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Gene name: | URB1 |
Databases ID: | DEG :DEG20010602 OrthoDB:EOG093700OW UniProt:- |
Organism: | Saccharomyces cerevisiae |
Function: | Nucleolar protein required for the normal accumulation of 25S and 5.8S rRNAs, associated with the 27SA2 pre-ribosomal particle; proposed to be involved in the biogenesis of the 60S ribosomal subunit |
Nucleotide sequence: | Length=5295bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGAGTAATCATAGCGAAGCCTATGGATCTCGCGACCAGAGAAGGGAGAAGTACACCCAAGGGAAAGAGTTCGAAGACGGTACATTAGAAACACTAGAAAGTATAATCAGTGCAGTCGAAGATGAAACTCTCTCCAAAGATTACCAACCTCTAATAGTGTTCTTCCAAAGAGGATTTGGTGCTCAATTGGTACAGACTTGGTCATATTATGCTCAAGTAAATAACCATGGGAAATTCTCGAAAACTACCTCATTACTGACTAAAACCTTACGAGTTTTGTCATCTGATACTAGTACAGTGACTATTGGGAGCGGTCTAATTAGATTGATATTGACCGATTACACAAAAGTTCTCTATAGAGGGTTGAACAATATGCGTGCGCAATTAACTAATCCAATTCTTCGTCTACTCAAACAAATAGTCAATTTCAACAATGGGCAACATATAGAGGAATTAGTTTCATATTTCGATTTTTCATTACCTATTTTACCAAGACTGTTGGTACCAAGCAAGTCTGAGTTAGCCAATGGGAATTCATCTGCTGATTCATCCAAACATGACTCATTAAGATTTACATTTATCAAGTTTTGGTTGACATTGATCTCAAATGCTTCCCCATTCGTGAGAAAAGAACTTTTGACAGAAAACTTTAAGATTATGAGCAACCTATTTAAATTCATGAATAAGGCTGATTCTGACAAGTTATCTGAGCACATACTATCGGTATTCATAAACGACATTTTAAAGGAGAAATCCTTCAAGAGAACTACTAAAACCAAAATTTTAAATGAACTAGCGGCTTCAAAGATTCATCACTTTTATTATTCATCAAACAAGAATTTGGTTAAGAAGGCAAATGAGTTTTTCTTAACTTTTGGAGCTTCCCGTGACTTTAGCGTAGCATTTCCTGATAATTGCGTTTGGTTCAAAAATTCAGTTGCTGATGGAGCTTCTCATGGAGCTCCGATAACCGTCAACCAAGTGGAATTTCAAATTCATAATAAACTTTTGTTCAACACTTTACGCCTTTTCAAACCTTGGGAAGATACGCTGCAATTAGGTACGTTGATCAAAATATTGGAGAACGTTCCCGAACTTGTTGCTCCTTACAGCATCTTTTTAACGACGAATGGTAACTATGACCCTAAGATGACTTCGTATTGGTTTGGTATAACGTTACTGATTAACAAGATTATTAATCTTAAGATACCGCAATTTATGGAGAAAGTTGATAGCAATATTCCACCTGCCACTTCATTAGTTATAGAAAACATTCTGCCATCTTTGCTCACCAAATCCTCGTTGGTTAAATCCCTACAATTTGAAACACCCATCATAAGACAATTAGCCTGTCAATCAATAGTTCTAGCGTTAAAAAAATTAGAAAAAGTTTCCACATTTTATGATCAAAAAGGCTGGAGAAATGAAAAAACTATTTTACTCAACGAGTTTCATACTAGAATTCCTGATTTACCAATCTTCGTATCTACTTTGAGCAATTCTTTGGCTTCCAATAAGGATAATAGAATTTTACCTCTGTCCATATCCATCATATTCAACTACTATAGTAAAATGTTCCCCAACCTCTTCTCAATTAACCTACCATCATCAAATATTTACACAGATATCATGCAAAAATCCAAGATTTCTGGCATAGAATTTGCTATTCTGGACAACTACTTACAATTTCAAGAATTTAACTCTACTCAAACCAGGTGGTGGAATCCAAGTTCTGGTGGAAATTCTTTATTCACCCTACTATTAAAGCTAGCATCCTCCAAAAATGCTTCTAACGTGATAACTACAAGAATATCCAACTTGCTCGATGAGCTGACGAGAACAAACGTTATCTTCAACATATCTTTAATTTCACCAGTGATGGCTTTAGTGAATAGTCTTCAAGGGCTTTCCCTTCAAGTTTCTGAAATTGACAACATGGAACAAGTCTGGAAGTGGTTTGACGAAACTATATCTCGTGTCGTAAAAACACCATACAAGTACGTCGATATGGCAAAAGAGTATAACTACATTTCTCCCTTCATAATGTGCCTTTCAGAGCAATGGAAATACGTTGACAAGAGTGGAAACCCAGAGTTTTTAATTAAATGGCTTATACTTTTTCTTAGAAACATGATTTTCATTGGTGAAGACCATATAGGCATAGATAAACTTGTTAAAAATGTCTTTCCTGAGGTCTCTGATCATGATGTTAATATATACTTGAAACTTGACTCATTTGAAGAAAACATAAAGAAAACTAATAGCTCTAATTCTTTAATTTCTTCAATGAAGAGCTCATCTTTTTTCCAGTATATTTCGGCGCTTCCATCTAAAAATCTAATGAATATTTCTAGATTACCAGTGAACAAATTAGATGCGGCAGGAATCCTTTTTAGAGTTCAGTTATTGGTAGAAGACGATTCTGTTGTATATGACAATTGGTTCGAAGCAACTGCCTGTGAGTTAACTGGCAAGATTGCTAGCTACATGGTAACAGACACAGAATTCCCAATTATCAAAGTTTTGGAAAGGTATATAAATTTCGCTTTACCAAAACTGGCCATTGAAAAAAGAAATGCTCTACTCATGAAAAAATCAAGGTTCATGTGCAATTTAATCGGTGCAGTATGCTTTGAAACAGGCCATCAATTAGTGGAATTCCGAGAAATAATTCAAAAAGTCGTGTTTAGTGGTGAAAATGTCGAAGAGTATGCCAACTATAATGAGTTGTATCAGAAAGAAGATGTAAATGCTTTCTTAACAAGTGTTAGTGAGTATTTAAGTACTTCAGCTTTAACTTCGCTACTCATGTGTAGCACCAAACTAGAGTCCACAAGAAACATTCTCCAAAAATTATTCAACGAAGGAAAAACTATAAAAATATCCCTTGTAAAGAATATACTGAACAAAGCTGCAAATGAAGATCCTGCTTCAATTAAGGAAGTAAACATCTCTTTGGCTAAATTTTTTGAAGAAAACAAAGTTTGTGTTGATGCTTCATCTGATCCTATGGGTAAGCTATCCCTTTCAGAAACTACTTCTCTGATAAATAGTTTTGTGTCTAGTGATTTGAATTATCTAGTACTGAAAGCTTTTTACAGATGGGAACATTTTTCTTTCCCATCTTTCATACCAAGTATCTGGAGGATCAAGGATTCACCTTTACTAAGTATTGTAACAACGGCTGCTTTGTTCAAGCACATGCAGGATAAAGATTTTAGCGCATTTGCGCATGAAACCATTTCCAAGTATGGTAATGAAATTGCGAAAAGTACTTACACTACCTCGAAAAGTGAGATTTTTGACGAAATATTAAATATGATTACCACTTATATTGATTTCTATGACGAAACGAAACGAAATGAAATTTTGAAATGTGTTTTATCACAGAGCGACCATAAATATCATGCTGCTACAGTAAGATACATAGCTGCACACAATAATTTTACTTATCCAGGGGTAGAAACATGGTTACATAAAACTCTTCTTTACCTTACAAAGTACCTTTCAGAAAGAAAAGTTATCTCCAATTCTTTTTTTGAGTTACTAAGAGCGATGGCTGAGCTCTTAAAACTTGAAGAGGTACCAAATAAGTTGAATGTCAAAATCATTAATTCTCAATTAGAGGCTATTCTAGGCAGTGAGTGGATCAAACAAATTAAGGTTCTTGAATACGTTATTGTATTAATTTTTTGTGTGAGCAAAAAGTCAATTCAATCGCAAAGAATGGTTCAACTTTTATTAAGCAATGACAGTTACTCATCAATAATGATTAAAGACAATGATGAAGATTCATCGTATCGAAAGTTCTTAAGCACAATGATATTATTCTCTTTATTCAGCATCGACCCGGTCGTAAATTCGACGCCAATAGTTCAAGAGAAATTATTGACTTTTTACTCCGGTACTATTTCCAGTAACGACAAGTTGATACTGAAAATTCTAGAAACTATCGAATCTCACACCGCTACTTCATGGACAAACATGATTTTTTCTTGGGAATTTATCAAAGACGAAGAGGAAGAAATCTTGGAAGCCATTGGAGACACGAGGCTGATTACCAAAGAAAGGGAGGGGTTGATACTAACACTACAAAAAAACATGATCAAAAAGTCCATTGACAGATACGTATTGGAAAGGCCTCAAGTCCCTGAATTATATACCGATTCTAATACAAACAATTATGATGCTACTACAAGGTGTGACCTAGTCAAAAAGTACTACGATGATACCGAACGATCTGGTGTTGATATGTACGATCCATTATTTTTACTGCTATTAATAATCCATAACAAAGAGCTGGTAAAAATGGTCAAAGATGACGAGGGCAATGTAACATACAGATATGAATTTGAAAATTTCCTTGATTGCAAAATATTTCAGTTTATTATTTGCTCATTAAGCGATTGTCATACCGTTGCCAATATAAGTTACGAACATTTATCAAATTTAGCTTCTTCTTTGGAGAAGAAAACTGCCCAGATGAATCTTGAAAAGCAAATAACTAGCAAGGATAATGAAAGAAAAGAATCTGATAGCGATTTAATCAAATATAATAGCATTTACCAAGTGTTGATTAAAAGGATTTTATACCAGAGACAACAAAATCAAGATCCTATCAATCCGTTAATTTGGTTTTCTATCTCTAGAATTGTTGATCTATTGGGAAGTCCAACTGCGCCCTTACATGAGAAGGCATACCGCTGGGTATTATCAAATTCTACCATACGTAGTTGGGACATCCCTATGGTATCTGATGTGATGATGTCCTACAATAAGAGACAACAAGATGACAATAAGAAAGAAATTGATATGGAAATATACTATGGAGAATTGAGTTGGGTTTTAACAACCATTTGTAAGGGAATTAAAACGGATGAAGATTACAAGATGTTAGAGAAGAAAGGTGTATTTGAATGGTTGTTAAACTTGATCAATATGCCATACTTGAAAGAAAGATTACGCGAACTAATCTATTTTATTTTTTACAAAGTCCAAAG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| |
Amino acid sequence: | Length=1764bp |
BlastP NCBI nr
MSNHSEAYGSRDQRREKYTQGKEFEDGTLETLESIISAVEDETLSKDYQPLIVFFQRGFGAQLVQTWSYYAQVNNHGKFSKTTSLLTKTLRVLSSDTSTVTIGSGLIRLILTDYTKVLYRGLNNMRAQLTNPILRLLKQIVNFNNGQHIEELVSYFDFSLPILPRLLVPSKSELANGNSSADSSKHDSLRFTFIKFWLTLISNASPFVRKELLTENFKIMSNLFKFMNKADSDKLSEHILSVFINDILKEKSFKRTTKTKILNELAASKIHHFYYSSNKNLVKKANEFFLTFGASRDFSVAFPDNCVWFKNSVADGASHGAPITVNQVEFQIHNKLLFNTLRLFKPWEDTLQLGTLIKILENVPELVAPYSIFLTTNGNYDPKMTSYWFGITLLINKIINLKIPQFMEKVDSNIPPATSLVIENILPSLLTKSSLVKSLQFETPIIRQLACQSIVLALKKLEKVSTFYDQKGWRNEKTILLNEFHTRIPDLPIFVSTLSNSLASNKDNRILPLSISIIFNYYSKMFPNLFSINLPSSNIYTDIMQKSKISGIEFAILDNYLQFQEFNSTQTRWWNPSSGGNSLFTLLLKLASSKNASNVITTRISNLLDELTRTNVIFNISLISPVMALVNSLQGLSLQVSEIDNMEQVWKWFDETISRVVKTPYKYVDMAKEYNYISPFIMCLSEQWKYVDKSGNPEFLIKWLILFLRNMIFIGEDHIGIDKLVKNVFPEVSDHDVNIYLKLDSFEENIKKTNSSNSLISSMKSSSFFQYISALPSKNLMNISRLPVNKLDAAGILFRVQLLVEDDSVVYDNWFEATACELTGKIASYMVTDTEFPIIKVLERYINFALPKLAIEKRNALLMKKSRFMCNLIGAVCFETGHQLVEFREIIQKVVFSGENVEEYANYNELYQKEDVNAFLTSVSEYLSTSALTSLLMCSTKLESTRNILQKLFNEGKTIKISLVKNILNKAANEDPASIKEVNISLAKFFEENKVCVDASSDPMGKLSLSETTSLINSFVSSDLNYLVLKAFYRWEHFSFPSFIPSIWRIKDSPLLSIVTTAALFKHMQDKDFSAFAHETISKYGNEIAKSTYTTSKSEIFDEILNMITTYIDFYDETKRNEILKCVLSQSDHKYHAATVRYIAAHNNFTYPGVETWLHKTLLYLTKYLSERKVISNSFFELLRAMAELLKLEEVPNKLNVKIINSQLEAILGSEWIKQIKVLEYVIVLIFCVSKKSIQSQRMVQLLLSNDSYSSIMIKDNDEDSSYRKFLSTMILFSLFSIDPVVNSTPIVQEKLLTFYSGTISSNDKLILKILETIESHTATSWTNMIFSWEFIKDEEEEILEAIGDTRLITKEREGLILTLQKNMIKKSIDRYVLERPQVPELYTDSNTNNYDATTRCDLVKKYYDDTERSGVDMYDPLFLLLLIIHNKELVKMVKDDEGNVTYRYEFENFLDCKIFQFIICSLSDCHTVANISYEHLSNLASSLEKKTAQMNLEKQITSKDNERKESDSDLIKYNSIYQVLIKRILYQRQQNQDPINPLIWFSISRIVDLLGSPTAPLHEKAYRWVLSNSTIRSWDIPMVSDVMMSYNKRQQDDNKKEIDMEIYYGELSWVLTTICKGIKTDEDYKMLEKKGVFEWLLNLINMPYLKERLRELIYFIFYKVQRVADDGGLNLISRNGIVSFFEVLNNNIKSRLPQDDILNNIGTLRNENRGTLNTTLRLAQEQNGIEKLLLGYNELVKSQKRLILWTEGDSDNVVKRLRK |