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Gene name: | CDC39 |
Databases ID: | DEG :DEG20010100 OrthoDB:EOG0937007S UniProt:- |
Organism: | Saccharomyces cerevisiae |
Function: | Component of the CCR4-NOT complex, which has multiple roles in regulating mRNA levels including regulation of transcription and destabilizing mRNAs by deadenylation; basal transcription factor |
Nucleotide sequence: | Length=6327bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGCTATCGGCCACATACCGTGATTTGAACACAGCATCTAATTTAGAAACATCAAAGGAAAAACAGGCCGCTCAAATCGTCATTGCACAAATTAGTTTATTATTCACGACTCTTAACAACGACAATTTTGAATCCGTGGAAAGAGAAATTAGACATATTTTAGACAGGTCGTCCGTAGATATTTACATAAAAGTTTGGGAACGATTATTAACCTTAAGTTCTCGGGATATTTTACAAGCGGGAAAATTTTTACTTCAAGAAAATCTACTACACAGACTACTATTAGAATTTGCGAAGGATTTACCGAAGAAAAGCACAGACCTTATTGAGCTTTTGAAAGAACGAACCTTCAATAACCAGGAGTTTCAAAAACAAACAGGAATTACATTATCACTTTTCATTGATCTATTTGATAAATCTGCAAACAAGGACATTATAGAGTCACTTGACCGCTCCTCTCAGATTAACGATTTCAAGACAATTAAGATGAATCATACAAATTATTTAAGGAATTTTTTTCTTCAAACCACACCAGAAACACTAGAGTCCAATCTACGCGACTTATTGCATTCCTTGGAAGGTGAAAGTCTAAATGACTTATTAGCTCTTTTACTGTCCGAAATACTTTCACCTGGGTCTCAGAATTTACAAAATGATCCCACACGGAGTTGGTTGACACCTCCGATGGTTTTAGACGCAACGAACCGTGGGAACGTTATAGCAAGATCTATAAGTTCTCTGCAAGCCAACCAGATAAATTGGAATCGTGTGTTTAATTTAATGTCAACAAAGTATTTCTTGAGCGCACCATTGATGCCTACTACAGCATCTTTGAGTTGCTTATTTGCAGCATTGCACGATGGTCCAGTTATTGATGAATTTTTCAGTTGCGACTGGAAAGTTATTTTCAAACTAGATTTGGCCATTCAACTTCATAAGTGGTCGGTACAGAATGGTTGCTTTGACTTATTAAATGCAGAAGGTACCAGGAAAGTTTCTGAAACCATCCCAAACACAAAGCAATCTTTACTCTACTTATTATCCATTGCATCATTGAATTTAGAATTGTTCCTACAAAGGGAGGAATTGTCTGATGGTCCTATGCTAGCTTATTTTCAAGAGTGCTTCTTTGAAGATTTCAACTACGCCCCTGAATATCTTATTTTAGCATTAGTCAAAGAAATGAAGCGGTTCGTTTTATTGATAGAAAACAGGACAGTCATAGACGAAATACTTATTACCTTATTGATTCAAGTGCATAATAAATCACCGTCATCGTTCAAGGACGTTATTTCTACAATAACCGATGATTCTAAAATCGTAGATGCAGCAAAAATCATAATCAACTCGGATGACGCACCTATTGCCAACTTTTTAAAATCGTTGTTAGATACGGGAAGATTAGATACGGTCATTAATAAACTTCCTTTCAATGAAGCTTTTAAAATTTTGCCATGCGCAAGACAAATTGGTTGGGAGGGGTTCGATACTTTCTTAAAAACAAAAGTTTCTCCATCTAATGTCGATGTAGTGCTGGAATCACTAGAGGTTCAAACGAAAATGACTGATACAAACACTCCATTTAGGTCATTAAAGACATTTGACTTATTCGCTTTTCATTCATTAATTGAAGTACTGAACAAATGCCCACTAGATGTTCTCCAATTACAAAGGTTTGAATCCTTGGAATTTTCCTTATTAATTGCATTTCCTAGATTGATCAATTTTGGTTTTGGACACGATGAAGCTATTTTAGCCAATGGTGACATCGCAGGGATTAATAATGATATTGAAAAGGAGATGCAGAACTATTTACAGAAAATGTATAGTGGTGAGTTAGCCATTAAAGATGTAATCGAACTTCTGAGAAGGTTAAGAGATAGCGACTTGCCAAGGGACCAGGAAGTCTTCACATGTATTACCCATGCCGTTATAGCAGAATCGACATTCTTCCAAGATTATCCATTGGATGCATTGGCTACTACATCTGTTCTTTTTGGATCCATGATTCTCTTTCAACTGTTACGTGGATTCGTATTAGACGTCGCATTTAGGATAATCATGAGGTTTGCCAAGGAGCCTCCAGAGTCCAAGATGTTTAAGTTTGCTGTACAAGCTATTTATGCATTTAGGATACGTTTGGCCGAATATCCACAGTATTGTAAGGACCTCTTGAGAGATGTTCCGGCTTTGAAGTCTCAGGCTCAAGTTTACCAATCTATCGTCGAAGCTGCTACCCTAGCAAATGCTCCAAAGGAAAGGTCAAGACCCGTCCAGGAAATGATCCCATTAAAATTTTTTGCTGTAGATGAAGTTTCATGTCAGATCAATCAAGAAGGTGCTCCTAAAGATGTCGTAGAAAAAGTTCTTTTTGTTCTCAACAACGTTACTCTGGCTAACTTGAATAATAAGGTTGATGAATTGAAAAAAAGTTTGACACCAAATTATTTTTCTTGGTTTTCCACATATTTAGTTACGCAAAGGGCTAAAACAGAACCTAACTATCATGATCTTTATAGCAAGGTTATAGTTGCTATGGGGTCAGGGTTGCTACATCAGTTCATGGTCAACGTTACTTTGAGACAATTATTTGTCCTACTATCTACAAAAGACGAGCAAGCCATCGATAAAAAGCACCTAAAGAATTTGGCTTCATGGTTAGGATGTATCACATTAGCTTTGAATAAACCAATTAAACACAAGAATATCGCATTCAGGGAAATGTTAATCGAAGCTTATAAGGAAAATAGACTTGAAATAGTTGTGCCTTTTGTAACAAAGATTTTACAAAGGGCTTCTGAATCAAAAATTTTCAAGCCTCCAAATCCCTGGACTGTTGGCATATTAAAGCTGTTGATTGAGTTGAACGAAAAAGCAAACTGGAAATTAAGTTTGACTTTCGAAGTTGAGGTTTTATTAAAATCTTTTAATTTGACCACCAAATCTCTCAAGCCCTCGAATTTCATCAATACTCCGGAAGTTATAGAAACTTTATCCGGTGCTTTGGGATCAATCACTCTGGAGCAACAACAAACAGAGCAACAAAGGCAAATTATACTAATGCAACAACACCAGCAACAGATGCTAATATATCAACAGAGACAACAACAACAACAACAAAGGCAACAACAACAACAACATCATATTAGTGCAAATACAATCGCAGACCAACAAGCGGCATTTGGCGGCGAGGGTTCAATTTCACACGACAATCCTTTTAACAACTTACTTGGTTCTACTATTTTTGTAACCCACCCTGACTTGAAGAGGGTATTTCAAATGGCTTTAGCCAAGTCAGTTCGCGAAATTTTGTTGGAAGTAGTCGAAAAGTCATCAGGAATTGCTGTTGTTACGACGACAAAAATAATACTTAAAGACTTTGCCACTGAAGTTGATGAGTCTAAGTTGAAGACGGCTGCAATCATTATGGTAAGGCATTTGGCACAAAGTTTAGCTCGAGCTACTTCAATTGAACCATTGAAAGAAGGCATACGTTCTACTATGCAATCACTAGCACCGAATTTAATGTCTCTTTCTTCTTCACCTGCAGAGGAGCTTGACACGGCAATAAATGAAAATATTGGCATTGCTCTAGTTTTGATTGAGAAAGCATCTATGGACAAGTCTACTCAAGATTTAGCAGACCAATTGATGCAAGCGATTGCTATTCGTCGTTATCACAAGGAAAGAAGGGCAGACCAACCATTTATTACGCAAAATACCAATCCATATTCACTGTCTTTACCAGAACCTCTTGGTTTGAAAAACACTGGTGTTACTCCTCAACAATTCAGGGTATACGAAGAATTTGGTAAGAATATTCCAAACTTGGATGTTATTCCGTTTGCAGGATTGCCCGCTCACGCTCCACCGATGACTCAAAATGTGGGTTTAACTCAGCCTCAGCAACAACAAGCGCAAATGCCTACCCAAATCCTAACCTCCGAACAAATAAGAGCTCAACAACAACAGCAGCAATTACAGAAAAGCCGTTTGAATCAGCCATCCCAGTCGGCTCAACCTCCAGGAGTGAATGTCCCAAATCCTCAAGGTGGGATTGCTGCAGTTCAATCAGATTTGGAACAGAATCAACGTGTTCTCGTTCACCTCATGGACATTTTAGTTTCTCAAATTAAAGAAAATGCTACGAAGAATAACTTAGCTGAATTAGGCGATCAAAACCAAATTAAAACCATCATTTTTCAAATTTTGACATTCATTGCAAAAAGCGCACAAAAGGATCAATTAGCTTTAAAGGTATCCCAAGCTGTCGTTAATAGCCTTTTTGCCACTAGTGAGAGTCCTCTCTGCAGAGAAGTTTTGTCCCTACTTTTGGAAAAGTTATGTTCTTTATCCCTCGTTGCTAGAAAAGACGTTGTCTGGTGGTTAGTTTATGCCTTGGACAGTAGGAAATTCAATGTTCCCGTTATCAGATCCCTTCTAGAAGTTAATTTAATTGATGCTACAGAATTAGATAACGTTTTAGTTACTGCAATGAAAAATAAAATGGAGAACTCAACTGAATTTGCTATGAAATTAATTCAGAATACTGTCTTGTCTGATGATCCAATTTTGATGAGAATGGACTTCATTAAAACCTTAGAACACTTGGCCTCTTCGGAAGATGAAAATGTAAAGAAATTCATCAAAGAGTTCGAAGATACTAAGATAATGCCAGTGAGGAAAGGTACCAAAACCACAAGAACAGAAAAGCTTTACTTAGTATTTACGGAATGGGTAAAATTACTTCAAAGAGTTGAGAATAACGACGTAATCACAACTGTTTTTATCAAGCAATTAGTCGAAAAGGGTGTTATCAGCGATACTGATAATTTACTTACATTTGTCAAAAGTTCTCTTGAGCTATCAGTTTCTTCATTCAAAGAAAGTGACCCGACTGATGAGGTTTTCATCGCTATTGATGCTCTAGGATCGCTAATTATAAAATTGTTGATTTTACAGGGTTTCAAAGATGATACAAGAAGAGATTACATAAATGC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| |
Amino acid sequence: | Length=2108bp |
BlastP NCBI nr
MLSATYRDLNTASNLETSKEKQAAQIVIAQISLLFTTLNNDNFESVEREIRHILDRSSVDIYIKVWERLLTLSSRDILQAGKFLLQENLLHRLLLEFAKDLPKKSTDLIELLKERTFNNQEFQKQTGITLSLFIDLFDKSANKDIIESLDRSSQINDFKTIKMNHTNYLRNFFLQTTPETLESNLRDLLHSLEGESLNDLLALLLSEILSPGSQNLQNDPTRSWLTPPMVLDATNRGNVIARSISSLQANQINWNRVFNLMSTKYFLSAPLMPTTASLSCLFAALHDGPVIDEFFSCDWKVIFKLDLAIQLHKWSVQNGCFDLLNAEGTRKVSETIPNTKQSLLYLLSIASLNLELFLQREELSDGPMLAYFQECFFEDFNYAPEYLILALVKEMKRFVLLIENRTVIDEILITLLIQVHNKSPSSFKDVISTITDDSKIVDAAKIIINSDDAPIANFLKSLLDTGRLDTVINKLPFNEAFKILPCARQIGWEGFDTFLKTKVSPSNVDVVLESLEVQTKMTDTNTPFRSLKTFDLFAFHSLIEVLNKCPLDVLQLQRFESLEFSLLIAFPRLINFGFGHDEAILANGDIAGINNDIEKEMQNYLQKMYSGELAIKDVIELLRRLRDSDLPRDQEVFTCITHAVIAESTFFQDYPLDALATTSVLFGSMILFQLLRGFVLDVAFRIIMRFAKEPPESKMFKFAVQAIYAFRIRLAEYPQYCKDLLRDVPALKSQAQVYQSIVEAATLANAPKERSRPVQEMIPLKFFAVDEVSCQINQEGAPKDVVEKVLFVLNNVTLANLNNKVDELKKSLTPNYFSWFSTYLVTQRAKTEPNYHDLYSKVIVAMGSGLLHQFMVNVTLRQLFVLLSTKDEQAIDKKHLKNLASWLGCITLALNKPIKHKNIAFREMLIEAYKENRLEIVVPFVTKILQRASESKIFKPPNPWTVGILKLLIELNEKANWKLSLTFEVEVLLKSFNLTTKSLKPSNFINTPEVIETLSGALGSITLEQQQTEQQRQIILMQQHQQQMLIYQQRQQQQQQRQQQQQHHISANTIADQQAAFGGEGSISHDNPFNNLLGSTIFVTHPDLKRVFQMALAKSVREILLEVVEKSSGIAVVTTTKIILKDFATEVDESKLKTAAIIMVRHLAQSLARATSIEPLKEGIRSTMQSLAPNLMSLSSSPAEELDTAINENIGIALVLIEKASMDKSTQDLADQLMQAIAIRRYHKERRADQPFITQNTNPYSLSLPEPLGLKNTGVTPQQFRVYEEFGKNIPNLDVIPFAGLPAHAPPMTQNVGLTQPQQQQAQMPTQILTSEQIRAQQQQQQLQKSRLNQPSQSAQPPGVNVPNPQGGIAAVQSDLEQNQRVLVHLMDILVSQIKENATKNNLAELGDQNQIKTIIFQILTFIAKSAQKDQLALKVSQAVVNSLFATSESPLCREVLSLLLEKLCSLSLVARKDVVWWLVYALDSRKFNVPVIRSLLEVNLIDATELDNVLVTAMKNKMENSTEFAMKLIQNTVLSDDPILMRMDFIKTLEHLASSEDENVKKFIKEFEDTKIMPVRKGTKTTRTEKLYLVFTEWVKLLQRVENNDVITTVFIKQLVEKGVISDTDNLLTFVKSSLELSVSSFKESDPTDEVFIAIDALGSLIIKLLILQGFKDDTRRDYINAIFSVIVLVFAKDHSQEGTTFNERPYFRLFSNILYEWATIRTHNFVRISDSSTRQELIEFDSVFYNTFSGYLHALQPFAFPGFSFAWVTLLSHRMLLPIMLRLPNKIGWEKLMLLIIDLFKFLDQYTSKHAVSDAVSVVYKGTLRVILGISNDMPSFLIENHYELMNNLPPTYFQLKNVILSAIPKNMTVPNPYDVDLNMEDIPACKELPEVFFDPVIDLHSLKKPVDNYLRIPSNSLLRTILSAIYKDTYDIKKGVGYDFLSVDSKLIRAIVLHVGIEAGIEYKRTSSNAVFNTKSSYYTLLFNLIQNGSIEMKYQIILSIVEQLRYPNIHTYWFSFVLMNMFKSDEWNDQKLEVQEIILRNFLKRIIVNKPHTWGVSVFFTQLINNNDINLLDLPFVQSVPEIKLILQQLVKYSKKYTTSEQDDQSATINRRQTPLQSNA |