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Gene name: | RPO21 |
Databases ID: | DEG :DEG20010135 OrthoDB:EOG093700EF UniProt:- |
Organism: | Saccharomyces cerevisiae |
Function: | RNA polymerase II largest subunit B220, part of central core; phosphorylation of C-terminal heptapeptide repeat domain regulates association with transcription and splicing factors; similar to bacterial beta-prime |
Nucleotide sequence: | Length=5202bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGGTAGGACAACAGTATTCTAGTGCTCCACTCCGTACAGTAAAAGAGGTCCAATTCGGTCTTTTCTCACCTGAAGAAGTTAGAGCAATCAGTGTGGCCAAAATTAGATTTCCAGAGACAATGGATGAAACCCAGACGAGAGCGAAAATTGGTGGTCTAAACGACCCTAGGTTAGGCTCTATTGATCGTAATCTGAAGTGTCAAACTTGTCAAGAGGGTATGAACGAATGTCCTGGTCATTTTGGTCACATAGATTTAGCAAAACCTGTATTTCATGTTGGTTTTATTGCCAAAATTAAGAAAGTATGTGAGTGTGTCTGTATGCACTGTGGTAAGCTATTACTGGATGAACATAATGAATTAATGAGACAAGCTCTAGCAATCAAAGACAGTAAAAAAAGGTTTGCTGCAATTTGGACTTTATGTAAAACAAAAATGGTCTGCGAAACAGATGTCCCTTCTGAAGATGATCCTACTCAGCTCGTATCAAGGGGAGGTTGTGGTAATACACAGCCTACAATTCGTAAGGATGGGTTGAAATTAGTTGGTAGTTGGAAAAAAGATAGAGCCACGGGGGATGCGGATGAACCAGAACTAAGAGTTTTAAGTACGGAGGAAATCTTGAATATTTTTAAGCATATCTCAGTAAAAGACTTCACTAGTTTGGGTTTCAACGAAGTTTTTTCTCGTCCAGAATGGATGATTTTAACATGCCTTCCTGTCCCACCACCACCGGTGCGTCCATCCATTTCCTTCAATGAATCTCAAAGAGGTGAGGATGATTTAACCTTTAAACTTGCTGATATTTTAAAAGCTAATATTAGTTTGGAAACACTAGAGCATAACGGTGCTCCACATCATGCTATTGAAGAAGCAGAGAGTTTATTACAATTTCATGTTGCCACTTATATGGATAATGATATTGCTGGTCAACCACAAGCTCTTCAAAAGTCCGGCCGTCCCGTTAAATCTATTCGTGCTCGTTTGAAGGGTAAAGAGGGTCGTATCAGAGGTAATTTAATGGGTAAGCGTGTGGATTTTTCGGCAAGAACTGTTATTTCTGGTGATCCTAATTTGGAATTAGACCAAGTCGGTGTTCCAAAATCTATTGCCAAGACTTTAACATACCCAGAAGTGGTCACACCATATAACATAGATCGTCTGACGCAACTTGTTAGGAATGGACCAAATGAGCACCCCGGTGCCAAATACGTCATTCGTGATAGCGGAGACCGTATAGATTTAAGATACAGTAAAAGGGCAGGTGATATTCAATTACAGTATGGGTGGAAAGTTGAACGTCATATTATGGACAATGATCCAGTTTTATTCAACCGTCAACCTTCGTTGCACAAAATGTCCATGATGGCCCACAGAGTAAAAGTTATTCCATATTCTACATTTAGATTGAATTTGTCCGTTACATCTCCATACAATGCCGATTTCGACGGTGACGAAATGAATCTTCACGTTCCTCAGTCTGAGGAAACAAGGGCGGAACTTTCTCAATTATGTGCTGTTCCTCTGCAAATTGTTTCACCACAATCTAACAAACCTTGTATGGGTATTGTTCAAGATACTTTGTGTGGTATTCGTAAACTGACATTAAGAGATACATTTATAGAACTTGATCAAGTTTTGAATATGCTTTATTGGGTTCCAGATTGGGATGGTGTTATTCCGACACCTGCAATTATCAAGCCCAAACCTTTGTGGTCCGGTAAACAAATCTTGTCTGTGGCTATCCCAAACGGTATTCATTTACAACGTTTTGATGAGGGCACTACTCTGCTTTCTCCAAAGGATAATGGTATGCTTATTATTGACGGTCAAATCATTTTTGGTGTAGTAGAGAAAAAAACCGTTGGTTCCTCCAATGGTGGTTTAATTCATGTTGTTACGAGAGAAAAGGGACCTCAAGTTTGTGCTAAGTTGTTTGGTAACATACAGAAAGTTGTTAACTTTTGGTTACTACATAATGGGTTTTCAACAGGTATTGGTGATACCATTGCGGACGGCCCAACAATGAGGGAAATTACAGAGACAATTGCAGAGGCTAAAAAGAAAGTTTTGGATGTTACGAAAGAAGCCCAGGCAAACTTATTGACTGCTAAACATGGTATGACTCTCCGTGAGTCTTTTGAGGATAACGTTGTTCGGTTCCTAAATGAAGCAAGAGATAAGGCAGGTCGTTTAGCTGAAGTCAATTTGAAAGATTTGAACAATGTGAAACAAATGGTTATGGCAGGTTCCAAGGGTTCATTTATTAATATCGCGCAAATGTCAGCTTGTGTAGGACAGCAATCTGTTGAAGGTAAACGTATTGCTTTTGGGTTCGTTGATCGTACCTTACCTCATTTCTCTAAAGATGATTACTCCCCAGAGTCTAAAGGTTTTGTTGAGAACTCATATTTGAGAGGTTTGACCCCACAAGAATTTTTTTTCCATGCAATGGGTGGTCGTGAAGGTCTTATCGATACCGCCGTCAAAACAGCCGAAACAGGTTATATTCAACGTCGTTTAGTGAAAGCTCTAGAAGATATCATGGTTCATTACGATAACACCACAAGAAACTCATTGGGTAACGTTATTCAGTTTATTTATGGTGAAGATGGTATGGATGCTGCGCATATTGAAAAGCAATCGCTAGATACTATTGGTGGCTCCGATGCAGCTTTTGAAAAGAGATACAGAGTTGATTTATTGAATACAGACCATACCCTTGATCCCTCACTATTGGAATCCGGATCTGAGATACTTGGCGATTTGAAACTTCAAGTTCTCCTGGATGAAGAATACAAACAATTAGTGAAAGATCGTAAATTTTTGAGGGAAGTTTTTGTTGATGGTGAAGCAAACTGGCCATTACCAGTCAACATAAGACGTATTATTCAAAATGCTCAACAAACTTTCCACATAGATCATACGAAACCATCTGATTTAACAATCAAAGACATCGTTCTTGGTGTAAAGGATTTGCAAGAAAACTTATTAGTGTTGCGTGGTAAGAATGAAATTATACAAAATGCCCAGCGAGATGCAGTTACATTGTTCTGCTGTTTATTACGTTCCCGTTTGGCCACACGTAGAGTTCTACAAGAGTACAGACTAACAAAACAGGCATTCGATTGGGTATTAAGTAATATCGAGGCACAATTCCTCCGTTCTGTTGTTCACCCTGGTGAAATGGTTGGTGTTCTAGCAGCCCAATCCATTGGTGAACCAGCCACACAAATGACCCTTAACACCTTCCATTTTGCTGGTGTTGCTTCCAAAAAAGTTACTTCTGGTGTCCCCCGTTTAAAGGAAATTTTGAATGTGGCCAAAAACATGAAAACCCCTTCCTTGACTGTATACTTAGAGCCTGGTCATGCTGCCGATCAAGAACAAGCGAAGTTGATCAGATCTGCTATCGAGCATACCACTTTAAAGAGTGTCACTATTGCTTCAGAAATTTACTATGATCCTGATCCACGTTCCACAGTTATTCCAGAAGATGAAGAAATTATCCAACTTCATTTCTCATTATTGGATGAAGAGGCTGAACAATCTTTTGACCAACAATCACCTTGGTTATTACGTCTGGAACTGGATCGTGCAGCAATGAATGATAAAGACTTAACAATGGGTCAGGTTGGTGAAAGAATCAAGCAAACATTCAAAAATGATTTGTTTGTTATCTGGTCTGAAGACAACGATGAGAAGTTGATCATCCGTTGTCGTGTTGTTCGTCCAAAGTCACTAGATGCTGAGACTGAAGCAGAAGAAGATCATATGTTGAAGAAAATTGAGAACACAATGTTAGAGAATATTACATTACGTGGTGTAGAGAACATCGAGCGTGTTGTCATGATGAAATATGACCGTAAAGTACCAAGTCCAACTGGTGAATACGTTAAGGAACCTGAATGGGTGTTGGAAACAGATGGTGTTAACTTATCTGAAGTTATGACTGTTCCTGGTATCGACCCAACCAGAATCTATACCAACTCCTTCATTGATATAATGGAAGTTCTAGGTATTGAAGCTGGTCGTGCAGCCTTGTATAAAGAAGTTTACAATGTTATTGCTTCTGATGGTTCGTATGTTAACTACCGTCATATGGCTTTGTTAGTCGATGTTATGACAACCCAAGGTGGCTTAACTTCTGTTACTCGTCATGGTTTCAACAGATCAAATACAGGTGCCTTAATGAGATGTTCATTTGAAGAAACTGTCGAAATTTTGTTTGAAGCTGGTGCTTCAGCCGAATTAGATGATTGTCGTGGTGTTTCGGAAAATGTCATTCTTGGTCAAATGGCTCCAATCGGTACCGGTGCATTTGATGTGATGATCGATGAGGAGTCACTGGTAAAATACATGCCAGAACAAAAAATAACTGAGATTGAAGACGGACAAGATGGTGGCGTCACACCATACAGTAACGAAAGTGGTTTGGTCAATGCAGATCTTGACGTTAAAGATGAGCTAATGTTTTCACCTCTGGTTGATTCGGGTTCAAATGACGCTATGGCTGGAGGATTTACAGCGTACGGTGGTGCTGATTATGGTGAAGCCACGTCTCCATTTGGTGCTTATGGTGAAGCACCTACATCTCCCGGATTTGGAGTCTCCTCACCAGGCTTTTCTCCAACTTCCCCAACATACTCTCCTACCTCTCCAGCGTACTCACCAACATCACCATCGTACTCACCAACATCACCATCGTACTCGCCAACATCACCATCGTACTCACCTACATCACCATCGTATTCACCAACGTCACCATCATATTCGCCAACGTCACCATCATATTCGCCAACGTCGCCATCGTATTCTCCAACGTCACCATCGTATTCGCCAACGTCGCCTTCCTACTCTCCCACGTCGCCAAGCTACAGCCCTACGTCTCCTTCTTATTCTCCTACATCTCCATCATACTCTCCTACGTCACCAAGTTACAGCCCAACGTCACCAAGTTACAGCCCAACGTCTCCAGCCTATTCCCCAACATCACCAAG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| |
Amino acid sequence: | Length=1733bp |
BlastP NCBI nr
MVGQQYSSAPLRTVKEVQFGLFSPEEVRAISVAKIRFPETMDETQTRAKIGGLNDPRLGSIDRNLKCQTCQEGMNECPGHFGHIDLAKPVFHVGFIAKIKKVCECVCMHCGKLLLDEHNELMRQALAIKDSKKRFAAIWTLCKTKMVCETDVPSEDDPTQLVSRGGCGNTQPTIRKDGLKLVGSWKKDRATGDADEPELRVLSTEEILNIFKHISVKDFTSLGFNEVFSRPEWMILTCLPVPPPPVRPSISFNESQRGEDDLTFKLADILKANISLETLEHNGAPHHAIEEAESLLQFHVATYMDNDIAGQPQALQKSGRPVKSIRARLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTVISGDPNLELDQVGVPKSIAKTLTYPEVVTPYNIDRLTQLVRNGPNEHPGAKYVIRDSGDRIDLRYSKRAGDIQLQYGWKVERHIMDNDPVLFNRQPSLHKMSMMAHRVKVIPYSTFRLNLSVTSPYNADFDGDEMNLHVPQSEETRAELSQLCAVPLQIVSPQSNKPCMGIVQDTLCGIRKLTLRDTFIELDQVLNMLYWVPDWDGVIPTPAIIKPKPLWSGKQILSVAIPNGIHLQRFDEGTTLLSPKDNGMLIIDGQIIFGVVEKKTVGSSNGGLIHVVTREKGPQVCAKLFGNIQKVVNFWLLHNGFSTGIGDTIADGPTMREITETIAEAKKKVLDVTKEAQANLLTAKHGMTLRESFEDNVVRFLNEARDKAGRLAEVNLKDLNNVKQMVMAGSKGSFINIAQMSACVGQQSVEGKRIAFGFVDRTLPHFSKDDYSPESKGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLVKALEDIMVHYDNTTRNSLGNVIQFIYGEDGMDAAHIEKQSLDTIGGSDAAFEKRYRVDLLNTDHTLDPSLLESGSEILGDLKLQVLLDEEYKQLVKDRKFLREVFVDGEANWPLPVNIRRIIQNAQQTFHIDHTKPSDLTIKDIVLGVKDLQENLLVLRGKNEIIQNAQRDAVTLFCCLLRSRLATRRVLQEYRLTKQAFDWVLSNIEAQFLRSVVHPGEMVGVLAAQSIGEPATQMTLNTFHFAGVASKKVTSGVPRLKEILNVAKNMKTPSLTVYLEPGHAADQEQAKLIRSAIEHTTLKSVTIASEIYYDPDPRSTVIPEDEEIIQLHFSLLDEEAEQSFDQQSPWLLRLELDRAAMNDKDLTMGQVGERIKQTFKNDLFVIWSEDNDEKLIIRCRVVRPKSLDAETEAEEDHMLKKIENTMLENITLRGVENIERVVMMKYDRKVPSPTGEYVKEPEWVLETDGVNLSEVMTVPGIDPTRIYTNSFIDIMEVLGIEAGRAALYKEVYNVIASDGSYVNYRHMALLVDVMTTQGGLTSVTRHGFNRSNTGALMRCSFEETVEILFEAGASAELDDCRGVSENVILGQMAPIGTGAFDVMIDEESLVKYMPEQKITEIEDGQDGGVTPYSNESGLVNADLDVKDELMFSPLVDSGSNDAMAGGFTAYGGADYGEATSPFGAYGEAPTSPGFGVSSPGFSPTSPTYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPGYSPGSPAYSPKQDEQKHNENENSR |