Information
Gene name:spp42
Databases ID:DEG :DEG20090271       OrthoDB:EOG0937004M     UniProt:-
Organism:Schizosaccharomyces pombe 972h-
Function:U5 snRNP complex subunit Spp42
Nucleotide sequence:Length=7092bp
BlastN NCBI nr BlastX NCBI nr BlastN NCBI Human
ATGGCGTCGTTACCACCGGGGAATCCTCCTCCACCGCCTCCTCCGCCTGGATTTGAGCCTCCTTCACAGCCTCCACCTCCTCCACCTCCAGGTTATGTGAAGAAAAGAAAAAACAAGACTCCAGCACAGTCTGGAAATCTTGAAAAGCAACTTAACGAAAGAGCACGCAAATGGCGCGCTTCTCAAAAATCAAAGTTTGGTGTCAAAAGGAAGCAGGGTTATGTTCAAACAGAGAAAGCTGATCTTCCGCCTGAGCACCTGCGCAAAATTATGAAAGACAGGGGAGATATGTCTTCTAGGAAGTTTCGTGCTGATAAACGTTCCTATTTGGGCGCTTTGAAGTACTTGCCACATGCTGTGCTAAAATTGCTTGAGAACATGCCAATGCCTTGGGAAGAATACAGGGAGGTCAAGGTTTTATATCATGTAACCGGTGCTATAACTTTTGTAAACGAGAGTCCTCGCGTAATTGAACCGCATTTTATTGCTCAATGGGGAACGATGTGGATGATGATGAGACGCGAGAAGCGTGATCGAAAAAATTTTAAGCGTTTGCGGTTTCCTCCTTTTGACGATGAAGAGCCACCATTTTCTATTGATCAATTGCTTGATTTAGAGCCGTTAGAGGCTATTAGAATGGACTTAGATGAAGAAGATGACGCTCCTGTTATGGATTGGTTTTACGAAAATAAGGCTTTGGAAGATACTCCCCATGTAAATGGTCCAACCTATCGTCGTTGGAAGCTTAATTTACCTCAGATGGCTAATTTACATCGTTTAGGTTACCAACTTTTGAGTGATTTACGCGATGATAATTACTTTTACTTGTTTAATGACAATAGTTTCTTTACGGCTAAAGCTTTGAACGTGGCTATCCCAGGAGGTCCGAAATTTGAACCTTTATACAAAGACGAAGCCCCAGAAATGGAAGATTGGAATGAATTTAATGACATTTATAAACTTATTATCCGACATCCCATTAAAACTGAATACCGGATAGCGTTTCCTTACCTTTATAATTCTAGAGCTCGAAGCGTTGCACTAAGTGAATACCACCAACCGTCTAATGTTTTCGTTCCTCCTGAGGATCCTGATCTTCCGGCTTTTTTTTGGGATCCCATAATAAACCCCATCACTTCCCGCCAACTCACTTTGCATGAACTAGATACCTCTCCCGAAGATTCTGCCATAGAAGAAGATCCTAATTTTGAAATCCCTTTCGATCCTTTCTTTCATTCCGAAGATATAGAATTTGAGCACACAGCCAGTGCTCTGATTTTATTGTGGGCACCCCATCCTTTTAATAAGCGATCTGGTGCGACTAAGCGTGCGCAAGATGTTCCACTGATAAAGCATTGGTATTTAGAGCATTGTCCTCCTAATCAGCCTGTTAAAGTTCGTGTGTCATATCAAAAACTTTTAAAATCCCATGTTATGAATAAGTTGCACATGGCGCATCCCAAATCGCACACCAATCGCAGCTTACTTAGACAGTTAAAAAATACTAAATTTTTTCAAAGTACTTCTATCGATTGGGTTGAAGCTGGTCTCCAAGTTTGTCGCCAAGGGTACAACATGCTGCAATTACTTATTCACAGAAAAGGGTTGACATATTTACATTTGGATTACAACTGTAATTTAAAACCTACAAAGACATTAACTACGAAGGAAAGAAAGAAATCTAGGTTTGGTAATGCATTTCACTTGATGCGCGAAATACTTCGCCTTACTAAATTAATTGTCGATTCTCATGTACAGTATCGTTTGGGAAACATTGACGCATATCAGCTAGCTGATGGATTACATTACATATTTAATCATGTTGGTCAACTTACGGGAATGTATCGTTATAAATATCGATTGATGCGGCAGATTCGTGCTTGCAAAGATTTCAAGCATCTTATTTATTATCGCTTCAACACTGGTCCTGTTGGCAAAGGTCCAGGTTGTGGGTTTTGGGCTCCCAGTTGGCGTGTATGGCTTTTCTTTCTACGCGGAATTGTTCCTTTGCTAGAGCGCTGGCTGGGCAATTTGCTTGCTAGACAATTTGAAGGCCGTCATTCTACAGGAGTGGCAAAACAAATAACCAAGCAGCGTGTCGATTCTCATCAAGATCTAGAATTGAGGGCTGCAGTGATGAATGATATTTTGGATATGATACCTGAAGGAATTCGCCAAGGCAAAAGCAAAACCATTTTGCAGCATCTTAGTGAAGCTTGGCGTTGTTGGAAGGCTAACATACCTTGGAAGGTTCCGGGTCTCCCTGCACCTATTGAGAATATGATTTTGAGATATGTGAAGTCAAAAGCAGATTGGTGGACCTCAGTCGCTCACTTCAATCGTGAACGTATTCGTCGAGGAGCTACTGTTGATAAAACCGTGGCGAAAAAGAATCTTGGCAGATTAACTAGGCTTTGGTTAAAAGCTGAACAAGAAAGGCAACATAATTATCTAAAAGATGGACCTTATGTAACTGCCGATGAGGCAGTTGCTATATATACTACTTTTGTACATTGGTTAGAAAGTAGGCGATTCCAACCTATTCCCTTTCCTCCACTTTCGTACAAACATGATACGAAACTTCTTGTTTTAGCACTTGAACGCTTAAAAGAAGCGTATTCGGTGAAGGGTCGCTTGAATCAATCCCAACGAGAGGAATTAGCATTAGTGGAACAAGCCTACGATAATCCACATGAGATGCTGTCCCAAATTAAAAGGCGTTTATTGACAATGCGTACTTTTAAAGAGGTAGGGATTGAGTTTATGGATATGTATTCTCACTTGATTCCTGTTTATTCTGTAGATCCGATGGAGAAAATTTGTGATGCTTATCTCGATCAATACCTTTGGTTTGAGGCCGATCGTCGACACCTATTTCCTTCCTGGGTAAAGCCTTCTGATTCAGAACCTCCACCTCTTCTTGTTTACAAATGGTGCCAAGGAATTAATAATCTTACAGATGTTTGGGAAACTTCCAACGGCGAATGTAACGTTTTAATGGAAACTAGGCTGTCTAAAGTATTTGAGAAAGTTGACTTAACACTTCTTAATAGACTGATGTCATTACTAATGGACACCAATTTAGCTTCCTACGCTAGTGCTAAAAACAACGTTGTTTTGTCATATAAGGATATGTCGCATACCAACTCGTATGGCCTAGTCCGTGGTTTACAATTTTCAAGTTTCATCTGGCAGTTTTATGGATTAGTGTTGGATTTACTAATACTTGGCCTTCAACGCGCTACAGAAATAGCTGGTCCTGCAGATGCACCGAATGATTTTCTACACTTCAAAGATCAGGCAACTGAGACCAGTCACCCTATTCGACTGTATACACGCTATATTGATAAAGTTTATATAATGTTTCGATTTACTGATGAAGAATCCCGTGATTTGATTCAACGATTTTTGAATGAAAATCCTGATCCCACAAACAGCAATGTTGTAAATTATTCTAAAGGTAAAAAAAATTGTTGGCCTCGAGATGCTCGTATGAGACTCATGAAACACGACGTGAATCTCGGACGTGCTGTCTTTTGGGAGATTCGTAATCGTTTACCTAGATCACTAACTACCCTTGAGTGGGAGGATACCTTTCCTAGTGTTTACAGCAAAGACAATCCTAATTTATTGTTCTCGATGACAGGATTCGAGGTTAGAATCCTTCCAAAGATCCGACAAAATGAAGAATTTTCTTTGAAGGATGGTGTATGGAATCTCACAGATAATCGTACGAAACAACGGACAGCGCAAGCTTTCATACGTGTTACGGAGGATGGTATAAATCAATTTGGAAACCGTATACGTCAGATTCTTATGTCCTCTGGTTCCACTACCTTTACCAAGATTGCTAATAAATGGAATACTGCTCTAATAGCTCTCATGACTTATTATAGGGAAGCCGCGATTTCTACGCCCGAGCTTCTAGATTTACTTGTTAAATGTGAATCGAAAATACAAACTCGAGTAAAAATTTCATTAAATTCTAAAATGCCTAGTCGCTTTCCTCCAGCCGTTTTCTACTCGCCTAAAGAACTTGGTGGATTAGGAATGCTTTCAATGGGTCATGTACTTATTCCACAATCTGATCTTAGATGGTCGAAACAAACTGATACTGGTATTACTCATTTTCGAAGTGGAATGACTACCAATGGAGAACATTTGATTCCAAACCTTTATCGTTATATTCAGCCATGGGAATCAGAGTTTATTGACTCTCAGCGTGTATGGGCTGAGTATGCAATGAAGAGACAAGAAGCTCTACAACAAAATCGTCGTTTAACTTTAGAGGATCTGGAAGATTCATGGGATCGAGGAATTCCTCGTATAAATACTCTATTTCAAAAAGATAGACACACATTGGCATATGATAAAGGATGGCGTGTTAGGACTGAGTTTAAGCAGTACCAGCTCCTTAAAAACAATCCATTCTGGTGGACGAGTCAAAGACATGATGGAAAATTATGGCAATTAAATAATTACCGAGTAGATGTCATTCAGGCTTTAGGTGGTGTCGAAGGTATTTTGGAGCATACGATGTTTAAAGCTACTGGATTTCCTTCATGGGAAGGTCTTTTTTGGGAAAAAGCATCTGGTTTTGAAGAATCCATGAAGTTCAAAAAGCTTACTAATGCTCAGCGTTCAGGTTTAAATCAAATCCCTAACCGTAGATTTACGCTTTGGTGGAGTCCCACTATCAATCGTGCTAACGTTTATGTCGGATTTCAAGTACAACTGGATTTGACTGGAATCATGATGCATGGCAAAATTCCAACCCTGAAGATTTCACTCATTCAAATTTTTCGTTCTCATTTATGGCAAAAAATTCATGAATCTGTTGTTTGGGATTTGTGTCAAGTGCTTGACCAAGAATTAGAGTCATTGCAAATTGAAACAGTCCAAAAAGAAACTATCCATCCTCGTAAAAGTTATAAAATGAATAGTTCTTGTGCAGATATCCTCCTTTTGGCTGCCTATAAATGGAACGTATCAAGGCCATC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Amino acid sequence:Length=2363bp
BlastP NCBI nr
MASLPPGNPPPPPPPPGFEPPSQPPPPPPPGYVKKRKNKTPAQSGNLEKQLNERARKWRASQKSKFGVKRKQGYVQTEKADLPPEHLRKIMKDRGDMSSRKFRADKRSYLGALKYLPHAVLKLLENMPMPWEEYREVKVLYHVTGAITFVNESPRVIEPHFIAQWGTMWMMMRREKRDRKNFKRLRFPPFDDEEPPFSIDQLLDLEPLEAIRMDLDEEDDAPVMDWFYENKALEDTPHVNGPTYRRWKLNLPQMANLHRLGYQLLSDLRDDNYFYLFNDNSFFTAKALNVAIPGGPKFEPLYKDEAPEMEDWNEFNDIYKLIIRHPIKTEYRIAFPYLYNSRARSVALSEYHQPSNVFVPPEDPDLPAFFWDPIINPITSRQLTLHELDTSPEDSAIEEDPNFEIPFDPFFHSEDIEFEHTASALILLWAPHPFNKRSGATKRAQDVPLIKHWYLEHCPPNQPVKVRVSYQKLLKSHVMNKLHMAHPKSHTNRSLLRQLKNTKFFQSTSIDWVEAGLQVCRQGYNMLQLLIHRKGLTYLHLDYNCNLKPTKTLTTKERKKSRFGNAFHLMREILRLTKLIVDSHVQYRLGNIDAYQLADGLHYIFNHVGQLTGMYRYKYRLMRQIRACKDFKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAPSWRVWLFFLRGIVPLLERWLGNLLARQFEGRHSTGVAKQITKQRVDSHQDLELRAAVMNDILDMIPEGIRQGKSKTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPAPIENMILRYVKSKADWWTSVAHFNRERIRRGATVDKTVAKKNLGRLTRLWLKAEQERQHNYLKDGPYVTADEAVAIYTTFVHWLESRRFQPIPFPPLSYKHDTKLLVLALERLKEAYSVKGRLNQSQREELALVEQAYDNPHEMLSQIKRRLLTMRTFKEVGIEFMDMYSHLIPVYSVDPMEKICDAYLDQYLWFEADRRHLFPSWVKPSDSEPPPLLVYKWCQGINNLTDVWETSNGECNVLMETRLSKVFEKVDLTLLNRLMSLLMDTNLASYASAKNNVVLSYKDMSHTNSYGLVRGLQFSSFIWQFYGLVLDLLILGLQRATEIAGPADAPNDFLHFKDQATETSHPIRLYTRYIDKVYIMFRFTDEESRDLIQRFLNENPDPTNSNVVNYSKGKKNCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWEIRNRLPRSLTTLEWEDTFPSVYSKDNPNLLFSMTGFEVRILPKIRQNEEFSLKDGVWNLTDNRTKQRTAQAFIRVTEDGINQFGNRIRQILMSSGSTTFTKIANKWNTALIALMTYYREAAISTPELLDLLVKCESKIQTRVKISLNSKMPSRFPPAVFYSPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDTGITHFRSGMTTNGEHLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYAMKRQEALQQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTEFKQYQLLKNNPFWWTSQRHDGKLWQLNNYRVDVIQALGGVEGILEHTMFKATGFPSWEGLFWEKASGFEESMKFKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIMMHGKIPTLKISLIQIFRSHLWQKIHESVVWDLCQVLDQELESLQIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLLAAYKWNVSRPSLLNDNRDVLDNTTTNKYWIDVQLRFGDYDSHDIERYTRAKFLDYSTDAQSMYPSPTGVLIGIDLCYNMHSAYGNWIPGMKPLIQQSMNKIMKANPALYVLRERIRKGLQLYASEPQEQYLSSSNYAELFSNQIQLFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKVIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPRQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNITIKGSELQLPFQAIIKLDKINDLILRATEPQMVLFNLYDDWLQSVSSYTAFSRLILILRALNVNTEKTKLILRPDKSIITKENHVWPNLDDQQWLDVEPKLRDLILADYAKKNNINVASLTNSEVRDIILGMTITAPSLQRQQIAEIEKQGRENAQVTAVTTKTTNVHGDEMVVTTTSAYENEKFSSKTEWRNRAISSISLPLRTKNIYVNSDNISETFPYTYILPQNLLRKFVTISDLRTQVAGYMYGKSPSDNPQIKEIRCIALVPQLGSIRNVQLPSKLPHDLQPSILEDLEPLGWIHTQSSELPYLSSVDVTTHAKILSSHPEWDTKAVTLTVSYIPGSISLAAYTVSKEGIEWGSKNMDINSDEAIGYEPSMAEKCQLLLSDRIQGFFLVPEEGVWNYNFNGASFSPKMTYSLKLDVPLPFFALEHRPTHVISYTELETNDRLEEDMPDAFA