Information | |
Gene name: | rpc1 |
Databases ID: | DEG :DEG20090664 OrthoDB:EOG093700ID UniProt:- |
Organism: | Schizosaccharomyces pombe 972h- |
Function: | DNA-directed RNA polymerase III complex large subunit Rpc1 (predicted) |
Nucleotide sequence: | Length=4218bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGAAAGATCCTATTGATGATCAGATTCCTAAGAGGATAAAGCATCTTCAGTTTGGAATTAATGGTCCAGAAGAATTTGTTAAAGATGGAACCGTAGAAGTTTCTAGGAGAGATCTGTATACGATGACAGACCGATCACCAGCAGAACATGGTGCTTTAGATTTACATATGGGTACCAGCAATAAGCAAATTAATTGTGCTACTTGTGGTGAATCAATGGCTGATTGTATGGGTCATTTTGGTTATGTTAAGCTTGCTTTACCCGTTTTTCACATAGGATACTTCAAGGCTACGTTGACCATTTTACAAAATATATGTAAGGATTGTTCTTCAGTTCTTCTATCAGACCAAGAAAAACGCCAATTTTTGAAGGACTTGAGACGTCCTGGCATTGATAATCTGCGTCGGTCACAGATATGTAAGAGAATTAATGATCATTGCAAAAAAATGCGCCGCTGTTCTAAATGCGACGCAATGCAAGGTGTGGTAAAAAAGGCTGGTCCTTTGAAAATAATTCACGAAAGATTTCGGTATGTTCGCAAATCACAAGATGACGAGGAAAATTTTCGACACTCGTTCGATGAAGCTTTGAAAACTATACCCGAACTGAAAATGCATCTCTCAAAAGCCCATGATGATTTAAATCCTTTAAAGGTTTTAAATCTTTTCAAACAAATTACTCCAGTTGATTGTGAGCTACTGGGAATGGATCCTGAACATGGTCGTCCAGAAAATTTACTTTGGCGTTACGTTCCTGCTCCTCCTGTTTGCATCCGTCCTTCGGTAGCCCAAGAGGGTGCTACCACTGAAGATGATTTAACCGTAAAAATCACTGAAATTATTTGGACTAGTTCGCTAATTCGTGCCGCCTTAAGTAAAGGCACTCCTATTAGTAATTTAATGGAACAATGGGAATTTATGCAACTATCCATTGCAATGTATATTAATAGTGAGATGCCAGGTCTCCGTCCTTCTGACATGCCCTCAAAGCCCATTCGGGGGTTTTGTCAACGTCTTAAGGGTAAACAGGGTAGATTTCGTGGTAATTTGTCGGGAAAGCGTGTAGACTTTTCCGGCAGAACAGTTATTAGCCCGGATCCTAATTTACGAATTGATCAAGTTGCCGTTCCATATCGCATTGCTAAAATTTTGACATTTCCCGAAAGAGTCACAACTCAAAACAAGAAGCACTTACAGGATTGCATCAGAAATGGGCCCGATGTGCATCCAGGTGCAAACTATGTTATAGATCGAGAAAGCGGGTTTAAGCGCTTTTTGAGGTTTGGCAATAGAAACCGTATTGCTGATGATTTGAAAATTGGTGATATCGTTGAGCGTCATCTACATGATAACGATGTAGTTTTGTTCAATCGTCAACCTTCACTCCATAAGTTATCAATCATGGCTCACTTGGTAAAGGTACGACCATGGCGTACCTTAAGATTTAATGAATGTGTATGCGGTCCCTACAATGCCGATTTTGATGGCGATGAAATGAATTTACATGTTCCTCAAACTGAGGAGGCAAAGACAGAAGCCTTGGAGTTGATGGGCATTAAAAACAATCTTGTAAGTCCCAGAAACGGTGAGCCCATTATTGCAGCAACTCAAGATTTCATTACAGCTGCCTATTTGCTTTCTTTAAAAGATACGTTTTTAGATCGTAAAAGTATCTCGAATATATGTTGTTATATGATGGATGCTTCGACTCATATTGATTTACCTCCACCTGCCATTATTAAACCTCGCTGTTTATGGACTGGAAAACAAGTGTTTACAGTATTGATGAAACCTAATAGATTTAGCAAAGTTTTGGTAAATCTGGATGCTAAAACTCGATCCTTCTCTCGAATTAAGTCAAAGACCCCTGAGATGTGTCCCAAAGATGGATATTTAATGATTAGAAATAGCGAAATTATAGCTGGTGTTGTTGATAAATCAGTTGTTGGCGATGGCAAGAAGGATTCACTATTTTATGTGATTTTGCGGGATTATGGAGCACTAGAGGCAGCCGAGGCAATCACTAGGCTTTCCAAAATGTGTGCTAGATTTTTAGGTAATCGAGGATTTTCCATAGGTATTGAGGATGTTCAACCTGGCAAAAGTCTTTCTTCTCAAAAAGAAATATTGGTCAACAAAGCCTATGCTACTTCTGATGATTTCATTATGCAGTATGCAAAGGGAATCCTTGAATGCCAACCAGGAATGGATCAGGAGGCCACGCTTGAAGCAAAAATTTCCTCGACACTTTCCAAAGTTCGTGACGATGTCGGAGAAATTTGTATGGATGAATTGGGTCCTGCTAATTCACCTCTGATTATGGCTACCTGTGGTTCCAAGGGTTCAAAGATTAACGTTTCTCAAATGGTTGCTTGTGTCGGTCAACAGATTATTAGTGGTAAACGTGTTCCAGATGGTTTCCAAGATAGATCACTTCCTCATTTCCATAAGAATTCAAAGCATCCGTTAGCTAAAGGATTTGTAAGTAATAGTTTTTACAGTGGATTGACACCTACTGAGTTTCTATTTCACGCTATCTCTGGGCGAGAAGGTCTCGTAGATACTGCAGTCAAAACCGCCGAAACTGGTTACATGTCACGTCGATTAATGAAATCGTTGGAGGATTTATCTTCTGCGTACGATGGTACTGTTCGAAGCTCAAATAGTGATGTTGTACAGTTTGTTTATGGTGATGATGGGTTGGATCCAACGTATATGGAGGGAGATGGTCAAGCTGTCGAATTTAAACGTACGTGGATCCACTCTGTCAATTTGAATTACGATAGACACGACTCTGCGATGTTGCCATATGAAATTATAGATTATGTTAATCGGGCCCTTGATGATCCAAAGTTTCTGACCAATTGCAACAGAGATTTTATTGAAACTATACGTACATTTGTTATAGAAAATATCGCAAAGTATTTGGCTTCTGTTCGTGAGCGTCGTGACCTCGCCCCCATGCTTGAAGAACCAGACATGGATGACCTGGATGACATGGAAGGGGATGAATTTGCACCCGTTGCGAAAAGAAAATCTGTTGAGAACATTATCAGGGTGACTGAGAAGCAGCTACGCTCATTTGTAGACCGTTGTTGGGAAAAGTATATGCGTGCCAAGGTAGAGCCTGGTACGGCTGTTGGTGCCATTGGTGCTCAGTCCATTGGTGAGCCTGGTACTCAGATGACTCTTAAAACTTTCCATTTTGCTGGTGTTGCTGCCCAAACTACTCTAGGTGTACCTCGCATCAAAGAAATTATTAACGCTGCCAAAACAATTAGTACTCCCATTATCACCGGACAGCTTATCAATGATCGTGACGAAAGATCTGCACGTGTCGTTAAAGGTCGTATTGAGAAGACATACCTGAAAGACGTTACTAGTTATATTGAGGAAGTTTATGGTCCGGTCACTACTTACTTATCTATACAAGTAAATTTTGATACTATTTCGAAGTTGCAGCTAGATATTACATTAGCTGATATTGCCGCAGCAATTTGGAATACTCCAAAACTTAAGATTCCATCTCAACAAGTCACTGTTAACAACACACTTCAGCAGATTCACGTTCACACCTCTTCCGATGGGAAGAGTAGCGAAACAGAAGTTTATTACAGATTGCAAACGTATAAGCGCGTTTTACCAGATGTTGTAGTTGCTGGAATACCGACCATTAATCGTTCGGTTATCAATCAAGAATCCGGTAAAATTGAGCTCTTCATGGAAGGTACCGGTTTACAGGCTGTAATGAATACAGAAGGGATTGTGGGAACGAAAACTAGTACTAATCATGTAATGGAAATGAAGGATGTCCTAGGTATTGAAGCCGCCCGTTACTCCATTATCTCTGAGATTGGGTATACGATGGCCAAACATGGTCTTACAGTTGATCCTCGACACATTATGCTTCTTGGTGATGTGATGACATGTAAAGGTGAGGTTTTGGGAATTACGAGGTTTGGTGTCGCAAAGATGAAAGATAGTGTTTTAGCACTTGCATCGTTTGAAAAGACTACGGACCATTTGTTTAATGCTGCTGCGAGGTTTGCAAAAGATTCTATCGAAGGCATAAGTGAATGCATTGTCCTCGGTAAACTGGCTCCTATTGGCACGAATGTCTTTCAGCTTATTAGAAGAACAGAAGAAGAAGAAGAGCAAAAACCGAAAGAACTATTGTTTGATACTCCATCTCTTCATCAATTGGAAATTACGGCTTAA | |
Amino acid sequence: | Length=1405bp |
BlastP NCBI nr
MKDPIDDQIPKRIKHLQFGINGPEEFVKDGTVEVSRRDLYTMTDRSPAEHGALDLHMGTSNKQINCATCGESMADCMGHFGYVKLALPVFHIGYFKATLTILQNICKDCSSVLLSDQEKRQFLKDLRRPGIDNLRRSQICKRINDHCKKMRRCSKCDAMQGVVKKAGPLKIIHERFRYVRKSQDDEENFRHSFDEALKTIPELKMHLSKAHDDLNPLKVLNLFKQITPVDCELLGMDPEHGRPENLLWRYVPAPPVCIRPSVAQEGATTEDDLTVKITEIIWTSSLIRAALSKGTPISNLMEQWEFMQLSIAMYINSEMPGLRPSDMPSKPIRGFCQRLKGKQGRFRGNLSGKRVDFSGRTVISPDPNLRIDQVAVPYRIAKILTFPERVTTQNKKHLQDCIRNGPDVHPGANYVIDRESGFKRFLRFGNRNRIADDLKIGDIVERHLHDNDVVLFNRQPSLHKLSIMAHLVKVRPWRTLRFNECVCGPYNADFDGDEMNLHVPQTEEAKTEALELMGIKNNLVSPRNGEPIIAATQDFITAAYLLSLKDTFLDRKSISNICCYMMDASTHIDLPPPAIIKPRCLWTGKQVFTVLMKPNRFSKVLVNLDAKTRSFSRIKSKTPEMCPKDGYLMIRNSEIIAGVVDKSVVGDGKKDSLFYVILRDYGALEAAEAITRLSKMCARFLGNRGFSIGIEDVQPGKSLSSQKEILVNKAYATSDDFIMQYAKGILECQPGMDQEATLEAKISSTLSKVRDDVGEICMDELGPANSPLIMATCGSKGSKINVSQMVACVGQQIISGKRVPDGFQDRSLPHFHKNSKHPLAKGFVSNSFYSGLTPTEFLFHAISGREGLVDTAVKTAETGYMSRRLMKSLEDLSSAYDGTVRSSNSDVVQFVYGDDGLDPTYMEGDGQAVEFKRTWIHSVNLNYDRHDSAMLPYEIIDYVNRALDDPKFLTNCNRDFIETIRTFVIENIAKYLASVRERRDLAPMLEEPDMDDLDDMEGDEFAPVAKRKSVENIIRVTEKQLRSFVDRCWEKYMRAKVEPGTAVGAIGAQSIGEPGTQMTLKTFHFAGVAAQTTLGVPRIKEIINAAKTISTPIITGQLINDRDERSARVVKGRIEKTYLKDVTSYIEEVYGPVTTYLSIQVNFDTISKLQLDITLADIAAAIWNTPKLKIPSQQVTVNNTLQQIHVHTSSDGKSSETEVYYRLQTYKRVLPDVVVAGIPTINRSVINQESGKIELFMEGTGLQAVMNTEGIVGTKTSTNHVMEMKDVLGIEAARYSIISEIGYTMAKHGLTVDPRHIMLLGDVMTCKGEVLGITRFGVAKMKDSVLALASFEKTTDHLFNAAARFAKDSIEGISECIVLGKLAPIGTNVFQLIRRTEEEEEQKPKELLFDTPSLHQLEITA |