Information | |
Gene name: | COP1 |
Databases ID: | DEG :DEG20010138 OrthoDB:EOG093700ZO UniProt:- |
Organism: | Saccharomyces cerevisiae |
Function: | Alpha subunit of COPI vesicle coatomer complex, which surrounds transport vesicles in the early secretory pathway |
Nucleotide sequence: | Length=3606bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGAAGATGTTAACTAAATTTGAATCAAAGTCCACTAGGGCCAAGGGCATTGCCTTCCACCCCTCCAGACCTTGGGTTTTGGTGGCTTTGTTTTCCTCTACTATTCAATTATGGGATTACAGGATGGGAACACTACTTCACAGATTTGAAGACCACGAGGGCCCTGTTCGTGGGCTAGATTTCCATCCAACCCAACCGATTTTTGTTTCGGCAGGTGACGACTATACCATTAAAGTTTGGTCCTTAGATACTAACAAATGTCTATACACCTTAACTGGGCATTTGGATTATGTCCGTACCGTGTTTTTCCACCGTGAGCTGCCTTGGATCATATCTGCTTCTGATGACCAGACCATAAGAATCTGGAACTGGCAAAACCGTAAGGAAATTGCATGTTTGACCGGCCACAATCATTTTGTCATGTGTGCTCAATTTCATCCAACCGATGACCTGATCGTTTCCGCTTCTCTGGATGAAACCATCAGAATTTGGGATATTTCCGGTTTAAGGAAAAGACACTCCGCTCCTGGTACTAGTTCATTTGAGGAGCAAATGAGTGCACAACAAAATCTATTGGATGGCTCTCTTGGTGACTGTGTTGTCAAGTTTATTCTAGAGGGTCACACAAGAGGTGTCAACTGGGCCTCTTTCCATCCAACTTTACCATTGATTGTCTCCGGCAGTGACGACCGTCAAGTTAAATTATGGAGAATGAGTGCTACGAAAGCTTGGGAAGTTGATACTTGCAGAGGTCACACTAACAATGTTGATAGTGTTATCTTTCACCCACATCAAAACTTGATCATTTCTGTCGGTGAAGACAAAACGCTAAGGGTTTGGGATCTTGACAAGAGAACTCCAGTAAAGCAATTCAAAAGAGAAAACGATAGATTTTGGTTGATTGCAGCACATCCTCATATCAATCTATTTGGTGCAGCTCACGATTCTGGTATTATGGTTTTCAAGCTCGATCGCGAAAGACCATGCAGCTTTATCCATCAAAACCAGTTGTTTTTTGTCAATGCGGAAAAGCAAATCCAAAGTTTCAATTTCCAGAAAAGAGTCGCTTCATTACCTTATGCGTCCTTAAAGGGTATTGGTCAACCTTGGGATGCATTCAGAAGTATATCGTACAATCCCTCCCAACATTCAGTTTTGGTTAATGAAGCTAATGGCAAATTTGCTCTCGTTATTTTACCAAAACAACCAGTTGGAGCTGTGGAGCCAACAAGTGTCACCCAAGATACAGGTAATTTTGCTACTTTTGTTGGTCGTAATAGATTTGTTGTTTACAACAAGAACACTGAATCTGTTGAAGTTCGCTCTCTCGAAAACAAAGTTACAAGAAATATCAAAGTAGAGGAAACAGTAAGAACTATTGTAGCTGCAGGTCCTGGATCTGTTTTGGTCATACACCCCAGAGAAGTTATTCTTTATGATGTCCAACAGGGCAAAAAAGTATCCCAATTGGCTGTTAAAAACGTCAAGTACGTTTCGTGGTCCTTAGATGGTCAATATGTTGCATTGATGAGTAAGCACACCATAACTTTGGCTACCAAAAAGCTAGAATTGATTAATTCTATGCATGAAACGATTAGAATCAAAAGTGCCGCTTGGGATGAAACTGGTGTATTAATTTATTCAACTTTAAATCATATAAGGTACTCACTATTGAACGGGGATAGAGGTATTATTAAAACTTTGGAGAAAACTTTATATATCACAAAAGTTCAGGGAAAATTAGTGTACTGCTTGAACCGTGAAGGTGAGATTGAAATTTTAACCATTGATCCTACAGAATATCGCTTCAAAAAGGCCCTGGTTAACAAAAATTTCCCAGAAGTTTTACGTCTGATAAAAGATTCTAATTTGGTTGGCCAGAATATCATTTCCTATCTGCAGAAGTCAGGTTACCCAGAAATTGCTTTACAATTCGTTCAAGACCCACATATCCGTTTTGATTTAGCTTTGGAATACGGTAATTTGGATGTTGCCTTAGATGAAGCCAAAAAACTGAATGATTCTAGTACTTGGGAAAGATTAATCCAAGAAGCCTTGGCACAAGGTAATGCCAGCTTAGCTGAAATGATTTATCAAACTCAACATTCTTTTGACAAACTTTCCTTCCTGTATTTAGTTACAGGTGACGTTAACAAACTATCTAAAATGCAAAATATCGCTCAGACTCGTGAAGACTTTGGAAGTATGCTATTAAACACCTTTTACAACAATTCAACCAAGGAAAGATCTAGCATTTTTGCAGAGGGCGGCTCTTTACCATTAGCTTATGCCGTAGCAAAGGCTAACGGAGATGAAGCGGCTGCTTCTGCTTTCTTGGAGCAAGCTGAAGTTGATGAACAAGATGTTACTTTACCAGACCAGATGGATGCCTCCAACTTCGTTCAAAGACCAGTGATCTCAAAGCCACTTGAAAAATGGCCATTAAAAGAGGCTGAACTATCTTACTTTGAAAAGGCTGTTTTAGGTCAAATTGACGATTTGACTATAGACGATGAAACTCCAGCAGTAAACACCACTCAAGAGCAAGAAGAACCACTAGGCGAAGAAAACTTTAACGATGAGGATATTGGTGAAGACGAAGGTGCCTGGGATTTGGGTGACGAAGATTTGGATGTGGGAGAAGAGTTACCTGAAGAAGTTGAGCAAGGCGAAATTACCTCTCCAGCACAGGAAGTTGAAACAGCCATTTGGATCAAGAATTCTAAACTGCCTGCTGTCCTAGTTGCCGCTGGTGCCTTTGATGCCGCTGTTCAAGCCTTGAGCAAGCAAGTGGGTGTAGTCAAGCTGGAGCCATTGAAGAAATATTTTACCAACATTTATGAGGGTTGTAGAACATACATTCCTAGTACGCCCTGTGAACTTCCTGCTCAATTAGGTTATGTCAGAGCGTATGATGATACCGTAAGTGAAGATCAAATTCTTCCTTACGTGCCAGGTCTTGATGTCGTTAATGAAAAAATGAATGAGGGTTACAAAAACTTTAAACTAAACAAACCAGATATTGCAATCGAATGCTTCAGAGAAGCTATCTACCGTATTACGCTATTAATGGTCGATGATGCTGAAGATGAAAAATTAGCACACAAGATACTGGAAACTGCTAGGGAGTATATATTAGGTTTATCCATTGAATTGGAACGCCGCTCATTAAAGGAGGGAAATACTGTACGCATGCTTGAGCTAGCTGCATACTTTACAAAGGCAAAACTATCCCCAATTCATCGTACCAATGCTTTACAAGTGGCTATGTCCCAACATTTCAAACACAAAAATTTCTTACAGGCCTCATATTTTGCCGGTGAATTTTTAAAGATTATTTCTTCTGGTCCTCGTGCAGAACAAGCACGTAAAATCAAAAACAAAGCCGACTCAATGGCCAGTGACGCCATTCCAATTGACTTTGATCCTTATGCTAAATTCGATATTTGTGCAGCCACCTACAAACCAATTTATGAAGATACACCTTCCGTTTCTGACCCATTAACAGGTAGTAAATACGTTATCACGGAAAAAGATAAAATAGATAGAATTGCTATGATTTCTAAGATCGGTGCACCTGCATCCGGATTAAGAATACGTGTATAA | |
Amino acid sequence: | Length=1201bp |
BlastP NCBI nr
MKMLTKFESKSTRAKGIAFHPSRPWVLVALFSSTIQLWDYRMGTLLHRFEDHEGPVRGLDFHPTQPIFVSAGDDYTIKVWSLDTNKCLYTLTGHLDYVRTVFFHRELPWIISASDDQTIRIWNWQNRKEIACLTGHNHFVMCAQFHPTDDLIVSASLDETIRIWDISGLRKRHSAPGTSSFEEQMSAQQNLLDGSLGDCVVKFILEGHTRGVNWASFHPTLPLIVSGSDDRQVKLWRMSATKAWEVDTCRGHTNNVDSVIFHPHQNLIISVGEDKTLRVWDLDKRTPVKQFKRENDRFWLIAAHPHINLFGAAHDSGIMVFKLDRERPCSFIHQNQLFFVNAEKQIQSFNFQKRVASLPYASLKGIGQPWDAFRSISYNPSQHSVLVNEANGKFALVILPKQPVGAVEPTSVTQDTGNFATFVGRNRFVVYNKNTESVEVRSLENKVTRNIKVEETVRTIVAAGPGSVLVIHPREVILYDVQQGKKVSQLAVKNVKYVSWSLDGQYVALMSKHTITLATKKLELINSMHETIRIKSAAWDETGVLIYSTLNHIRYSLLNGDRGIIKTLEKTLYITKVQGKLVYCLNREGEIEILTIDPTEYRFKKALVNKNFPEVLRLIKDSNLVGQNIISYLQKSGYPEIALQFVQDPHIRFDLALEYGNLDVALDEAKKLNDSSTWERLIQEALAQGNASLAEMIYQTQHSFDKLSFLYLVTGDVNKLSKMQNIAQTREDFGSMLLNTFYNNSTKERSSIFAEGGSLPLAYAVAKANGDEAAASAFLEQAEVDEQDVTLPDQMDASNFVQRPVISKPLEKWPLKEAELSYFEKAVLGQIDDLTIDDETPAVNTTQEQEEPLGEENFNDEDIGEDEGAWDLGDEDLDVGEELPEEVEQGEITSPAQEVETAIWIKNSKLPAVLVAAGAFDAAVQALSKQVGVVKLEPLKKYFTNIYEGCRTYIPSTPCELPAQLGYVRAYDDTVSEDQILPYVPGLDVVNEKMNEGYKNFKLNKPDIAIECFREAIYRITLLMVDDAEDEKLAHKILETAREYILGLSIELERRSLKEGNTVRMLELAAYFTKAKLSPIHRTNALQVAMSQHFKHKNFLQASYFAGEFLKIISSGPRAEQARKIKNKADSMASDAIPIDFDPYAKFDICAATYKPIYEDTPSVSDPLTGSKYVITEKDKIDRIAMISKIGAPASGLRIRV |