Information | |
Gene name: | nuc1 |
Databases ID: | DEG :DEG20090875 OrthoDB:EOG093700VG UniProt:- |
Organism: | Schizosaccharomyces pombe 972h- |
Function: | DNA-directed RNA polymerase I complex large subunit Nuc1 |
Nucleotide sequence: | Length=5070bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGAATATTGCACAGCCAGTCTCTTCGGAGATTAAAAGTGTGAAGTTTGGGATTTACGATGTTGACGATGTCGAAAAAATATCCGTCAAACAAATCGTAAATCCCGTTTTGCTTGACAATTTAAATCACCCTACTAACGGCGGATTATATGACCTTGCTTTGGGTCCATATCTAAAAAATTCTGTTTGCGCTACATGTCATTTGGATGAAAGATACTGCCCTGGTCATTTTGGTCATATAGTACTTCCTATTCCTGCATATCACCCTCTATTTTTTTCTCAAATGTACAATTTATTACGTTCAACTTGCTTGTACTGCCATCATTTCAAGCTTTCAAAAGTCAAGGTTCATCTTTTCTTTTGTAGACTCAAGTTGCTTGATTATGGTCTTTTAAATGAGTCAGAGATGGTGGAGAATGTCAGTCTTACTGAGGCAATCATAAAGAATTCTAACGGCACTCCACTTGAAGATGGAAGTGACAGCGAGGACAGTGGTCTTGGACACGATGATATTGCTAAAGATGCTGCAACACTTATGCGCATTCGCGATGAATTCGTTGCTAAGTCTATTGCTGACTCACGCCAGAACGCTCATATCGATGCTCAGTTGACTACACTTCTTTTACACGAGAGGAAAAAAGTTGTGCGTGCCTTCTACCATGCCATTTCATCTCGCAAACAATGTGATAATTGCCAGTCTTTTTCCCCTAACTTTAGGAAAGAAGGCTTTGCTAAAATATTCGAGATTCCATTGAGTGGAAAAAATCTCCAATTTATGGAGCAAACCGGAAAAATTCGTTCTGACGTTCTTCGTGATACTAGTAAAAAGCATCATGAAGATGAGGGATATGATGGAGATTCTGATTCGAGTAATGAAAGTGAAGTAGAAGGAATAGATCTCTTTGAAGAAGATCCTAATCCTTTGAAAAATAAATCAAAATCTCCAATTGCTCATGGAGCCAAATATATGACTTCTACTGAAGTCCGTAACCATCTTCGCCGTCTTTTTGTAAAAGAAAATGTTGTCCTTTCTCGTCTTTATGCTCATAAACGCGGAAAACCTGCCTCTGCTGATATGTTTTTCCTCCAAAATATTGCTGTTCCTCCTACTCGCTTCCGTCCAGCTTCCAAAATGGGCGATGAAGTACATGAAAATATCCAAAATGAACTTCTGACCAGAATTTTACAATCCTCAATACAAATTGCTTCTCTCTCTAAAGACTCTACAGTTGAAGTAAATCCTGATGAGAAAGAAGGCTTGGAGCGTCGTTCTCGTGCTTTTGAACTGTTGATTAACGCTTTTGTTCAACTACAACACGATGTAAACAGCCTGATTGATAGTAATAGGAATCCTAGTTCTGGAGGACAGAGTAGAACAGTACCCCCGGGTATTAAGCAAATTTTGGAAAAGAAGGAGGGTCTTTTCCGTAAGCATATGATGGGTAAACGTGTGAATTATGCAGCTAGATCTGTCATTTCACCTGACCCGAACATTGAAACTAATGAAATCGGTGTTCCGCCAGTCTTTGCTACTAAACTCACATACCCAGAACCAGTAACTCTTTACAACTTTAACGAGATGAGAAATGCGGTTATTAATGGTCCCCATAAATGGCCTGGTGCTAGTCATATTCAAAACGAAGACGGCACTTTAATTTCTTTAATGCCTTTAACAATTGAACAACGCACTGCTTTAGCCAACCAGCTTCTTACACCTCAAAGCAATTTAATATCTTCCCCATATTCTTATTCTCGCTTAATAAATACTAACAAAAAGGTTTATCGTCATGTCAGAAATGGAGACATGTTGATATTGAACCGTCAACCCACCCTTCATAAGCCTTCGATGATGGCTCATAAAGCTCGTATTCTTCCAGGTGAGAAGACGATTAGAATGCATTACGCAAATTGCAACTCTTACAATGCTGATTTCGATGGCGACGAAATGAACATGCATTTTCCACAAAGTACCAATGCGCGTTCTGAGGCTCAATTTATTGCAAACACAGACTCTCAATATTTGGTGCCTACCTCTGGTGATCCTTTGCGCGGTCTTATTCAAGACCATGTCGTAATGGGTGTTTGGCTTACCTGTAAAGATACATTTTATACTCGAGATGAATATCAGCAACTTCTATTTCAGGCTTTAAAGCCTGATGAAACCGGTATGTATGGGCGTATCAAAACTCTTCCTCCTGCCATACAACGTCCGGGTATATACTGGACAGGTAAACAAATAATATCTTCTGTTTTGCTCAACCTAAAACCCAGTGATCGTCCTGGTCTTAATCTTAAAAGCAAAGCAAAGGTTCCAGGAAAATACTGGTCACCTGACTCAGAGGAGGGATCAGTATTATTTGATGATGGTGAACTTTTATGCGGTATTCTTGATAAGTCCTCTTTTGGTGCCTCGGCTTTTGGCTTAGTTCACTCAGTTCATGAATTGTACGGTCCTGACATCGCTGGTCGCTTGCTTTCTGTTTTAAGTCGTCTATTCACTGCGTATGCTCAAATGCGGGGCTTTACTTGCCGTATGGATGATTTGAGACTTGATGAGCAAGGTGATAATTGGAGAAGACAACTATTGGAAAACGGAAAATCCTTTGGACTTGAAGCTGCCAGTGAATATGTTGGCCTTTCAACAGATTCGCCAATTGCGCTTTTGAACGCTAACCTTGAGGAAGTTTACAGAGATGATGAGAAGTTACAAGGTTTAGATGCTGCTATGAAAGGTAAAATGAACGGGCTTACTTCCTCAATTATCAACAAATGTATCCCTGATGGTTTACTTACAAAATTCCCCTATAATCATATGCAAACTATGACCGTTTCTGGTGCCAAGGGTAGCAACGTAAACGTCTCACAGATTTCTTGTCTTTTGGGTCAACAGGAATTAGAAGGACGTCGTGTTCCTCTTATGGTGAGCGGAAAGTCACTTCCTTCCTTTGTTCCATATGAAACTTCTGCTAAGTCTGGTGGTTTTATTGCCAGCAGATTTTTAACTGGTATCGCCCCTCAGGAGTATTATTTTCACTGTATGGCTGGCCGTGAAGGCTTGATTGATACCGCTGTTAAAACCAGTCGGTCTGGTTATCTTCAGCGTTGTCTGATGAAGCATCTGGAAGGTTTATGTGTACAATATGATCATACTGTTCGCGATTCCGATGGATCTATCGTCCAATTCCATTACGGAGAAGATTCTTTAGATGTCACAAAACAGAAGCACTTGACACAATTTGAGTTTTCAGCCAAAAATTATAAATCCTTAATTCAGAAATACAAGGTCAAATCTGTCTTATCGGCGGTTGATTCCGAAACTGCATCCTCTTACGCGAAGAAAGCGTTGAAAAAGCCGTACAAATATGATCCAGTATTGGACAAGTATCCCCCTAGTCGATATTTGGGAAGCGTAAGCGAGAAGTTTCAACGTGCTGTTGATGAATATACCCAGAAAAATCCGGACAAGTTGATTGCTTCGAAGAAAGAGAGCAAGCTTGATGATTCTCTTCTTAATGAATCAAAGTTCAAGGCATTGATGCAGTTACGTTACCAACAGTCTCTGGTTGATCCTGGTGAAAGTGTTGGTGTATTAGCTAGTCAATCAATCGGTGAGCCATCTACTCAAATGACTTTGAACACATTCCATTTTGCTGGATTCGGTGCTAAGAATGTCACATTAGGTATTCCTCGTTTACGTGAGATTATCATGACCGCTAGTGCAAATATTCAAACTCCTACGATGACTCTTCGTTTGAATGACGGCGTTTCCGATAAAAGAGCTTCAGCTTTTTGTAAAGAAGTAAATAAATTGGTTTTATCTGAAGTTGTTCGACAAGTCCGAGTAACTGAAAAAATTTCTGGTCAAGGCTCTGACGAACAATCTAAAACTTATGCTATTCGACTTGATTTATATTCTCGTGATGAATATCAGGATGAATATGGTGTTCTTCAGGAAGAGATTGAGTCGACCTTTAGTAATAGATTCTTAAAAATTCTTAACCGAATTATTAAAAGCTATTTGGCTAAATCTAAGCAGCGGAAGTCAGGAGGTAAAGATGATACAGTACCTGAGGTTGGTCAGGCATTAAAGCCACTTGAAGATATCGATGAAGCACCCATTGAAGGTCGTGCTCAAGAAGCTCTCGAAGATGAAGACAATGATGCTACCAATGAGAAAATGGTCTCTAGGTCGAAACAGCATGCTTCTTATGAGGGGCCTGATGAGGCAGACAAAGTCGCCCTTCGTCAGCTAAAAGGATCAAATAAAGTTGAAGACGTAAACATGGATGAAGAGGAAGATGAGGGTTTCAAGTCCGATGAAAGTGTCTCTGATTTTAAAGAAAGGAAATTGTTGGAAAAGCAGAACACAGTTTCCATTTCGGAAAGGCGGGAACTTCAGTTAAAGACAGCAAAAGAAATACTCAGCAATTGCAAACACCTCGACTTTGATTACGTTAACGGTGAGTGGGCAACTGTTGAATTGGTGTTCCCAATCAATACTGAAAAGCTATTAATGGTGTCACTTGTGGAAAAGGCATGTTCCGAAACTGTCATACACGAAATTCCGGGCATTACACGCTGTTTTTCCAAACCTCCAGACTCTGCCTTAGACACTGTTCCGAAGGTTATCACTGAAGGTGTCAATCTGAAAGCAATTTGGGAATTTTACAATGAAATCTCCATGAATGATATTTACACAAATGATATTGCAGCGATCCTTAGGATATACGGTGTTGAAGCAGCTCGTAATGCGATTGTTCATGAGGTTTCCTCCGTTTTTGGAGTGTATGGTATTGCTGTTGATCCTCGTCATCTTTCCTTAATTGCAGATTATATGACTTTCGAGGGAGGATACAAAGCCTTCAATAGAATGGGAATAGAATATAACACTTCTCCATTTGCGAAAATGTCTTTTGAGACCACTTGTCACTTTTTGACTGAGGCCGCCCTCCGTGGTGATGTTGATGACTTATCCAATCCTTCATCTCGGTTAGTCGTTGGTCGAGTCGGTAACTTTGGCACCGGTTCTTTTGACATATTCACCCCTGTAGTCGATTCTCCTGCAAACTAA | |
Amino acid sequence: | Length=1689bp |
BlastP NCBI nr
MNIAQPVSSEIKSVKFGIYDVDDVEKISVKQIVNPVLLDNLNHPTNGGLYDLALGPYLKNSVCATCHLDERYCPGHFGHIVLPIPAYHPLFFSQMYNLLRSTCLYCHHFKLSKVKVHLFFCRLKLLDYGLLNESEMVENVSLTEAIIKNSNGTPLEDGSDSEDSGLGHDDIAKDAATLMRIRDEFVAKSIADSRQNAHIDAQLTTLLLHERKKVVRAFYHAISSRKQCDNCQSFSPNFRKEGFAKIFEIPLSGKNLQFMEQTGKIRSDVLRDTSKKHHEDEGYDGDSDSSNESEVEGIDLFEEDPNPLKNKSKSPIAHGAKYMTSTEVRNHLRRLFVKENVVLSRLYAHKRGKPASADMFFLQNIAVPPTRFRPASKMGDEVHENIQNELLTRILQSSIQIASLSKDSTVEVNPDEKEGLERRSRAFELLINAFVQLQHDVNSLIDSNRNPSSGGQSRTVPPGIKQILEKKEGLFRKHMMGKRVNYAARSVISPDPNIETNEIGVPPVFATKLTYPEPVTLYNFNEMRNAVINGPHKWPGASHIQNEDGTLISLMPLTIEQRTALANQLLTPQSNLISSPYSYSRLINTNKKVYRHVRNGDMLILNRQPTLHKPSMMAHKARILPGEKTIRMHYANCNSYNADFDGDEMNMHFPQSTNARSEAQFIANTDSQYLVPTSGDPLRGLIQDHVVMGVWLTCKDTFYTRDEYQQLLFQALKPDETGMYGRIKTLPPAIQRPGIYWTGKQIISSVLLNLKPSDRPGLNLKSKAKVPGKYWSPDSEEGSVLFDDGELLCGILDKSSFGASAFGLVHSVHELYGPDIAGRLLSVLSRLFTAYAQMRGFTCRMDDLRLDEQGDNWRRQLLENGKSFGLEAASEYVGLSTDSPIALLNANLEEVYRDDEKLQGLDAAMKGKMNGLTSSIINKCIPDGLLTKFPYNHMQTMTVSGAKGSNVNVSQISCLLGQQELEGRRVPLMVSGKSLPSFVPYETSAKSGGFIASRFLTGIAPQEYYFHCMAGREGLIDTAVKTSRSGYLQRCLMKHLEGLCVQYDHTVRDSDGSIVQFHYGEDSLDVTKQKHLTQFEFSAKNYKSLIQKYKVKSVLSAVDSETASSYAKKALKKPYKYDPVLDKYPPSRYLGSVSEKFQRAVDEYTQKNPDKLIASKKESKLDDSLLNESKFKALMQLRYQQSLVDPGESVGVLASQSIGEPSTQMTLNTFHFAGFGAKNVTLGIPRLREIIMTASANIQTPTMTLRLNDGVSDKRASAFCKEVNKLVLSEVVRQVRVTEKISGQGSDEQSKTYAIRLDLYSRDEYQDEYGVLQEEIESTFSNRFLKILNRIIKSYLAKSKQRKSGGKDDTVPEVGQALKPLEDIDEAPIEGRAQEALEDEDNDATNEKMVSRSKQHASYEGPDEADKVALRQLKGSNKVEDVNMDEEEDEGFKSDESVSDFKERKLLEKQNTVSISERRELQLKTAKEILSNCKHLDFDYVNGEWATVELVFPINTEKLLMVSLVEKACSETVIHEIPGITRCFSKPPDSALDTVPKVITEGVNLKAIWEFYNEISMNDIYTNDIAAILRIYGVEAARNAIVHEVSSVFGVYGIAVDPRHLSLIADYMTFEGGYKAFNRMGIEYNTSPFAKMSFETTCHFLTEAALRGDVDDLSNPSSRLVVGRVGNFGTGSFDIFTPVVDSPAN |