Information | |
Gene name: | vps54 |
Databases ID: | DEG :DEG20090403 OrthoDB:EOG0937029K UniProt:- |
Organism: | Schizosaccharomyces pombe 972h- |
Function: | GARP complex subunit Vps54 (predicted) |
Nucleotide sequence: | Length=2850bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGGAACGAATTTCATCAGCTCCATCTATTTCGTTGGGATATCCTCCAACTGAGTCTTCGGCCCATTTAGCGCCTTCTTTCTCTGATTCGGCGACATCGACACTGTCTTTTAAATCTCTACTTGAAGATCCAGTGAATCCGATACGTCCCGTATATACGCCTACACGTACCGAAATCACTCCTGTCACTTTATCTCCTATTCCTATTACACCGGTGCGTGAATTTCAGCCTTACCTTCATGAAATTTCTCAAGAGTATGCACGTTATTCCAAACAAAAACGTGCAAGTTTGCGTCGATATTTGGAGAAGCATGGAAAATTGGAGGGTTCTATGAAAGAATCAAGTATCAATGGTTCGTTGTTACGACGATCGTCTGTTTCTACGATCCTTCGCCCTGCTAGTGAATCATCGTATCCTAACTCGAACTCTGAAACTATTACCTACGATATAGATGATAACGTAAACCCATCTTCTTCTCTTGTTGATAATTTTTCTATTTCTTCGGTGCCCTCCGTTTTTTTTCAGTCCGATTTCAACTTGGATGATCCCCAAATTTTCGACGTCGTTAGTGAACACATTGATATAACCCAGACCAGTGATGCACCCAATAGTAATCGAAATCTTCTCTTGAATAACTCAATGTTGCAGGAGAAAATTTCCTGGTACTTAGACACGGTCGAGCTCCATCTCTTGCAAGAAATAGAAAACGCCAGTGACAGTTTCCCTATGATTATTGATAACCTCAAGCAACTAAAAAAAGAAACTAGGGACAATGTGGAGGAGACAAAACACTTGCTCGAAAAACTTACGGAAGTCAACGTGATGTGCGATCGGCATATGGACGCTATTTCTTCTGAAGAATTAGCTTGTCATCAGCTCACCCAGCTGAAAAAAGTTGTTCAAACTTTAGAAGATATTTACAGTGAACATAAGAAGGTATCTGAAGACGTTAAAGACCAGAGATTCCTCGAGGCTATAAATGGAATAAACTCCATTGTAACCCAACTAAAGAAGAAATCTACGGAATTAAATGTTGATTTGCTATCCCTTCCATCGGTTAAAAGTTTAAGAGAGGAGCATAAGGTTCTTTACCATACTGTATCCCAAAGTGTTGTTCAACAGTTTTCTAAATTTTTAACGTCTGACATGCACAAATTTTCTACTATCCTTGACTCCAATGAACTCAAAGATATTTATTTGTCTAAGAACAGGTTGATACCTTCGGTAACGAAATCACTTCCTTCAGCCATGGAATTTGACGCTGACTTTCTTCATGAAGTGGACGTTTGCATCGACTGTCTTACTTTAACGGACAGTTTGCAGGCTGCATTGACTCTTTACAAGACTGCTGTATTTGAGGCATTTGAAAATTTAGCACAACAGTATTTTACCGATGGTGTAGAGATGCGCAGTGTTCGTAAATCCTCTGATTTACGTCGCAGCTTGAGTGCAGCCAGCCTTTCTAGTCTTTCAGATAGCTCTAGAAGAAGTTCATCAGCGGCGAATCCTTTTCAGAGCATGAGCATCACGGAATTTGCAGAAATGTTGACGAATATATATTTTTCATCATTGGAATGTCTGCGTCGCATTCGCAGCCAAATAAAAGTTTTAATAGATATTTTATCGAAAAAAGATACTAAACAATATCACCTATCTGTGATTCTTAATGATTTAATGGCCACGAGTTCCGATGTTGTTACACAACAAGTGACAACTATTAATAATCTTCGATTTCGAGTCTTGGATACTTATCCTCCTAATAATGTTATATACCTTTTTTCTTTACACATAATTTTTCATAATGAGCTTGAAAGTCTTTGCGGAATCACACAAAGCTCATTTATTCCAACTATAATGAGGCAATTACTGGACTGGTTTAAAAATTTTCAACGATATTCTACTCAGAAATTGGCATCAAGCTTTGAAAGGGAGCTATGGGAAGCGATACCTGTTGAACCATCCTGTCAAGATCTAGCTAATCGCGTGTTTGAATGCTCCGGTAATACTCCCGTAGAATGGACGCGACTATTATCTCCTGAAGCAGAAAAAGAAGATGAAAATCATAGGGTTCACCATGTAAAAGTTTCAGAGGACTGTACTGCTACGGTTTCGTTTGGAAAACAATCATTACATATTGTTCGGTCCTCTGTTACGTTGTTAGAAACATTGGATGATTATGGTAAACTTCTTGCTCACTTTTCAAGATTGGCTCCAGAGTTTCAGACTGGTATGCTAGATATGTTTCGTACACTCAATTCTCGGGTTTATCAATTAATATTGGGAGCGGGGACAGTGCGGTCGTCTGGCCTTAGTAAAGTACTTGGGAAGCATATTGCACTTGCCTCTCAAACTATCGCATTGTTTCAATTATCCCTTAATTCAATGTGCAGGTACTTGTCAAGAGTAACAGGAACTCGACTCACCAATGAAACTAATAAGTTGGATCAAGATTTCACCGTTCATCACTTACAAATTCATGATAAGTTTGTTAGTCTCATGAGGGAACGAGTTGCTATCAGTTGTTCCCAGATTGCTTCTCTTTCGTGGGATATTGACAGTCCTCATGGATACATTATTGATCTTTCAAAAAGTCTTATAAAGCTCTACAAAGTTTTACATCGCTACTCACAACGTGACTGTGTAGAAGTAATACCAGATGTAATTCGGATGTTCGAAGATAGACTGCAGTTGGAACTTACGGATATTGCAAGAAATCCATCCAAATGGCCAGGCGTTCGTATTGATTTGTCCTATTTTTATGACATGATGGCATCTAAATGCGGATATGCAGGAGACCGGACTTTATTGGAAAAATTTGAACGTACTCCGGAACAGCAGGAAGCGGCTTAA | |
Amino acid sequence: | Length=949bp |
BlastP NCBI nr
MERISSAPSISLGYPPTESSAHLAPSFSDSATSTLSFKSLLEDPVNPIRPVYTPTRTEITPVTLSPIPITPVREFQPYLHEISQEYARYSKQKRASLRRYLEKHGKLEGSMKESSINGSLLRRSSVSTILRPASESSYPNSNSETITYDIDDNVNPSSSLVDNFSISSVPSVFFQSDFNLDDPQIFDVVSEHIDITQTSDAPNSNRNLLLNNSMLQEKISWYLDTVELHLLQEIENASDSFPMIIDNLKQLKKETRDNVEETKHLLEKLTEVNVMCDRHMDAISSEELACHQLTQLKKVVQTLEDIYSEHKKVSEDVKDQRFLEAINGINSIVTQLKKKSTELNVDLLSLPSVKSLREEHKVLYHTVSQSVVQQFSKFLTSDMHKFSTILDSNELKDIYLSKNRLIPSVTKSLPSAMEFDADFLHEVDVCIDCLTLTDSLQAALTLYKTAVFEAFENLAQQYFTDGVEMRSVRKSSDLRRSLSAASLSSLSDSSRRSSSAANPFQSMSITEFAEMLTNIYFSSLECLRRIRSQIKVLIDILSKKDTKQYHLSVILNDLMATSSDVVTQQVTTINNLRFRVLDTYPPNNVIYLFSLHIIFHNELESLCGITQSSFIPTIMRQLLDWFKNFQRYSTQKLASSFERELWEAIPVEPSCQDLANRVFECSGNTPVEWTRLLSPEAEKEDENHRVHHVKVSEDCTATVSFGKQSLHIVRSSVTLLETLDDYGKLLAHFSRLAPEFQTGMLDMFRTLNSRVYQLILGAGTVRSSGLSKVLGKHIALASQTIALFQLSLNSMCRYLSRVTGTRLTNETNKLDQDFTVHHLQIHDKFVSLMRERVAISCSQIASLSWDIDSPHGYIIDLSKSLIKLYKVLHRYSQRDCVEVIPDVIRMFEDRLQLELTDIARNPSKWPGVRIDLSYFYDMMASKCGYAGDRTLLEKFERTPEQQEAA |