| Information | |
| Gene name: | VCL 1 |
| Databases ID: | DEG :DEG20030131 OrthoDB:EOG093702TP UniProt:- |
| Organism: | Arabidopsis thaliana |
| Function: | Vacuolar Protein Sorting (Vps16) |
| Nucleotide sequence: | Length=2577bp |
| BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGGCAAACGTGTCTGTTGCTGCGGAATGGCAGCTTCTCTATGATCGATATTATAGGAAGCCTGAGATATACCAAATGAAATGGAAACATGTAGATTTGAGTCGTAACAAGGTGGCGTGTGCTTCGTTTGGTGGGCCAATTGCAGTTATTCGAGATGACTCGAAGATTGTCCAACTATATGCTGAATCTGCTCTAAGAAAGCTCCGCATCTTTAACTCAGCAGGTATACTTCTCTCTGAGACGGTTTGGAAGCATCCCGGGGGACGTCTGATCGGAATGTCCTGGTCAGATGATCAGACACTAATTTGCATTGTCCAAGATGGAACCATTTATCGTTACAACATCCACGCTGAGCTCATTGAGCCCAATATGTCTATGGGCCAGGAGTGCTTTGAGCAGAATGTGGTGGAGTGTGTCTTCTGGGGAAATGGTGTTGTCTGCTTGACAGAAGGAGGGCAGTTGATCTGTATTTTCGATTTCAAGACAATGAAGCCTTCTAAGTTGCCTGATGTGCCGGGGTTAGCAGAAGATGATCTGCTTCAGCCAATCTGCTTGACTGTGAGGGAACCTAAGTACACGATGTCTGGGATTGCTGAGGTGTTGGTAGCAGTTGGCGATGATATTTTTGTTGTGGAGGAGGACATGGTTCAAACTATTAGGTTTGATGAGCCTAGTGTTGATGACTCTGAGATGCAGAATGATGATTCTGGGAATTTGATTGGAGTGGTCCAGAAGATGATTGTATCACCTAATGGAAAATTTCTAACACTCTTCACTCATGATGGCCGGATTGTTGTTGTTGACATGGAAACAAAACAAATTGCTATTGACTACTCTTGTGAGTCAGCCCTTCCTCCGCAGCAAATGGCTTGGTGTGGAATGGATAGTGTGCTGCTATATTGGGATGAGGATTTAATGATGGTGGGTCCTGTAGGAGACCCAGTTCACTATTTCTATGATGAACCTATAATTCTTATCCCAGAATGCGATGGAGTGAGAATATTATCTAACACGAATCTTGAATTTCTGCAAAGAGTACCTGATTCTACTGAGTCAATCTTTAAGATTGGAAGCACATCACCTGCAGCTTTGCTATATGATGCTTTGGATCATTTTGACAGGCGAAGTGCTAAGGCAGATGAAAATTTGAGATTAATTCGTTCATCACTGTCGGAGGCTGTTGAATCCTGTATTGATGCCGCTGGACATGAATTTGATGTAACTCGTCAGAGGGCTCTGTTACGAGCGGCAAGTTATGGACAAGCTTTCTGCAGCAATTTTCAGCGTGAACGTGTCCAAGAGACTTGTAGAACGTTACGGGTTTTAAATGCGGTTCGTGATCCTGCTATTGGCATACCTCTTAGCATTCAGCAGTACAAGTTACTGACACCAGTGGTTTTGATTAGTCGCCTTATTAATGCTAATTGTCACCTTCTTGCTCTGCGGATATCTGAGTACTTAGATATGAATAAAGAAGTGGTGATAATGCATTGGGCATGTGCAAAGATAACTGCTTCACCATCAACTCCAGATTCTCATCTTCTTGAAATTTTACTTGATAAGCTCCAACTATGCAAAGGAATATCGTATGCTGCAGTGGCCACTCATGCTGATAACTGTGGCCGTCGAAAGTTAGCTGCAATGCTAGTTGAACATGAACCACGCTCCACGAAACAGGTACCTCTTTTATTAAGCATTGGGGAGGAAGACACTGCTTTAGTGAAAGCAACTGAGAGTGGTGACACTGACCTGGTTTATCTGGTCATATTTCATATATGGCAAAAGAGGCCTCCTTTGGAATTCTTTGCGATGATCCAAGGAAGAGTTTTGGCACGTGATCTATTTGTAGCTTATGCACGGTGTCATAAGCATGAATTTCTGAAGGATTTCTTCTTATCTACGGGCCAGATTCATGAGGTAGCTTTTCTTTTATGGAAAGAATCATGGGATATGGGGAAAAACCCAATGGCTAGCAAAGGATCTCCATTGCACGGTCCGCGCATAAAACTAATAGAGAAGGCTAGAAACCTTTTCTCCCAAACAAAGGAACACACTTTCGAGTCTAAGGCTGCTGAGGAACATGCAAAACTCCTGAAGATACAACATGAGCTAGAAGCTAGTACGAAGCAGGCTATCTTTGTTGATTCAAGCATCAATGATACTATACGCACATGTATTGTCCTGGGTAATAACCGTGCTGCAATAAAAGTGAAGACAGAATTCAAGGTCAGTGATAAAAGATGGTATTGGCTTAAAGCATTTGCTCTCGCTACAATCAAAGACTGGGCAGCGCTTGAAAAGTTTTCGAAGGAAAAGAGACCACCAATGGGGTTTCGTCCATTTGTGGAGGCATGCATTGATGCAGATGAGAAAGCGGAAGCTCTAAAATACATCCCCAAACTGTCTGATCTTGTGGAAAGAGGCGAGGCTTATGCTCGTATTGGAATGGCAAAGGAAGCGGCTGATTGCGCAGCTCAGGCAAATGATGGAGGAGAATTGCTTGAGAGATTCAGGAAGACGTTTGTACAGAATGCTATTTTCGATACCTTGTTAATGCCTTTCCAAGGAGCCTCCTAG | |
| Amino acid sequence: | Length=858bp |
| BlastP NCBI nr
MANVSVAAEWQLLYDRYYRKPEIYQMKWKHVDLSRNKVACASFGGPIAVIRDDSKIVQLYAESALRKLRIFNSAGILLSETVWKHPGGRLIGMSWSDDQTLICIVQDGTIYRYNIHAELIEPNMSMGQECFEQNVVECVFWGNGVVCLTEGGQLICIFDFKTMKPSKLPDVPGLAEDDLLQPICLTVREPKYTMSGIAEVLVAVGDDIFVVEEDMVQTIRFDEPSVDDSEMQNDDSGNLIGVVQKMIVSPNGKFLTLFTHDGRIVVVDMETKQIAIDYSCESALPPQQMAWCGMDSVLLYWDEDLMMVGPVGDPVHYFYDEPIILIPECDGVRILSNTNLEFLQRVPDSTESIFKIGSTSPAALLYDALDHFDRRSAKADENLRLIRSSLSEAVESCIDAAGHEFDVTRQRALLRAASYGQAFCSNFQRERVQETCRTLRVLNAVRDPAIGIPLSIQQYKLLTPVVLISRLINANCHLLALRISEYLDMNKEVVIMHWACAKITASPSTPDSHLLEILLDKLQLCKGISYAAVATHADNCGRRKLAAMLVEHEPRSTKQVPLLLSIGEEDTALVKATESGDTDLVYLVIFHIWQKRPPLEFFAMIQGRVLARDLFVAYARCHKHEFLKDFFLSTGQIHEVAFLLWKESWDMGKNPMASKGSPLHGPRIKLIEKARNLFSQTKEHTFESKAAEEHAKLLKIQHELEASTKQAIFVDSSINDTIRTCIVLGNNRAAIKVKTEFKVSDKRWYWLKAFALATIKDWAALEKFSKEKRPPMGFRPFVEACIDADEKAEALKYIPKLSDLVERGEAYARIGMAKEAADCAAQANDGGELLERFRKTFVQNAIFDTLLMPFQGAS | |