Information | |
Gene name: | spp42 |
Databases ID: | DEG :DEG20090271 OrthoDB:EOG0937004M UniProt:- |
Organism: | Schizosaccharomyces pombe 972h- |
Function: | U5 snRNP complex subunit Spp42 |
Nucleotide sequence: | Length=7092bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGGCGTCGTTACCACCGGGGAATCCTCCTCCACCGCCTCCTCCGCCTGGATTTGAGCCTCCTTCACAGCCTCCACCTCCTCCACCTCCAGGTTATGTGAAGAAAAGAAAAAACAAGACTCCAGCACAGTCTGGAAATCTTGAAAAGCAACTTAACGAAAGAGCACGCAAATGGCGCGCTTCTCAAAAATCAAAGTTTGGTGTCAAAAGGAAGCAGGGTTATGTTCAAACAGAGAAAGCTGATCTTCCGCCTGAGCACCTGCGCAAAATTATGAAAGACAGGGGAGATATGTCTTCTAGGAAGTTTCGTGCTGATAAACGTTCCTATTTGGGCGCTTTGAAGTACTTGCCACATGCTGTGCTAAAATTGCTTGAGAACATGCCAATGCCTTGGGAAGAATACAGGGAGGTCAAGGTTTTATATCATGTAACCGGTGCTATAACTTTTGTAAACGAGAGTCCTCGCGTAATTGAACCGCATTTTATTGCTCAATGGGGAACGATGTGGATGATGATGAGACGCGAGAAGCGTGATCGAAAAAATTTTAAGCGTTTGCGGTTTCCTCCTTTTGACGATGAAGAGCCACCATTTTCTATTGATCAATTGCTTGATTTAGAGCCGTTAGAGGCTATTAGAATGGACTTAGATGAAGAAGATGACGCTCCTGTTATGGATTGGTTTTACGAAAATAAGGCTTTGGAAGATACTCCCCATGTAAATGGTCCAACCTATCGTCGTTGGAAGCTTAATTTACCTCAGATGGCTAATTTACATCGTTTAGGTTACCAACTTTTGAGTGATTTACGCGATGATAATTACTTTTACTTGTTTAATGACAATAGTTTCTTTACGGCTAAAGCTTTGAACGTGGCTATCCCAGGAGGTCCGAAATTTGAACCTTTATACAAAGACGAAGCCCCAGAAATGGAAGATTGGAATGAATTTAATGACATTTATAAACTTATTATCCGACATCCCATTAAAACTGAATACCGGATAGCGTTTCCTTACCTTTATAATTCTAGAGCTCGAAGCGTTGCACTAAGTGAATACCACCAACCGTCTAATGTTTTCGTTCCTCCTGAGGATCCTGATCTTCCGGCTTTTTTTTGGGATCCCATAATAAACCCCATCACTTCCCGCCAACTCACTTTGCATGAACTAGATACCTCTCCCGAAGATTCTGCCATAGAAGAAGATCCTAATTTTGAAATCCCTTTCGATCCTTTCTTTCATTCCGAAGATATAGAATTTGAGCACACAGCCAGTGCTCTGATTTTATTGTGGGCACCCCATCCTTTTAATAAGCGATCTGGTGCGACTAAGCGTGCGCAAGATGTTCCACTGATAAAGCATTGGTATTTAGAGCATTGTCCTCCTAATCAGCCTGTTAAAGTTCGTGTGTCATATCAAAAACTTTTAAAATCCCATGTTATGAATAAGTTGCACATGGCGCATCCCAAATCGCACACCAATCGCAGCTTACTTAGACAGTTAAAAAATACTAAATTTTTTCAAAGTACTTCTATCGATTGGGTTGAAGCTGGTCTCCAAGTTTGTCGCCAAGGGTACAACATGCTGCAATTACTTATTCACAGAAAAGGGTTGACATATTTACATTTGGATTACAACTGTAATTTAAAACCTACAAAGACATTAACTACGAAGGAAAGAAAGAAATCTAGGTTTGGTAATGCATTTCACTTGATGCGCGAAATACTTCGCCTTACTAAATTAATTGTCGATTCTCATGTACAGTATCGTTTGGGAAACATTGACGCATATCAGCTAGCTGATGGATTACATTACATATTTAATCATGTTGGTCAACTTACGGGAATGTATCGTTATAAATATCGATTGATGCGGCAGATTCGTGCTTGCAAAGATTTCAAGCATCTTATTTATTATCGCTTCAACACTGGTCCTGTTGGCAAAGGTCCAGGTTGTGGGTTTTGGGCTCCCAGTTGGCGTGTATGGCTTTTCTTTCTACGCGGAATTGTTCCTTTGCTAGAGCGCTGGCTGGGCAATTTGCTTGCTAGACAATTTGAAGGCCGTCATTCTACAGGAGTGGCAAAACAAATAACCAAGCAGCGTGTCGATTCTCATCAAGATCTAGAATTGAGGGCTGCAGTGATGAATGATATTTTGGATATGATACCTGAAGGAATTCGCCAAGGCAAAAGCAAAACCATTTTGCAGCATCTTAGTGAAGCTTGGCGTTGTTGGAAGGCTAACATACCTTGGAAGGTTCCGGGTCTCCCTGCACCTATTGAGAATATGATTTTGAGATATGTGAAGTCAAAAGCAGATTGGTGGACCTCAGTCGCTCACTTCAATCGTGAACGTATTCGTCGAGGAGCTACTGTTGATAAAACCGTGGCGAAAAAGAATCTTGGCAGATTAACTAGGCTTTGGTTAAAAGCTGAACAAGAAAGGCAACATAATTATCTAAAAGATGGACCTTATGTAACTGCCGATGAGGCAGTTGCTATATATACTACTTTTGTACATTGGTTAGAAAGTAGGCGATTCCAACCTATTCCCTTTCCTCCACTTTCGTACAAACATGATACGAAACTTCTTGTTTTAGCACTTGAACGCTTAAAAGAAGCGTATTCGGTGAAGGGTCGCTTGAATCAATCCCAACGAGAGGAATTAGCATTAGTGGAACAAGCCTACGATAATCCACATGAGATGCTGTCCCAAATTAAAAGGCGTTTATTGACAATGCGTACTTTTAAAGAGGTAGGGATTGAGTTTATGGATATGTATTCTCACTTGATTCCTGTTTATTCTGTAGATCCGATGGAGAAAATTTGTGATGCTTATCTCGATCAATACCTTTGGTTTGAGGCCGATCGTCGACACCTATTTCCTTCCTGGGTAAAGCCTTCTGATTCAGAACCTCCACCTCTTCTTGTTTACAAATGGTGCCAAGGAATTAATAATCTTACAGATGTTTGGGAAACTTCCAACGGCGAATGTAACGTTTTAATGGAAACTAGGCTGTCTAAAGTATTTGAGAAAGTTGACTTAACACTTCTTAATAGACTGATGTCATTACTAATGGACACCAATTTAGCTTCCTACGCTAGTGCTAAAAACAACGTTGTTTTGTCATATAAGGATATGTCGCATACCAACTCGTATGGCCTAGTCCGTGGTTTACAATTTTCAAGTTTCATCTGGCAGTTTTATGGATTAGTGTTGGATTTACTAATACTTGGCCTTCAACGCGCTACAGAAATAGCTGGTCCTGCAGATGCACCGAATGATTTTCTACACTTCAAAGATCAGGCAACTGAGACCAGTCACCCTATTCGACTGTATACACGCTATATTGATAAAGTTTATATAATGTTTCGATTTACTGATGAAGAATCCCGTGATTTGATTCAACGATTTTTGAATGAAAATCCTGATCCCACAAACAGCAATGTTGTAAATTATTCTAAAGGTAAAAAAAATTGTTGGCCTCGAGATGCTCGTATGAGACTCATGAAACACGACGTGAATCTCGGACGTGCTGTCTTTTGGGAGATTCGTAATCGTTTACCTAGATCACTAACTACCCTTGAGTGGGAGGATACCTTTCCTAGTGTTTACAGCAAAGACAATCCTAATTTATTGTTCTCGATGACAGGATTCGAGGTTAGAATCCTTCCAAAGATCCGACAAAATGAAGAATTTTCTTTGAAGGATGGTGTATGGAATCTCACAGATAATCGTACGAAACAACGGACAGCGCAAGCTTTCATACGTGTTACGGAGGATGGTATAAATCAATTTGGAAACCGTATACGTCAGATTCTTATGTCCTCTGGTTCCACTACCTTTACCAAGATTGCTAATAAATGGAATACTGCTCTAATAGCTCTCATGACTTATTATAGGGAAGCCGCGATTTCTACGCCCGAGCTTCTAGATTTACTTGTTAAATGTGAATCGAAAATACAAACTCGAGTAAAAATTTCATTAAATTCTAAAATGCCTAGTCGCTTTCCTCCAGCCGTTTTCTACTCGCCTAAAGAACTTGGTGGATTAGGAATGCTTTCAATGGGTCATGTACTTATTCCACAATCTGATCTTAGATGGTCGAAACAAACTGATACTGGTATTACTCATTTTCGAAGTGGAATGACTACCAATGGAGAACATTTGATTCCAAACCTTTATCGTTATATTCAGCCATGGGAATCAGAGTTTATTGACTCTCAGCGTGTATGGGCTGAGTATGCAATGAAGAGACAAGAAGCTCTACAACAAAATCGTCGTTTAACTTTAGAGGATCTGGAAGATTCATGGGATCGAGGAATTCCTCGTATAAATACTCTATTTCAAAAAGATAGACACACATTGGCATATGATAAAGGATGGCGTGTTAGGACTGAGTTTAAGCAGTACCAGCTCCTTAAAAACAATCCATTCTGGTGGACGAGTCAAAGACATGATGGAAAATTATGGCAATTAAATAATTACCGAGTAGATGTCATTCAGGCTTTAGGTGGTGTCGAAGGTATTTTGGAGCATACGATGTTTAAAGCTACTGGATTTCCTTCATGGGAAGGTCTTTTTTGGGAAAAAGCATCTGGTTTTGAAGAATCCATGAAGTTCAAAAAGCTTACTAATGCTCAGCGTTCAGGTTTAAATCAAATCCCTAACCGTAGATTTACGCTTTGGTGGAGTCCCACTATCAATCGTGCTAACGTTTATGTCGGATTTCAAGTACAACTGGATTTGACTGGAATCATGATGCATGGCAAAATTCCAACCCTGAAGATTTCACTCATTCAAATTTTTCGTTCTCATTTATGGCAAAAAATTCATGAATCTGTTGTTTGGGATTTGTGTCAAGTGCTTGACCAAGAATTAGAGTCATTGCAAATTGAAACAGTCCAAAAAGAAACTATCCATCCTCGTAAAAGTTATAAAATGAATAGTTCTTGTGCAGATATCCTCCTTTTGGCTGCCTATAAATGGAACGTATCAAGGCCATCCTTATTGAACGATAATCGCGATGTGCTTGACAACACTACCACCAACAAATATTGGATTGATGTACAACTTCGATTTGGAGATTATGATTCTCATGATATTGAACGTTATACTAGAGCTAAATTTTTGGATTATAGCACTGATGCTCAAAGCATGTATCCTTCACCGACCGGTGTCTTAATCGGCATTGATCTTTGTTACAATATGCATAGTGCATATGGTAACTGGATTCCTGGTATGAAACCATTAATTCAACAGAGCATGAACAAGATCATGAAAGCCAATCCAGCCTTATATGTGTTGCGTGAACGCATACGAAAAGGTCTTCAATTATATGCTTCTGAACCCCAAGAGCAGTATTTGTCCTCCTCAAATTATGCTGAACTCTTTAGTAATCAAATTCAATTATTCGTTGATGATACTAATGTTTATCGGGTTACCATTCATAAAACATTTGAAGGTAATTTGACTACGAAACCCATTAATGGTGCTATTTTTATATTCAATCCGAGAACTGGTCAATTGTTCTTAAAAGTTATTCATACGTCAGTTTGGGCGGGACAAAAACGATTGGGACAATTGGCGAAATGGAAGACTGCTGAAGAAGTTGCTGCTTTGATTCGTTCTCTGCCTGTTGAAGAACAACCTCGACAGATTATAGTAACTCGAAAGGGCATGTTGGATCCATTAGAAGTTCATCTTTTGGACTTTCCTAATATAACCATTAAGGGTAGTGAATTACAGCTTCCTTTCCAAGCGATTATTAAACTTGATAAAATCAATGATTTGATTTTACGTGCCACCGAACCGCAAATGGTACTTTTCAATTTATATGATGACTGGCTTCAATCGGTATCATCGTATACAGCTTTTTCACGCTTGATACTTATCTTGCGCGCATTGAATGTCAATACTGAGAAAACGAAGCTAATTCTTAGACCAGACAAGTCTATAATTACAAAAGAGAATCACGTGTGGCCCAACCTGGATGATCAACAATGGCTTGATGTTGAACCGAAACTTAGAGATTTGATCCTTGCTGATTATGCTAAGAAAAACAATATTAACGTTGCTAGTCTTACGAACTCGGAAGTGCGAGATATTATTCTCGGTATGACAATAACGGCTCCTTCTCTTCAACGTCAACAGATAGCTGAAATAGAAAAGCAAGGCCGTGAGAATGCCCAAGTTACGGCTGTCACCACAAAAACTACTAACGTGCATGGTGATGAAATGGTGGTTACTACAACATCTGCGTATGAAAATGAAAAGTTTTCTAGTAAAACAGAATGGAGAAATCGTGCCATATCATCTATCAGTTTACCCCTTCGTACAAAAAACATTTATGTTAACTCTGATAATATCAGCGAAACTTTTCCTTATACATACATTCTTCCTCAAAATCTGCTTCGTAAGTTTGTTACGATATCCGATTTAAGGACACAGGTTGCCGGATATATGTATGGTAAAAGTCCGTCAGACAACCCTCAAATTAAGGAAATTCGTTGTATTGCACTTGTACCACAGCTTGGCAGTATAAGAAATGTGCAGCTTCCTTCTAAACTGCCTCATGATCTTCAGCCTTCTATATTAGAAGACCTTGAGCCCCTTGGTTGGATACACACTCAAAGTTCTGAACTTCCCTATTTATCATCTGTCGATGTAACTACACATGCAAAAATTTTATCTTCTCATCCTGAATGGGATACCAAAGCTGTAACTTTGACAGTGAGCTACATTCCTGGTTCGATATCCTTAGCTGCATATACTGTGTCAAAGGAAGGAATTGAGTGGGGATCAAAAAACATGGATATCAACAGTGATGAAGCTATCGGGTATGAACCTTCTATGGCTGAAAAATGTCAGCTGCTATTGTCCGATAGAATTCAAGGATTTTTCTTGGTACCAGAAGAGGGCGTATGGAATTATAATTTCAATGGTGCAAGCTTCAGTCCTAAAATGACGTACAGTTTAAAACTTGATGTCCCTCTGCCATTCTTTGCTTTAGAGCATAGACCTACTCATGTAATAAGCTATACTGAACTGGAGACGAATGACAGATTAGAGGAAGATATGCCAGATGCATTTGCATGA | |
Amino acid sequence: | Length=2363bp |
BlastP NCBI nr
MASLPPGNPPPPPPPPGFEPPSQPPPPPPPGYVKKRKNKTPAQSGNLEKQLNERARKWRASQKSKFGVKRKQGYVQTEKADLPPEHLRKIMKDRGDMSSRKFRADKRSYLGALKYLPHAVLKLLENMPMPWEEYREVKVLYHVTGAITFVNESPRVIEPHFIAQWGTMWMMMRREKRDRKNFKRLRFPPFDDEEPPFSIDQLLDLEPLEAIRMDLDEEDDAPVMDWFYENKALEDTPHVNGPTYRRWKLNLPQMANLHRLGYQLLSDLRDDNYFYLFNDNSFFTAKALNVAIPGGPKFEPLYKDEAPEMEDWNEFNDIYKLIIRHPIKTEYRIAFPYLYNSRARSVALSEYHQPSNVFVPPEDPDLPAFFWDPIINPITSRQLTLHELDTSPEDSAIEEDPNFEIPFDPFFHSEDIEFEHTASALILLWAPHPFNKRSGATKRAQDVPLIKHWYLEHCPPNQPVKVRVSYQKLLKSHVMNKLHMAHPKSHTNRSLLRQLKNTKFFQSTSIDWVEAGLQVCRQGYNMLQLLIHRKGLTYLHLDYNCNLKPTKTLTTKERKKSRFGNAFHLMREILRLTKLIVDSHVQYRLGNIDAYQLADGLHYIFNHVGQLTGMYRYKYRLMRQIRACKDFKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAPSWRVWLFFLRGIVPLLERWLGNLLARQFEGRHSTGVAKQITKQRVDSHQDLELRAAVMNDILDMIPEGIRQGKSKTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPAPIENMILRYVKSKADWWTSVAHFNRERIRRGATVDKTVAKKNLGRLTRLWLKAEQERQHNYLKDGPYVTADEAVAIYTTFVHWLESRRFQPIPFPPLSYKHDTKLLVLALERLKEAYSVKGRLNQSQREELALVEQAYDNPHEMLSQIKRRLLTMRTFKEVGIEFMDMYSHLIPVYSVDPMEKICDAYLDQYLWFEADRRHLFPSWVKPSDSEPPPLLVYKWCQGINNLTDVWETSNGECNVLMETRLSKVFEKVDLTLLNRLMSLLMDTNLASYASAKNNVVLSYKDMSHTNSYGLVRGLQFSSFIWQFYGLVLDLLILGLQRATEIAGPADAPNDFLHFKDQATETSHPIRLYTRYIDKVYIMFRFTDEESRDLIQRFLNENPDPTNSNVVNYSKGKKNCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWEIRNRLPRSLTTLEWEDTFPSVYSKDNPNLLFSMTGFEVRILPKIRQNEEFSLKDGVWNLTDNRTKQRTAQAFIRVTEDGINQFGNRIRQILMSSGSTTFTKIANKWNTALIALMTYYREAAISTPELLDLLVKCESKIQTRVKISLNSKMPSRFPPAVFYSPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDTGITHFRSGMTTNGEHLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYAMKRQEALQQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTEFKQYQLLKNNPFWWTSQRHDGKLWQLNNYRVDVIQALGGVEGILEHTMFKATGFPSWEGLFWEKASGFEESMKFKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIMMHGKIPTLKISLIQIFRSHLWQKIHESVVWDLCQVLDQELESLQIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLLAAYKWNVSRPSLLNDNRDVLDNTTTNKYWIDVQLRFGDYDSHDIERYTRAKFLDYSTDAQSMYPSPTGVLIGIDLCYNMHSAYGNWIPGMKPLIQQSMNKIMKANPALYVLRERIRKGLQLYASEPQEQYLSSSNYAELFSNQIQLFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKVIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPRQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNITIKGSELQLPFQAIIKLDKINDLILRATEPQMVLFNLYDDWLQSVSSYTAFSRLILILRALNVNTEKTKLILRPDKSIITKENHVWPNLDDQQWLDVEPKLRDLILADYAKKNNINVASLTNSEVRDIILGMTITAPSLQRQQIAEIEKQGRENAQVTAVTTKTTNVHGDEMVVTTTSAYENEKFSSKTEWRNRAISSISLPLRTKNIYVNSDNISETFPYTYILPQNLLRKFVTISDLRTQVAGYMYGKSPSDNPQIKEIRCIALVPQLGSIRNVQLPSKLPHDLQPSILEDLEPLGWIHTQSSELPYLSSVDVTTHAKILSSHPEWDTKAVTLTVSYIPGSISLAAYTVSKEGIEWGSKNMDINSDEAIGYEPSMAEKCQLLLSDRIQGFFLVPEEGVWNYNFNGASFSPKMTYSLKLDVPLPFFALEHRPTHVISYTELETNDRLEEDMPDAFA |