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Gene name: | SNU114 |
Databases ID: | DEG :DEG20010639 OrthoDB:EOG093701PG UniProt:- |
Organism: | Saccharomyces cerevisiae |
Function: | GTPase component of U5 snRNP involved in mRNA splicing via spliceosome; binds directly to U5 snRNA; proposed to be involved in conformational changes of the spliceosome; similarity to ribosomal translocation factor EF-2 |
Nucleotide sequence: | Length=3027bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGGAAGGTGACGATTTATTCGATGAGTTTGGAAATTTGATCGGAGTTGATCCTTTTGACTCGGATGAAGAAGAAAGTGTGCTGGATGAGCAAGAACAATATCAAACCAATACGTTTGAGGGGAGCGGCAACAACAATGAGATTGAGAGCAGACAACTTACCTCGTTAGGAAGTAAAAAGGAACTTGGAATTTCCTTAGAGCACCCTTATGGTAAGGAAGTGGAAGTATTAATGGAAACTAAGAACACACAGTCACCACAGACTCCACTGGTAGAGCCGGTTACAGAACGAACAAAGTTGCAAGAGCATACAATTTTTACACAATTAAAAAAAAACATTCCGAAGACTAGATATAATCGAGACTATATGTTATCAATGGCTAACATTCCGGAGAGGATAATAAATGTTGGTGTCATTGGACCTCTTCACTCAGGTAAGACCTCTTTGATGGATCTCCTAGTAATCGACTCACACAAACGCATACCAGATATGTCTAAGAATGTAGAACTTGGATGGAAACCGCTAAGATACCTGGATAATTTGAAACAAGAGATTGACCGGGGTCTTTCCATTAAACTTAATGGTTCCACTCTACTCTGCACCGATTTAGAATCCAAGTCTAGAATGATAAACTTTTTGGATGCACCAGGGCATGTTAATTTTATGGATGAAACGGCAGTCGCACTTGCAGCAAGTGATTTGGTTTTAATCGTGATAGATGTTGTAGAAGGTGTTACATTTGTGGTAGAGCAATTGATAAAACAAAGTATTAAAAATAATGTAGCAATGTGTTTTGTTATAAATAAACTCGACAGATTGATTCTAGATTTAAAGTTGCCACCAATGGACGCATACTTGAAGTTAAATCATATAATTGCAAATATCAATTCCTTTACGAAGGGAAACGTGTTTTCACCAATAGACAATAACATAATATTTGCGTCTACAAAGCTGGGCTTCACATTCACTATCAAGGAATTTGTTTCTTATTATTACGCCCACTCCATACCTTCTTCTAAGATAGACGACTTTACCACAAGGCTATGGGGTAGCGTATATTACCATAAAGGTAATTTCAGGACAAAACCATTTGAAAATGTAGAGAAGTACCCGACTTTCGTTGAATTTATCCTCATCCCGCTTTATAAAATATTTTCCTACGCTTTATCTATGGAGAAAGATAAATTAAAGAATTTGTTAAGGTCTAACTTTAGAGTTAATTTAAGTCAAGAGGCCCTCCAGTACGATCCGCAACCTTTTTTAAAACACGTTCTACAGTTAATATTTAGGCAACAAACCGGTCTTGTAGATGCGATAACCAGATGTTATCAACCATTTGAATTATTCGACAATAAGACAGCTCATCTTTCAATTCCAGGAAAATCTACACCAGAAGGCACTCTTTGGGCTCATGTACTGAAAACTGTGGATTACGGTGGAGCAGAGTGGTCCCTTGTACGGATATACTCTGGACTTTTGAAGAGAGGGGATACAGTACGTATACTTGATACATCACAATCTGAATCTCGCCAAAAAAGACAGTTGCATGATATCTCAAAGACGGAAACCTCCAACGAAGATGAAGATGAAGATGACGAAACGCCTTCATGTGAGGTCGAAGAAATTGGCTTATTAGGTGGCAGATATGTCTATCCGGTTCATGAAGCACACAAAGGACAGATAGTATTAATAAAAGGTATTTCAAGTGCATATATTAAATCCGCGACGTTGTACTCTGTAAAGAGTAAGGAGGACATGAAACAGCTAAAATTTTTCAAACCTTTAGATTATATTACCGAGGCAGTTTTCAAAATTGTTCTTCAACCTTTACTGCCAAGGGAATTACCCAAGTTATTGGATGCCCTGAACAAAATTTCGAAATACTACCCAGGCGTTATTATTAAAGTTGAGGAATCTGGAGAACATGTAATACTAGGAAATGGAGAGCTGTATATGGACTGTTTGTTGTATGATCTAAGAGCGAGTTATGCAAAGATAGAAATTAAAATATCTGATCCTTTAACTGTTTTTTCTGAAAGTTGCTCAAATGAATCGTTCGCTTCAATACCTGTAAGTAATTCGATATCTCGCCTTGGTGAGGAAAATTTACCAGGTCTGTCGATTAGTGTAGCCGCTGAACCAATGGACTCTAAAATGATTCAGGATTTGAGCAGGAACACATTGGGAAAGGGTCAAAACTGCTTGGATATTGACGGAATAATGGACAACCCAAGGAAACTATCCAAAATATTGAGAACCGAGTATGGGTGGGATTCGTTGGCATCAAGAAACGTTTGGTCTTTTTATAATGGCAACGTGTTGATTAATGACACTTTGCCAGATGAAATCAGTCCTGAATTATTATCCAAATATAAGGAACAAATAATACAAGGATTTTACTGGGCTGTAAAAGAGGGGCCTTTGGCAGAAGAACCAATTTATGGTGTACAGTATAAATTGTTATCGATCTCAGTACCTTCCGACGTAAACATTGACGTTATGAAAAGTCAAATTATTCCGCTAATGAAAAAAGCCTGTTACGTTGGCTTACTGACAGCAATCCCAATTTTATTGGAACCCATCTATGAAGTTGACATCACGGTCCACGCCCCCTTGCTGCCAATAGTAGAGGAACTTATGAAGAAGAGACGTGGAAGCAGGATATACAAAACAATAAAAGTGGCAGGGACACCATTGTTGGAGGTTCGTGGACAAGTTCCGGTTATTGAATCTGCAGGATTCGAGACAGATTTGAGATTATCTACGAATGGTCTTGGTATGTGTCAGCTGTACTTTTGGCACAAGATATGGAGGAAGGTTCCTGGTGATGTTTTGGATAAAGATGCGTTTATTCCAAAATTGAAACCCGCACCTATCAACAGTTTAAGTCGTGATTTCGTGATGAAAACAAGAAGGCGGAAGGGTATTTCTACAGGTGGATTTATGTCAAATGATGGTCCTACGCTTGAAAAGTATATAAGCGCTGAATTATACGCTCAATTAAGAGAAAATGGCTTAGTACCGTGA | |
Amino acid sequence: | Length=1008bp |
BlastP NCBI nr
MEGDDLFDEFGNLIGVDPFDSDEEESVLDEQEQYQTNTFEGSGNNNEIESRQLTSLGSKKELGISLEHPYGKEVEVLMETKNTQSPQTPLVEPVTERTKLQEHTIFTQLKKNIPKTRYNRDYMLSMANIPERIINVGVIGPLHSGKTSLMDLLVIDSHKRIPDMSKNVELGWKPLRYLDNLKQEIDRGLSIKLNGSTLLCTDLESKSRMINFLDAPGHVNFMDETAVALAASDLVLIVIDVVEGVTFVVEQLIKQSIKNNVAMCFVINKLDRLILDLKLPPMDAYLKLNHIIANINSFTKGNVFSPIDNNIIFASTKLGFTFTIKEFVSYYYAHSIPSSKIDDFTTRLWGSVYYHKGNFRTKPFENVEKYPTFVEFILIPLYKIFSYALSMEKDKLKNLLRSNFRVNLSQEALQYDPQPFLKHVLQLIFRQQTGLVDAITRCYQPFELFDNKTAHLSIPGKSTPEGTLWAHVLKTVDYGGAEWSLVRIYSGLLKRGDTVRILDTSQSESRQKRQLHDISKTETSNEDEDEDDETPSCEVEEIGLLGGRYVYPVHEAHKGQIVLIKGISSAYIKSATLYSVKSKEDMKQLKFFKPLDYITEAVFKIVLQPLLPRELPKLLDALNKISKYYPGVIIKVEESGEHVILGNGELYMDCLLYDLRASYAKIEIKISDPLTVFSESCSNESFASIPVSNSISRLGEENLPGLSISVAAEPMDSKMIQDLSRNTLGKGQNCLDIDGIMDNPRKLSKILRTEYGWDSLASRNVWSFYNGNVLINDTLPDEISPELLSKYKEQIIQGFYWAVKEGPLAEEPIYGVQYKLLSISVPSDVNIDVMKSQIIPLMKKACYVGLLTAIPILLEPIYEVDITVHAPLLPIVEELMKKRRGSRIYKTIKVAGTPLLEVRGQVPVIESAGFETDLRLSTNGLGMCQLYFWHKIWRKVPGDVLDKDAFIPKLKPAPINSLSRDFVMKTRRRKGISTGGFMSNDGPTLEKYISAELYAQLRENGLVP |