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Gene name: | SF3B1 |
Databases ID: | DEG :DEG20201680 OrthoDB:EOG0937019B UniProt:O75533 |
Organism: | Homo sapiens |
Function: | splicing factor 3b subunit 1 |
Nucleotide sequence: | Length=3915bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGGCGAAGATCGCCAAGACTCACGAAGATATTGAAGCACAGATTCGAGAAATTCAAGGCAAGAAGGCAGCTCTTGATGAAGCTCAAGGAGTGGGCCTCGATTCTACAGGTTATTATGACCAGGAAATTTATGGTGGAAGTGACAGCAGATTTGCTGGATACGTGACATCAATTGCTGCAACTGAACTTGAAGATGATGACGATGACTATTCATCATCTACGAGTTTGCTTGGTCAGAAGAAGCCAGGATATCATGCCCCTGTGGCATTGCTTAATGATATACCACAGTCAACAGAACAGTATGATCCATTTGCTGAGCACAGACCTCCAAAGATTGCAGACCGGGAAGATGAATACAAAAAGCATAGGCGGACCATGATAATTTCCCCAGAGCGTCTTGATCCTTTTGCAGATGGAGGGAAAACCCCTGATCCTAAAATGAATGCTAGGACTTACATGGATGTAATGCGAGAACAACACTTGACTAAAGAAGAACGAGAAATTAGGCAACAGCTAGCAGAAAAAGCTAAAGCTGGAGAACTAAAAGTCGTCAATGGAGCAGCAGCGTCCCAGCCTCCATCAAAACGAAAACGGCGTTGGGATCAAACAGCTGATCAGACTCCTGGTGCCACTCCCAAAAAACTATCAAGTTGGGATCAGGCAGAGACCCCTGGGCATACTCCTTCCTTAAGATGGGATGAGACACCAGGTCGTGCAAAGGGAAGCGAGACTCCTGGAGCAACCCCAGGCTCAAAAATATGGGATCCTACACCTAGCCACACACCAGCGGGAGCTGCTACTCCTGGACGAGGTGATACACCAGGCCATGCGACACCAGGCCATGGAGGCGCAACTTCCAGTGCTCGTAAAAACAGATGGGATGAAACCCCCAAAACAGAGAGAGATACTCCTGGGCATGGAAGTGGATGGGCTGAGACTCCTCGAACAGATCGAGGTGGAGATTCTATTGGTGAAACACCGACTCCTGGAGCCAGTAAAAGAAAATCACGGTGGGATGAAACACCAGCTAGTCAGATGGGTGGAAGCACTCCAGTTCTGACCCCTGGAAAGACACCAATTGGCACACCAGCCATGAACATGGCTACCCCTACTCCAGGTCACATAATGAGTATGACTCCTGAACAGCTTCAGGCTTGGCGGTGGGAAAGAGAAATTGATGAGAGAAATCGCCCACTTTCTGATGAGGAATTAGATGCTATGTTCCCAGAAGGATATAAGGTACTTCCTCCTCCAGCTGGTTATGTTCCTATTCGAACTCCAGCTCGAAAGCTGACAGCTACTCCAACACCTTTGGGTGGTATGACTGGTTTCCACATGCAAACTGAAGATCGAACTATGAAAAGTGTTAATGACCAGCCATCTGGAAATCTTCCATTTTTAAAACCTGATGATATTCAATACTTTGATAAACTATTGGTTGATGTTGATGAATCAACACTTAGTCCAGAAGAGCAAAAAGAGAGAAAAATAATGAAGTTGCTTTTAAAAATTAAGAATGGAACACCACCAATGAGAAAGGCTGCATTGCGTCAGATTACTGATAAAGCTCGTGAATTTGGAGCTGGTCCTTTGTTTAATCAGATTCTTCCTCTGCTGATGTCTCCTACACTTGAGGATCAAGAGCGTCATTTACTTGTGAAAGTTATTGATAGGATACTGTACAAACTTGATGACTTAGTTCGTCCATATGTGCATAAGATCCTCGTGGTCATTGAACCGCTATTGATTGATGAAGATTACTATGCTAGAGTGGAAGGCCGAGAGATCATTTCTAATTTGGCAAAGGCTGCTGGTCTGGCTACTATGATCTCTACCATGAGACCTGATATAGATAACATGGATGAGTATGTCCGTAACACAACAGCTAGAGCTTTTGCTGTTGTAGCCTCTGCCCTGGGCATTCCTTCTTTATTGCCCTTCTTAAAAGCTGTGTGCAAAAGCAAGAAGTCCTGGCAAGCGAGACACACTGGTATTAAGATTGTACAACAGATAGCTATTCTTATGGGCTGTGCCATCTTGCCACATCTTAGAAGTTTAGTTGAAATCATTGAACATGGTCTTGTGGATGAGCAGCAGAAAGTTCGGACCATCAGTGCTTTGGCCATTGCTGCCTTGGCTGAAGCAGCAACTCCTTATGGTATCGAATCTTTTGATTCTGTGTTAAAGCCTTTATGGAAGGGTATCCGCCAACACAGAGGAAAGGGTTTGGCTGCTTTCTTGAAGGCTATTGGGTATCTTATTCCTCTTATGGATGCAGAATATGCCAACTACTATACTAGAGAAGTGATGTTAATCCTTATTCGAGAATTCCAGTCTCCTGATGAGGAAATGAAAAAAATTGTGCTGAAGGTGGTAAAACAGTGTTGTGGGACAGATGGTGTAGAAGCAAACTACATTAAAACAGAGATTCTTCCTCCCTTTTTTAAACACTTCTGGCAGCACAGGATGGCTTTGGATAGAAGAAATTACCGACAGTTAGTTGATACTACTGTGGAGTTGGCAAACAAAGTAGGTGCAGCAGAAATTATATCCAGGATTGTGGATGATCTGAAAGATGAAGCCGAACAGTACAGAAAAATGGTGATGGAGACAATTGAGAAAATTATGGGTAATTTGGGAGCAGCAGATATTGATCATAAACTTGAAGAACAACTGATTGATGGTATTCTTTATGCTTTCCAAGAACAGACTACAGAGGACTCAGTAATGTTGAACGGCTTTGGCACAGTGGTTAATGCTCTTGGCAAACGAGTCAAACCATACTTGCCTCAGATCTGTGGTACAGTTTTGTGGCGTTTAAATAACAAATCTGCTAAAGTTAGGCAACAGGCAGCTGACTTGATTTCTCGAACTGCTGTTGTCATGAAGACTTGTCAAGAGGAAAAATTGATGGGACACTTGGGTGTTGTATTGTATGAGTATTTGGGTGAAGAGTACCCTGAAGTATTGGGCAGCATTCTTGGAGCACTGAAGGCCATTGTAAATGTCATAGGTATGCATAAGATGACTCCACCAATTAAAGATCTGCTGCCTAGACTCACCCCCATCTTAAAGAACAGACATGAAAAAGTACAAGAGAATTGTATTGATCTTGTTGGTCGTATTGCTGACAGGGGAGCTGAATATGTATCTGCAAGAGAGTGGATGAGGATTTGCTTTGAGCTTTTAGAGCTCTTAAAAGCCCACAAAAAGGCTATTCGTAGAGCCACAGTCAACACATTTGGTTATATTGCAAAGGCCATTGGCCCTCATGATGTATTGGCTACACTTCTGAACAACCTCAAAGTTCAAGAAAGGCAGAACAGAGTTTGTACCACTGTAGCAATAGCTATTGTTGCAGAAACATGTTCACCCTTTACAGTACTCCCTGCCTTAATGAATGAATACAGAGTTCCTGAACTGAATGTTCAAAATGGAGTGTTAAAATCGCTTTCCTTCTTGTTTGAATATATTGGTGAAATGGGAAAAGACTACATTTATGCCGTAACACCGTTACTTGAAGATGCTTTAATGGATAGAGACCTTGTACACAGACAGACGGCTAGTGCAGTGGTACAGCACATGTCACTTGGGGTTTATGGATTTGGTTGTGAAGATTCGCTGAATCACTTGTTGAACTATGTATGGCCCAATGTATTTGAGACATCTCCTCATGTAATTCAGGCAGTTATGGGAGCCCTAGAGGGCCTGAGAGTTGCTATTGGACCATGTAGAATGTTGCAATATTGTTTACAGGGTCTGTTTCACCCAGCCCGGAAAGTCAGAGATGTATATTGGAAAATTTACAACTCCATCTACATTGGTTCCCAGGACGCTCTCATAGCACATTACCCAAGAATCTACAACGATGATAAGAACACCTATATTCGTTATGAACTTGACTATATCTTATAA | |
Amino acid sequence: | Length=1304bp |
BlastP NCBI nr
MAKIAKTHEDIEAQIREIQGKKAALDEAQGVGLDSTGYYDQEIYGGSDSRFAGYVTSIAATELEDDDDDYSSSTSLLGQKKPGYHAPVALLNDIPQSTEQYDPFAEHRPPKIADREDEYKKHRRTMIISPERLDPFADGGKTPDPKMNARTYMDVMREQHLTKEEREIRQQLAEKAKAGELKVVNGAAASQPPSKRKRRWDQTADQTPGATPKKLSSWDQAETPGHTPSLRWDETPGRAKGSETPGATPGSKIWDPTPSHTPAGAATPGRGDTPGHATPGHGGATSSARKNRWDETPKTERDTPGHGSGWAETPRTDRGGDSIGETPTPGASKRKSRWDETPASQMGGSTPVLTPGKTPIGTPAMNMATPTPGHIMSMTPEQLQAWRWEREIDERNRPLSDEELDAMFPEGYKVLPPPAGYVPIRTPARKLTATPTPLGGMTGFHMQTEDRTMKSVNDQPSGNLPFLKPDDIQYFDKLLVDVDESTLSPEEQKERKIMKLLLKIKNGTPPMRKAALRQITDKAREFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLATMISTMRPDIDNMDEYVRNTTARAFAVVASALGIPSLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAILPHLRSLVEIIEHGLVDEQQKVRTISALAIAALAEAATPYGIESFDSVLKPLWKGIRQHRGKGLAAFLKAIGYLIPLMDAEYANYYTREVMLILIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCCGTDGVEANYIKTEILPPFFKHFWQHRMALDRRNYRQLVDTTVELANKVGAAEIISRIVDDLKDEAEQYRKMVMETIEKIMGNLGAADIDHKLEEQLIDGILYAFQEQTTEDSVMLNGFGTVVNALGKRVKPYLPQICGTVLWRLNNKSAKVRQQAADLISRTAVVMKTCQEEKLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALKAIVNVIGMHKMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEYVSAREWMRICFELLELLKAHKKAIRRATVNTFGYIAKAIGPHDVLATLLNNLKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCSPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTASAVVQHMSLGVYGFGCEDSLNHLLNYVWPNVFETSPHVIQAVMGALEGLRVAIGPCRMLQYCLQGLFHPARKVRDVYWKIYNSIYIGSQDALIAHYPRIYNDDKNTYIRYELDYIL |