTGGTCGGCATGCAGCTCTTTGGTAAGAGCTACAAAGAATGTGTCTGCAAGATCAATGATGACTGTACGCTCCCACGGTGGCACATGAACGACTTCTTCCACTCCTTCCTGATTGTGTTCCGCGTGCTGTGTGGAGAGTGGATAGAGACCATGTGGGACTGTATGGAGGTCGCTGGCCAAACCATGTGCCTTATTGTTTTCATGTTGGTCATGGTCATTGGAAACCTTGTGGTTCTGAACCTCTTTCTGGCCTTATTGTTGAGTTCATTTAGCTCAGACAACCTTGCTGCTACTGATGATGACAATGAAATGAATAATCTGCAGATTGCAGTAGGAAGAATGCAAAAGGGAATTGATTATGTGAAAAATAAGATGCGGGAGTGTTTCCAAAAAGCCTTTTTTAGAAAGCCAAAAGTTATAGAAATCCATGAAGGCAATAAGATAGACAGCTGCATGTCCAATAATACTGGAATTGAAATAAGCAAAGAGCTTAATTATCTTAGAGATGGGAATGGAACCACCAGTGGTGTAGGTACTGGAAGCAGTGTTGAAAAATACGTAATCGATGAAAATGATTATATGTCATTCATAAACAACCCCAGCCTCACCGTCACAGTGCCAATTGCTGTTGGAGAGTCTGACTTTGAAAACTTAAATACTGAAGAGTTCAGCAGTGAGTCAGAACTAGAAGAAAGCAAAGAGAAATTAAATGCAACCAGCTCATCTGAAGGAAGCACAGTTGATGTTGTTCTACCCCGAGAAGGTGAACAAGCTGAAACTGAACCCGAAGAAGACCTTAAACCGGAAGCTTGTTTTACTGAAGGATGTATTAAAAAGTTTCCATTCTGTCAAGTAAGTACAGAAGAAGGCAAAGGGAAGATCTGGTGGAATCTTCGAAAAACCTGCTACAGTATTGTTGAGCACAACTGGTTTGAGACTTTCATTGTGTTCATGATCCTTCTCAGTAGTGGTGCATTGGCCTTTGAAGATATATACATTGAACAGCGAAAGACTATCAAAACCATGCTAGAATATGCTGACAAAGTCTTTACCTATATATTCATTCTGGAAATGCTTCTCAAATGGGTTGCTTATGGATTTCAAACATATTTCACTAATGCCTGGTGCTGGCTAGATTTCTTGATCGTTGATGTTTCTTTGGTTAGCCTGGTAGCCAATGCTCTTGGCTACTCAGAACTCGGTGCCATCAAATCATTACGGACATTAAGAGCTTTAAGACCTCTAAGAGCCTTATCCCGGTTTGAAGGCATGAGGGTGGTTGTGAATGCTCTTGTTGGAGCAATTCCCTCTATCATGAATGTGCTGTTGGTCTGTCTCATCTTCTGGTTGATCTTTAGCATCATGGGTGTGAATTTGTTTGCTGGCAAGTTCTACCACTGTGTTAACATGACAACGGGTAACATGTTTGACATTAGTGATGTTAACAATTTGAGTGACTGTCAGGCTCTTGGCAAGCAAGCTCGGTGGAAAAACGTGAAAGTAAACTTTGATAATGTTGGCGCTGGCTATCTTGCACTGCTTCAAGTGGCCACATTTAAAGGCTGGATGGATATTATGTATGCAGCTGTTGATTCACGAGATGTTAAACTTCAGCCTGTATATGAAGAAAATCTGTACATGTATTTATACTTTGTCATCTTTATCATCTTTGGGTCATTCTTCACTCTGAATCTATTCATTGGTGTCATCATAGATAACTTCAACCAGCAGAAAAAGAAGTTTGGAGGTCAAGACATCTTTATGACAGAGGAACAGAAAAAATATTACAATGCAATGAAGAAACTTGGATCCAAGAAACCTCAGAAACCCATACCTCGCCCAGCAAACAAATTCCAAGGAATGGTCTTTGATTTTGTAACCAGACAAGTCTTTGATATCAGCATCATGATCCTCATCTGCCTCAACATGGTCACCATGATGGTGGAAACGGATGACCAGGGCAAATACATGACCCTAGTTTTGTCCCGGATCAACCTAGTGTTCATTGTTCTGTTCACTGGAGAATTTGTGCTGAAGCTCGTCTCCCTCAGACACTACTACTTCACTATAGGCTGGAACATCTTTGACTTTGTGGTGGTGATTCTCTCCATTGTAGGTATGTTTCTGGCTGAGATGATAGAAAAGTATTTTGTGTCCCCTACCTTGTTCCGAGTGATCCGTCTTGCCAGGATTGGCCGAATCCTACGTCTGATCAAAGGAGCAAAGGGGATCCGCACGCTGCTCTTTGCTTTGATGATGTCCCTTCCTGCGTTGTTTAACATCGGCCTCCTGCTCTTCCTGGTCATGTTTATCTATGCCATCTTTGGGATGTCCAACTTTGCCTATGTTAAAAAGGAAGCTGGAATTGATGACATGTTCAACTTTGAGACCTTTGGCAACAGCATGATCTGCTTGTTCCAAATTACAACCTCTGCTGGCTGGGATGGATTGCTAGCACCTATTCTTAATAGTGCACCACCCGACTGTGACCCTGACACAATTCACCCTGGCAGCTCAGTTAAGGGAGACTGTGGGAACCCATCTGTTGGGATTTTCTTTTTTGTCAGTTACATCATCATATCCTTCCTGGTTGTGGTGAACATGTACATCGCGGTCATCCTGGAGAACTTCAGTGTTGCTACTGAAGAAAGTGCAGAGCCCCTGAGTGAGGATGACTTTGAGATGTTCTATGAGGTTTGGGAAAAGTTTGATCCCGATGCGACCCAGTTTATAGAGTTCTCTAAACTCTCTGATTTTGCAGCTGCCCTGGATCCTCCTCTTCTCATAGCAAAACCCAACAAAGTCCAGCTTATTGCCATGGATCTGCCCATGGTCAGTGGTGACCGGATCCACTGTCTTGATATTTTATTTGCCTTTACAAAGCGTGTTTTGGGTGAGAGTGGAGAGATGGATGCCCTTCGAATACAGATGGAAGACAGGTTTATGGCATCAAACCCCTCCAAAGTCTCTTATGAGCCTATTACAACCACTTTGAAACGTAAACAAGAGGAGGTGTCTGCCGCTATCATTCAGCGTAATTTCAGATGTTATCTTTTAAAGCAAAGGTTAAAAAATATATCAAGTAACTATAACAAAGAGGCAATTAAAGGGAGGATTGACTTACCTATAAAACAAGACATGATTATTGACAAACTAAATGGGAACTCCACTCCAGAAAAAACAGATGGGAGTTCCTCTACCACCTCTCCTCCTTCCTATGATAGTGTAACAAAACCAGACAAGGAAAAGTTTGAGAAAGACAAACCAGAAAAAGAAAGCAAAGGAAAAGAGGTCAGAGAAAATCAAAAGTAA | |
Amino acid sequence: | Length=2000bp |
BlastP NCBI nr
MAQALLVPPGPESFRLFTRESLAAIEKRAAEEKAKKPKKEQDNDDENKPKPNSDLEAGKNLPFIYGDIPPEMVSEPLEDLDPYYINKKTFIVMNKGKAIFRFSATSALYILTPLNPVRKIAIKILVHSLFSMLIMCTILTNCVFMTLSNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLIKILARGFCLEDFTFLRDPWNWLDFSVIVMAYVTEFVDLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLRNKCLQWPPSDSAFETNTTSYFNGTMDSNGTFVNVTMSTFNWKDYIGDDSHFYVLDGQKDPLLCGNGSDAGQCPEGYICVKAGRNPNYGYTSFDTFSWAFLSLFRLMTQDYWENLYQLTLRAAGKTYMIFFVLVIFLGSFYLVNLILAVVAMAYEEQNQATLEEAEQKEAEFQQMLEQLKKQQEEAQAVAAASAASRDFSGIGGLGELLESSSEASKLSSKSAKEWRNRRKKRRQREHLEGNNKGERDSFPKSESEDSVKRSSFLFSMDGNRLTSDKKFCSPHQSLLSIRGSLFSPRRNSKTSIFSFRGRAKDVGSENDFADDEHSTFEDSESRRDSLFVPHRHGERRNSNVSQASMSSRMVPGLPANGKMHSTVDCNGVVSLVGGPSALTSPTGQLPPEGTTTETEVRKRRLSSYQISMEMLEDSSGRQRAVSIASILTNTMEELEESRQKCPPCWYRFANVFLIWDCCDAWLKVKHLVNLIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHYPMTEQFSSVLTVGNLVFTGIFTAEMVLKIIAMDPYYYFQEGWNIFDGIIVSLSLMELGLSNVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINDDCTLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQTMCLIVFMLVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLAATDDDNEMNNLQIAVGRMQKGIDYVKNKMRECFQKAFFRKPKVIEIHEGNKIDSCMSNNTGIEISKELNYLRDGNGTTSGVGTGSSVEKYVIDENDYMSFINNPSLTVTVPIAVGESDFENLNTEEFSSESELEESKEKLNATSSSEGSTVDVVLPREGEQAETEPEEDLKPEACFTEGCIKKFPFCQVSTEEGKGKIWWNLRKTCYSIVEHNWFETFIVFMILLSSGALAFEDIYIEQRKTIKTMLEYADKVFTYIFILEMLLKWVAYGFQTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVSLVANALGYSELGAIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALVGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYHCVNMTTGNMFDISDVNNLSDCQALGKQARWKNVKVNFDNVGAGYLALLQVATFKGWMDIMYAAVDSRDVKLQPVYEENLYMYLYFVIFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKFGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPANKFQGMVFDFVTRQVFDISIMILICLNMVTMMVETDDQGKYMTLVLSRINLVFIVLFTGEFVLKLVSLRHYYFTIGWNIFDFVVVILSIVGMFLAEMIEKYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLIKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKKEAGIDDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSAPPDCDPDTIHPGSSVKGDCGNPSVGIFFFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESAEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDALRIQMEDRFMASNPSKVSYEPITTTLKRKQEEVSAAIIQRNFRCYLLKQRLKNISSNYNKEAIKGRIDLPIKQDMIIDKLNGNSTPEKTDGSSSTTSPPSYDSVTKPDKEKFEKDKPEKESKGKEVRENQK |