Information | |
Gene name: | EMB 2771 |
Databases ID: | DEG :DEG20030274 OrthoDB:EOG093701ME UniProt:- |
Organism: | Arabidopsis thaliana |
Function: | E3 Ubiquitin Ligase (APC1) |
Nucleotide sequence: | Length=5037bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGCCTCCAGGGGTTCGCCAACTTACCGTCCTCGGAAAGTTTAAACCTTTCGGTCTAATCGCCGAAGCTACTGATGGTAAATCACCGGATGATTCCTATCAGTATTTCCTCTTCGATCCTGAGCTCACTGGCGAGCGAGATGATGCTGATGGCAATGATGCCAACTTCTCGCGGCAGAGAGAGCACGAGCTCTTCATCCGAGACAACTGTAATGTCCGTAAGGGTTATGCTTTAGTAGAAGCTAATTTCATTGGATATTGGTATAACGCATGCTGGAGCAACCTTGGTCGAGGGACAGAAGCTTTTCTTTGTGTATTACAAATTGCTTGCTTAACAATCTACAACACATCAGGCGAAGTTGTATCTGTTCCACTAATGCGTACTGTCAAATCAATATGGCCTCTACCATGTGGTCTACTTCTTGAGCAAGCTGGTGAAGTGAATCCACCCTCACATGTTCCATTTTCTCCTGTTAGCCCCATCCTTGGTTCTCGTGAGATGCTGCGCCAAAGAAAAGAAGTTGGGAATAGTTCACCACAAAACTTCCATTCCCCAGTCGCGCATGACCTTATTAGCAAAAGAGATATGCCATGCATGTCTTCCCATCTGATTCTAAGAGATCCACTAGAGGAACCTGGGCCAACCTACGTTGAAGAGAGGGGGAAGTTGACCATAATGAAGGACTACGATGAGAGGACAATTTGGACAAGTGACCGTCTACCTCTTATGACGTCGTATAACAAAGGCAAGATGCAACATTCTGTGTGGGCGGCCGAATTTATAGAGTCAAACCTTGAAGCTTCTGCGTCATGTTCAAGCGGCATTGTTCCTGATGCTGTTCTCTCGAAGCGGGTTTCTTTTCGTAGAATATGGCAAGCGAAAGGTGCTAAGAAAGCTGCATCTAAGGTCTTTTTGGCAACTGATAATTCAGTCCCAGTAATTTGCTTTCTGATTCTAGAACAAAAGAAGCTGTTATCGGTGGGACTTCAAACTGTTGAAATCAATAACGAAATTCTGTTCGATGTTAAGCCTGATATAAGCTGGAGTGTGTCTGCGATTGCTGCTGCACCTGTTGTTGTGACACGTTCTCAAGTGAAAATAGGACTGCTTCCACATTTGGATATCATTGTTTTATCTCCAGAAAATGACCTCTTTCTCTATTCAGGAAAACAATGTCTCTGTAGATATGTATTACCTTCTTGGTTGGGAGAAAGTATTGGTTCCGGGGATGGAGAGTCTGCAAAAACAGATTCAGGTTTCAGGAACCTGAAGATCACAGGATTGTCTGATGCTGTTTTAGGATCTATCAATCTCTCAGTTAACCATTCACAGATCTTTCGGTGTGCCTTAACTGGTAAACCTTCATCGTCACTTGCAAATGATTGCATAGCAGCCATAGCTGAGGGACTACGATCCGATCTGTACAGTTTGTTTCTCTCTCTTCTTTGGGGAGATGGTCATTCTGACCTGCAAGGTTCCAGTATTCATTTTGAATGGGAAGCATTATGCAACATTTTTCTGGAGATCTGTCAAAAGCCTACTGTTGTGCATCGAAAGCAACCCAAAACAGCATCAGAGTCCTCCTGGGAGTTTCTTCTCATCAGCAAATTTCATAAGACCTACTCTAGGTTTCACAATGGTATTACTTCAATAAATCGTTTAGATCTGGAAGGCATTGTCCCATTTGATTCCAAGATTTGTAGTGAAGAAACACTGGGCAGCTCATGTGAACTAATGGTCCAGAGTTTAGATTGTCTCCATGCAGTTTATGAGAGCTTGAAGATGGATAATCTACGGAAACAGGATTTGCATCACTTGGCTGTTTTGTTGTGCAATATTGCCAAGTTTCTGGATGAGAAGTGTTACTTAGATTACTACATACGTGATTTTCCTCGTCTGTCAACAACTATTGGGGCGTGCACAACCCTTTCTTCTAGCAGAAAACCTCCAAATTTATTTAGATGGCTTGAGAATTGTTTAAGACGTGGATGTTTATCAACAAACTTTGATGACCTCCCAGATTTGATCCGTAGAGATGGGTGCTCCATAGTAAGCTGGGCAAGGAAAGTTGTTTCCTTCTACAGTGTGTTATTTGGTGATAAGCCAGAAGGACGGACACTTTCATCAGGTGTCCCCTGTAATATCGCGCCAGGATCATACTCCTGTAACGAGGAACTCACTATCTTAGCTATGGCAGGAGAGAGATTTGGGCTTCACCAACTGGATTTGCTACCTTCTGGTGTTTCTCTCCCGCTAAGACATGCACTGGATAGCTGTCGGGAATCTCCTCCAGCTGACTGGCCAGCAATTGCTTATGTGCTTCTTGGTCGAGAAGATATGGCCCTATCCGTCTTCAGAAATTTTAGTTCATCTAAGGAATTTGAGATGCAGTCAAATACGAGTTTGATATCGATGTCCATACCTTACATGCTACATTTGCATCCAGTAATTGTTCCATCCTCTGAGTCGATTGGCTTAGAAAACACTAAGATTGAGGATACAAATTCTGTGGATGGTTCTGTGATAGATGGAATGGAGCATATCTTCAACTCCTACACACAGCTACGGTATGGCCGGGATCTAAGATTGAATGAGGTTAGACGTCTTTTGTGCTCTGCAAGACCTGTGGTAGTTCAAACGGCTGCTAACCCTACTATATCAGATCAGGAGCAGCAACAGGCGTTTACTGTACCAAAGCTTGTTTTAGCTGGTCGACTGCCTTCTCAACAAAATGCCATTGTTAATCTAGATCCAAACATAAGGAATATCCAAGAATTAAAGACCTGGCCAGAGTTTCATAACGCTGTTGCTGCTGGGTTACGACTGGCTCCGCTTCAGGGAAAGGTCTCCAGAACGTGGATTAGATACAATAAACCTGGAGAGCCAAATGCTGTTCATGCTGGACTTCTGTTTGGCCTGGGATTACAGGGATATTTGCATGTGTTAAACCTTAGTGACATATACCAATATTTCACTCAGGACCATGAGAGCACTACGGTAGGTTTGATGCTTGGTCTGGCCGCTTCATACAGGGGAACAATGCAACCTGATATTGCAAAGGCTCTCTTTTTCCATGTTCCTGCTCGATACCAAGCTTCATATACTGAGTTTGAGATACCAACACTTCTACAGTCTGCAGCTTTAGTCTCCGTTGGCATGCTATTTGAAGGATCAGCACACCAGCAGACAATGCAATTACTTTTGGGTGAAATTGGCCGTAGAAGTGCAGGGGACAATGTCCTTGAAAGGGAGGGTTATGCTGTATCTGCAGGATTCTCACTTGGTCTTGTAGCTTTGGGCCGTGGAGGTGATGCGCTCGGTTCCATGGACTCCTTGGTCAATCGCTTACTCCTGTATTTAGGAGCAAAAGAGGAAAGATCTATCCTTGTACCATCCCTTGAAGATCACCGAAGTGCTGCACAGATAACAGACGGAAGCACTTCTAATGTTGATATAACTGCACCTGGAGCGATAATAGCTCTCACATTAATGTATCTTAAGACAGAATCAGAGGTCATCTTCTCAAAGCTCTCTATTCCTCAAACACATTACGATTTGGAGTGCGTTAGGCCTGATTTCATTATGCTCCGTGTCATTGCTCGGAACTTGATAATGTGGAGCAGGATCTGTCCTACTTGTGATTGGATTCAGTCTCAAGTTCCTGAAGTAGTCAAAAATGGTATCAGCCAACTCCGAGATGACATGGATAATATGTATGAGGTGGATGTTGAAGCCCTTGTTCAGGCATACGTCAATATAGTGGCCGGGGCCTGCATTTCACTTGGGCTGAGATTTGCTGGTACGAGGGATGGAAATGCTCGTGACTTACTTAACTCCTACGCTCTCTATCTTTTGAATGAGATCAAGCCTCTTTCTGCCACACCTGGAAATGCATTTCCCAGGGGAATATCAAAATTTGTTGATCGGGGAACACTTGAAATGTGTCTTTATCTTATCATTATTTCTCTGTCAGTGGTCATGGCGGGATCTGGAGACTTGCAAGTTTTTCGGTTGTTGAGATTTCTCCGCAGCCGAAACTCTGCCGATGGACATGCTAACTATGGCACACAAATGGCAGTGAGCTTAGCCACAGGATTCTTGTTTCTTGGAGGCGGTATGCGAACATTTTCAACGAATAATGGCTCACTGGCAATGTTGCTCATTACTCTCTATCCACGGTTGCCTTCTGGACCAAATGACAACCGTTGTCACCTCCAGGCATTCAGGCATTTATATGTCCTTGCAACAGAGGCTCGCTGGCTGCAGACCATTGATGTTGATTCTGGTCTGCCTGTCTATGCCCCTCTAGAAGTCACAGTAAAAGAGACAAAACTTTATTCAGAAACAAAATTTTGCGAGATAACACCGTGCATTCTGCCAGAGCGTGCTATTCTAAAGAGAATTTGTGTATGTGGTCCCCGATACTGGCCCCAACAAATTGAGCTAGTTTTTGGTTTAAGGACTCTGGGAGAATCTAATTTGATTGCTAATAGTCATAGAGAACTGGATTCTGATAGTGTTGATCACTTGGTCAGCACTTTCTCATCAGATCCAAGCCTAATAGCGTTTGCACAGTTGTGCTGTGACAAATCTTGGAATAACAGCTTTGATTTCCTAATTTTGGATCTAATCTTATGGTCTCAGGTTGCTCTTGCCTACAATGAGGCAGTATCAACTGGAAGATTGGCCTCCTCAGGTGGCTTTGTACAGTCAATCTTCTTAGCATCGCTGAGAAAGCGATGTGAAGAGGTTTTGAATTGCTCAACGGAGCTGAAGATTAATTTGAGGAATTATTTGACCTCAGAAGCATGGCCTTATGATAAGAACTCAAAGTTGCAGAAAGATATAATTATTCTCTCATGGTATCTAAAATGGTTCAACGTACCATCTCCATCGATCATCAAAGCAGCAGTGGAAAAGATCAAATCCAAGTCCAAAAACTCAACTTCGGCAATACCTTTGTTGCGATTGTTGTTACCAAATACGCATATTAGTGTGATTGGTGAAATTGATAGGGTCTTTTTCCCCTCGAATTAA | |
Amino acid sequence: | Length=1678bp |
BlastP NCBI nr
MPPGVRQLTVLGKFKPFGLIAEATDGKSPDDSYQYFLFDPELTGERDDADGNDANFSRQREHELFIRDNCNVRKGYALVEANFIGYWYNACWSNLGRGTEAFLCVLQIACLTIYNTSGEVVSVPLMRTVKSIWPLPCGLLLEQAGEVNPPSHVPFSPVSPILGSREMLRQRKEVGNSSPQNFHSPVAHDLISKRDMPCMSSHLILRDPLEEPGPTYVEERGKLTIMKDYDERTIWTSDRLPLMTSYNKGKMQHSVWAAEFIESNLEASASCSSGIVPDAVLSKRVSFRRIWQAKGAKKAASKVFLATDNSVPVICFLILEQKKLLSVGLQTVEINNEILFDVKPDISWSVSAIAAAPVVVTRSQVKIGLLPHLDIIVLSPENDLFLYSGKQCLCRYVLPSWLGESIGSGDGESAKTDSGFRNLKITGLSDAVLGSINLSVNHSQIFRCALTGKPSSSLANDCIAAIAEGLRSDLYSLFLSLLWGDGHSDLQGSSIHFEWEALCNIFLEICQKPTVVHRKQPKTASESSWEFLLISKFHKTYSRFHNGITSINRLDLEGIVPFDSKICSEETLGSSCELMVQSLDCLHAVYESLKMDNLRKQDLHHLAVLLCNIAKFLDEKCYLDYYIRDFPRLSTTIGACTTLSSSRKPPNLFRWLENCLRRGCLSTNFDDLPDLIRRDGCSIVSWARKVVSFYSVLFGDKPEGRTLSSGVPCNIAPGSYSCNEELTILAMAGERFGLHQLDLLPSGVSLPLRHALDSCRESPPADWPAIAYVLLGREDMALSVFRNFSSSKEFEMQSNTSLISMSIPYMLHLHPVIVPSSESIGLENTKIEDTNSVDGSVIDGMEHIFNSYTQLRYGRDLRLNEVRRLLCSARPVVVQTAANPTISDQEQQQAFTVPKLVLAGRLPSQQNAIVNLDPNIRNIQELKTWPEFHNAVAAGLRLAPLQGKVSRTWIRYNKPGEPNAVHAGLLFGLGLQGYLHVLNLSDIYQYFTQDHESTTVGLMLGLAASYRGTMQPDIAKALFFHVPARYQASYTEFEIPTLLQSAALVSVGMLFEGSAHQQTMQLLLGEIGRRSAGDNVLEREGYAVSAGFSLGLVALGRGGDALGSMDSLVNRLLLYLGAKEERSILVPSLEDHRSAAQITDGSTSNVDITAPGAIIALTLMYLKTESEVIFSKLSIPQTHYDLECVRPDFIMLRVIARNLIMWSRICPTCDWIQSQVPEVVKNGISQLRDDMDNMYEVDVEALVQAYVNIVAGACISLGLRFAGTRDGNARDLLNSYALYLLNEIKPLSATPGNAFPRGISKFVDRGTLEMCLYLIIISLSVVMAGSGDLQVFRLLRFLRSRNSADGHANYGTQMAVSLATGFLFLGGGMRTFSTNNGSLAMLLITLYPRLPSGPNDNRCHLQAFRHLYVLATEARWLQTIDVDSGLPVYAPLEVTVKETKLYSETKFCEITPCILPERAILKRICVCGPRYWPQQIELVFGLRTLGESNLIANSHRELDSDSVDHLVSTFSSDPSLIAFAQLCCDKSWNNSFDFLILDLILWSQVALAYNEAVSTGRLASSGGFVQSIFLASLRKRCEEVLNCSTELKINLRNYLTSEAWPYDKNSKLQKDIIILSWYLKWFNVPSPSIIKAAVEKIKSKSKNSTSAIPLLRLLLPNTHISVIGEIDRVFFPSN |