Information | |
Gene name: | rpb1 |
Databases ID: | DEG :DEG20090709 OrthoDB:EOG093700EF UniProt:- |
Organism: | Schizosaccharomyces pombe 972h- |
Function: | RNA polymerase II large subunit Rpb1 |
Nucleotide sequence: | Length=5259bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGAGCGGGATTCAGTTTTCACCTTCTTCTGTCCCCTTACGCCGGGTGGAGGAGGTTCAATTTGGAATCTTGTCCCCGGAGGAAATTCGTTCAATGAGCGTTGCGAAGATTGAGTTTCCTGAGACCATGGATGAAAGTGGACAACGCCCCCGTGTTGGTGGGCTCCTGGACCCTCGATTGGGGACTATTGATCGACAATTCAAGTGTCAAACCTGTGGTGAAACTATGGCGGATTGTCCTGGTCATTTTGGTCATATTGAACTTGCAAAGCCAGTTTTCCACATCGGTTTCCTAAGCAAAATAAAAAAAATATTAGAATGCGTTTGTTGGAATTGCGGCAAACTTAAGATTGATTCTTCAAATCCAAAATTTAATGACACACAACGTTATCGTGATCCCAAAAATCGATTAAATGCAGTTTGGAATGTCTGCAAGACAAAAATGGTTTGCGATACTGGCTTATCTGCAGGCTCAGATAATTTCGACCTTAGTAATCCCTCCGCCAATATGGGACACGGTGGTTGTGGGGCTGCCCAACCTACAATACGTAAAGATGGCCTGAGATTATGGGGTTCTTGGAAACGCGGTAAAGATGAATCAGATTTACCAGAAAAACGCCTTCTGTCGCCGTTGGAGGTGCACACAATATTCACACATATTTCTTCAGAAGATTTAGCTCACTTAGGTCTTAATGAGCAGTATGCTAGACCTGACTGGATGATTATTACAGTCTTACCTGTTCCTCCTCCGAGTGTCCGTCCTAGTATTTCGGTGGATGGAACCAGTCGTGGCGAAGATGATTTAACGCACAAACTTTCCGATATCATAAAAGCAAATGCCAACGTTCGACGGTGTGAACAAGAAGGAGCTCCTGCGCATATTGTCTCTGAATATGAACAGTTACTTCAGTTCCATGTTGCCACGTATATGGACAATGAAATAGCGGGACAGCCTCAGGCTTTACAAAAATCTGGCAGACCTCTTAAAAGTATCCGTGCACGGCTCAAGGGAAAAGAGGGTCGATTACGTGGCAACCTGATGGGTAAACGGGTTGATTTTTCAGCTCGTACTGTGATTACCGGTGATCCAAATTTGTCGTTAGATGAACTCGGTGTTCCACGTAGTATTGCTAAGACACTTACTTATCCTGAAACTGTTACACCTTATAATATTTATCAATTGCAAGAATTAGTACGAAATGGTCCTGATGAGCATCCCGGTGCTAAATATATCATTCGTGATACAGGAGAGCGTATTGACTTGCGTTATCATAAACGTGCTGGTGATATTCCTCTTAGGTACGGTTGGCGAGTTGAGCGGCATATTCGTGATGGCGATGTCGTTATTTTTAACAGACAGCCATCCCTTCACAAAATGAGTATGATGGGTCATAGGATTCGCGTAATGCCGTACTCGACATTCCGATTAAACTTGTCAGTTACGTCTCCTTATAATGCTGACTTTGATGGTGATGAAATGAATATGCATGTCCCTCAGTCAGAAGAAACTCGTGCAGAAATTCAGGAAATTACTATGGTACCTAAGCAGATTGTTTCTCCTCAATCAAACAAGCCTGTCATGGGTATTGTTCAAGATACTTTAGCAGGTGTTCGTAAGTTTTCGTTACGTGATAACTTTTTGACTCGCAACGCTGTAATGAATATTATGTTATGGGTACCAGACTGGGATGGAATACTCCCACCACCCGTCATTCTTAAACCAAAGGTTTTATGGACAGGAAAGCAAATTTTGAGCTTGATTATACCCAAGGGAATTAACTTAATTAGAGACGACGATAAGCAAAGTCTTTCAAATCCCACCGACTCAGGAATGTTGATTGAAAATGGTGAAATTATATACGGCGTGGTTGACAAGAAGACTGTTGGTGCTTCTCAAGGTGGTTTAGTTCATACTATCTGGAAAGAGAAAGGTCCTGAGATTTGTAAAGGTTTCTTCAATGGTATTCAACGAGTTGTAAACTATTGGCTTTTACATAACGGTTTTAGCATTGGTATAGGAGATACTATTGCCGATGCGGACACAATGAAAGAGGTTACTAGAACTGTTAAGGAAGCCCGTCGTCAAGTCGCAGAATGTATTCAGGATGCTCAGCACAATCGCTTAAAGCCTGAGCCAGGAATGACCCTTCGAGAATCTTTTGAAGCTAAGGTATCAAGGATTCTCAATCAAGCGAGAGACAACGCTGGTAGGTCAGCTGAGCATAGCTTGAAGGATTCTAACAATGTCAAACAAATGGTTGCTGCTGGTTCAAAAGGTTCATTTATTAATATCTCTCAAATGTCTGCTTGCGTCGGTCAGCAAATCGTTGAAGGCAAACGTATTCCTTTTGGATTTAAATATCGTACATTACCACATTTTCCTAAAGACGACGACTCTCCAGAATCTCGTGGATTTATTGAAAATTCATACTTAAGGGGTTTAACTCCTCAAGAGTTCTTTTTCCACGCAATGGCTGGACGTGAGGGTTTGATTGATACTGCGGTCAAAACTGCTGAAACTGGATACATCCAAAGGCGTCTTGTTAAGGCTATGGAGGATGTAATGGTTCGCTATGACGGTACTGTGCGCAATGCCATGGGTGACATTATACAATTTGCCTATGGTGAAGATGGCCTGGATGCCACATTAGTAGAGTACCAGGTTTTTGACTCATTAAGGTTATCCACTAAGCAATTTGAAAAGAAGTATCGAATTGATTTAATGGAGGATAGGAGTTTATCATTGTATATGGAGAACTCTATTGAGAACGATTCTTCAGTACAAGACTTATTAGATGAGGAGTATACACAGCTGGTTGCTGATCGTGAGTTACTATGCAAATTTATTTTCCCCAAAGGTGATGCTAGATGGCCTTTACCTGTCAATGTACAAAGAATCATCCAAAATGCTTTACAAATATTCCATTTAGAAGCTAAAAAACCCACCGATCTTTTACCGAGTGATATTATTAACGGGTTAAATGAACTAATTGCAAAATTAACAATTTTCCGCGGAAGTGACCGTATTACTCGTGATGTTCAAAACAACGCTACCTTGTTATTCCAGATTTTATTAAGGTCCAAATTTGCTGTAAAACGGGTAATAATGGAATACCGACTTAACAAAGTCGCATTTGAATGGATTATGGGTGAAGTGGAAGCTCGTTTCCAACAAGCTGTCGTAAGTCCTGGAGAAATGGTGGGTACTCTGGCTGCACAATCTATTGGAGAACCAGCAACTCAAATGACACTCAATACATTCCATTACGCTGGTGTTTCTTCTAAGAACGTTACCTTGGGTGTTCCTCGTTTGAAAGAAATTTTGAATGTCGCTAAAAATATTAAGACCCCTTCTTTAACTATTTATCTTATGCCCTGGATAGCAGCTAATATGGATCTTGCTAAGAACGTTCAAACCCAAATCGAACATACAACTTTGAGCACTGTTACCTCTGCAACCGAAATTCATTACGACCCAGATCCTCAAGACACAGTGATTGAAGAAGATAAGGATTTTGTTGAAGCTTTCTTTGCTATTCCTGATGAAGAAGTTGAAGAGAACTTGTATAAGCAGTCTCCTTGGTTGCTTCGTCTTGAACTTGACCGTGCTAAGATGTTAGATAAGAAGTTGAGTATGAGTGATGTTGCTGGTAAAATTGCTGAAAGCTTTGAACGTGATCTTTTTACTATTTGGTCTGAGGATAATGCAGACAAGCTTATCATTCGTTGTCGTATCATTCGCGATGATGACCGTAAGGCAGAAGATGACGATAATATGATTGAAGAGGATGTTTTTTTGAAAACTATTGAAGGTCATATGCTTGAGAGTATTAGTCTTCGTGGTGTGCCGAACATTACTCGTGTTTATATGATGGAGCACAAGATTGTGCGGCAAATTGAAGATGGTACTTTTGAACGTGCTGATGAATGGGTTTTGGAAACAGACGGCATAAATCTTACTGAAGCAATGACTGTAGAGGGTGTAGATGCCACCAGAACTTACTCCAATTCTTTCGTGGAAATTTTGCAAATTCTTGGTATTGAAGCTACGAGATCTGCTTTACTTAAAGAATTAAGAAATGTTATCGAATTCGATGGTTCTTACGTTAATTATCGCCATCTGGCCCTTCTTTGCGATGTTATGACATCTAGGGGCCATTTAATGGCTATTACCCGTCATGGCATTAACAGAGCTGAAACCGGTGCTCTAATGAGGTGCTCTTTTGAAGAAACTGTAGAAATCCTTATGGATGCTGCTGCGAGTGGAGAAAAGGATGATTGCAAGGGAATATCTGAAAACATAATGCTAGGACAATTAGCCCCAATGGGAACTGGCGCATTTGATATTTACCTTGATCAAGATATGTTGATGAATTACAGTCTTGGTACCGCCGTCCCTACGCTCGCTGGGTCAGGAATGGGTACTTCCCAATTACCAGAAGGAGCCGGTACGCCATATGAACGCTCACCAATGGTTGATTCTGGATTTGTTGGATCTCCTGACGCCGCAGCATTTTCCCCTCTAGTACAAGGTGGATCCGAAGGTCGTGAAGGGTTTGGCGATTATGGATTGTTGGGGGCTGCTAGTCCTTATAAAGGGGTACAATCCCCTGGTTATACTAGTCCATTTTCGTCTGCTATGAGTCCTGGGTATGGACTTACTTCACCAAGCTATAGTCCATCATCTCCGGGATATTCCACGTCACCTGCTTATATGCCATCGAGTCCTTCCTATTCTCCAACTAGTCCTTCTTATTCCCCTACTAGTCCTTCTTATTCCCCTACTAGTCCTTCCTATTCTCCAACAAGTCCTTCATACTCAGCGACAAGTCCATCCTACTCTCCAACTAGTCCCTCCTATTCTCCTACTAGTCCTTCTTATTCGCCTACAAGCCCATCATATTCTCCTACTAGTCCCTCTTATTCACCGACTAGTCCTTCTTATTCTCCCACAAGCCCATCATATTCTCCTACTAGTCCCTCTTATTCACCGACTAGTCCTTCTTATTCTCCCACAAGTCCTTCTTATTCTCCTACGAGCCCATCGTATTCGCCTACTAGTCCTTCCTATTCTCCTACGAGCCCGTCGTATTCACCGACTAGTCCCTCTTATTCACCGACTAGTCCTTCTTACTCTCCAACTAGTCCCTCTTATTCCCCTACTAGTCCCTCTTATTCTCCTACTAGTCCTTCATATTCTCCTACGAGCCCTTCTTACTCTCCCACGAGTCCCTCGTATTCCCCTACTAGCCCATCTTAG | |
Amino acid sequence: | Length=1752bp |
BlastP NCBI nr
MSGIQFSPSSVPLRRVEEVQFGILSPEEIRSMSVAKIEFPETMDESGQRPRVGGLLDPRLGTIDRQFKCQTCGETMADCPGHFGHIELAKPVFHIGFLSKIKKILECVCWNCGKLKIDSSNPKFNDTQRYRDPKNRLNAVWNVCKTKMVCDTGLSAGSDNFDLSNPSANMGHGGCGAAQPTIRKDGLRLWGSWKRGKDESDLPEKRLLSPLEVHTIFTHISSEDLAHLGLNEQYARPDWMIITVLPVPPPSVRPSISVDGTSRGEDDLTHKLSDIIKANANVRRCEQEGAPAHIVSEYEQLLQFHVATYMDNEIAGQPQALQKSGRPLKSIRARLKGKEGRLRGNLMGKRVDFSARTVITGDPNLSLDELGVPRSIAKTLTYPETVTPYNIYQLQELVRNGPDEHPGAKYIIRDTGERIDLRYHKRAGDIPLRYGWRVERHIRDGDVVIFNRQPSLHKMSMMGHRIRVMPYSTFRLNLSVTSPYNADFDGDEMNMHVPQSEETRAEIQEITMVPKQIVSPQSNKPVMGIVQDTLAGVRKFSLRDNFLTRNAVMNIMLWVPDWDGILPPPVILKPKVLWTGKQILSLIIPKGINLIRDDDKQSLSNPTDSGMLIENGEIIYGVVDKKTVGASQGGLVHTIWKEKGPEICKGFFNGIQRVVNYWLLHNGFSIGIGDTIADADTMKEVTRTVKEARRQVAECIQDAQHNRLKPEPGMTLRESFEAKVSRILNQARDNAGRSAEHSLKDSNNVKQMVAAGSKGSFINISQMSACVGQQIVEGKRIPFGFKYRTLPHFPKDDDSPESRGFIENSYLRGLTPQEFFFHAMAGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLVKAMEDVMVRYDGTVRNAMGDIIQFAYGEDGLDATLVEYQVFDSLRLSTKQFEKKYRIDLMEDRSLSLYMENSIENDSSVQDLLDEEYTQLVADRELLCKFIFPKGDARWPLPVNVQRIIQNALQIFHLEAKKPTDLLPSDIINGLNELIAKLTIFRGSDRITRDVQNNATLLFQILLRSKFAVKRVIMEYRLNKVAFEWIMGEVEARFQQAVVSPGEMVGTLAAQSIGEPATQMTLNTFHYAGVSSKNVTLGVPRLKEILNVAKNIKTPSLTIYLMPWIAANMDLAKNVQTQIEHTTLSTVTSATEIHYDPDPQDTVIEEDKDFVEAFFAIPDEEVEENLYKQSPWLLRLELDRAKMLDKKLSMSDVAGKIAESFERDLFTIWSEDNADKLIIRCRIIRDDDRKAEDDDNMIEEDVFLKTIEGHMLESISLRGVPNITRVYMMEHKIVRQIEDGTFERADEWVLETDGINLTEAMTVEGVDATRTYSNSFVEILQILGIEATRSALLKELRNVIEFDGSYVNYRHLALLCDVMTSRGHLMAITRHGINRAETGALMRCSFEETVEILMDAAASGEKDDCKGISENIMLGQLAPMGTGAFDIYLDQDMLMNYSLGTAVPTLAGSGMGTSQLPEGAGTPYERSPMVDSGFVGSPDAAAFSPLVQGGSEGREGFGDYGLLGAASPYKGVQSPGYTSPFSSAMSPGYGLTSPSYSPSSPGYSTSPAYMPSSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSATSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPS |