Information | |
Gene name: | chc1 |
Databases ID: | DEG :DEG20090347 OrthoDB:EOG093700D7 UniProt:- |
Organism: | Schizosaccharomyces pombe 972h- |
Function: | clathrin heavy chain Chc1 (predicted) |
Nucleotide sequence: | Length=5001bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGGCTCAACAATTACCAATACGGTTCAGTGAGGTGTTACAGCTCGCATCCGTAGGAATTCAACCGTCTTCTTTCGGATTTGCAAATGTAACCCTTGAATCTGACAAATATGTTTGTGTTCGCGATAATCCAAATGGTGTAAACCAGGTCGTTATTGTCGATTTGGAAGATCCATCTAATGTGTTGCGACGTCCTATTTCGGCAGATTCAGTTATCTTACATCCCAAAAAGAAAATTATTGCATTAAAAGCACAAAGACAACTTCAAGTATTCGACTTGGAAGCGAAAGCGAAAATTAATAGTTATGTAATGAATCAAGATGTCGTTTACTGGACTTGGATCAGCGATAGCGTTATCGGTATGGTCACTGACACTTCTGTGTTCCACTGGACCGTCTCCGGCTCTGATCCTGTTAAAATGTTTGATCGTCATAGCTCATTGAATGGAACGCAGATCATTTCCTACAAGAGCAACTATAATGAAGAATGGTTTACATTGATCGGTATTTCCTCCCGGGATAACCGTATTGCTGGCAATCTTCAACTGTATTCCAAAAAGAGGAAGGTCAGTCAGCCTCTGGAAAGTCACGCTTCTGCATTTGCAGTCATTCAACCAGAAGGCGTTGATCATGAAGTTCAAGTTTTAGCACTTGCCAGTCGATTACCCACAGGCTCGAAACTTAGTATTGTTGAGGTAGACCGTAACCCCAACAATCCCGCGTTTGCTACCAAAACCGTCGATCTTTTCTTCCCTCCGGAAGCCGTTAATGATTTTCCTATTGCTATTGAAATTGGTTCCACTTATAACGTTGCTTATGTTGTTACCAAATATGGCTTTATTCATGTTTATGATTTGGAAACCGCGAAATGCATTTATATGAATCGTGTTTCGGGTGAATCAATCTTTGTAACCACTGCTCATAAATCTGTGAATGGTCTTATGGCCATTAACCGAAAGGGTCAAGTTCTTAGCGTATCCATAAACCCTGAAACCATCATTCCTTATATCTTGTCTAATCTTAATGACCCTGGTTTGGCAGTCCGAATGGCATCTCATGCTAATCTTCCCGGAGCTGACAATTTGTATATGCAACAGTTCCAGCAGCTTATGGCTCAAGGAAACTACAGCGAGGCTGCTAAGGTGGCTGCTTCATCTCCTCGTGGTATTCTTCGTACCTCTCAGGTGATTGATCAATTCAAGCTTATTCAAGCTGCTCCTGGTCAAATTGCTCCTATCTTACAATATTTCGGCACTTTGTTGGATAAGGGTCCTTTGAATGAACATGAAACAATTGAATTGGCTCGTCCTGTGCTTGCTCAAAACCGTATCCAACTTCTTGAAAAATGGTATGGTGAAAACAAGTTGGCCTGTACAGAAGCGTTGGGTGATTTAGTTAAACCTTACAACACTCCTTTCGCATTGAAGATTTACGAAACTGCCAATGTGCCAAACAAGGTTGTCATGTGCTTATCAGAGTTGGGAGATTTTGGCAAGTTGGCTACTTACACATCTCAGCAAAACATCACTCCGGATTACGTCTCTCTTCTCCAAAACCTTGTTAGAGTTAACCCTGATCAAGCTGCGGAGTTTGCTACTCAAATGTTCAACAGTAACCCCTCCATTAATTTAGAGAAGATTGTTGACATTTTCATGTCTCAGAATTTAGTTCAACAAGCGACCGCATTTTTGTTGGATGCTCTTAAGGATGACAATCCTGAACATTCTCATCTTCAAACTCGTCTTCTTGAGATTAATTTAATTAATGCCCCTCAAGTTGCTGATGCTATTTTGGGTAACCAAATGTTTACTCACTTTGATCGTGCCGTAATTGCTTCGCTTTGCGAGCGCGCTGGTTTAGTACAACGTGCTTTGGAGTTGTATGATAAGCCTGCTGATATTAAGAGAGTGATTGTTCACTCAAATTTATTGAATCCTGAATGGTTGATGAATTACTTTAGCAGATTTTCACCTGACGAGGTTTATGATTACCTTCGTGAAATGCTTCGCTCTAATCTTCGTCAAAATCTTCAAATAGTTGTCCAAATTGCTACTCGTTACTCAGACCTTGTTGGTGCTCAACGCATCATTGAGATGTTTGAAAAGTTCAAGACTTTTGAAGGATTGTACTATTATTTGGGTAGTATTGTAAACATCACTGAAGATCCAGAAGTCGTATATAAGTATATCCAGGCTGCTTGTTTGATGAACCAGTTTACTGAAGTTGAACGCATCTGTCGTGACAACAATGTTTACAACCCTGAGAAGGTTAAGAACTTGCTCAAAGAAGCCAAATTAGCGGATCAGCTTCCCCTTATTCTTGTTTGCGATCGTTATGACTTTGTCAATGATTTGGTTTTCTATCTTTTCCGAAACAACATGTTTCAATTTATTGAAATATACGTTCAACGTATTAATCCCTCTAAGACTCCTCAAGTGGTAGGTGCTTTGTTAGATATTGATTGCGATGAAGAACTTGTCCAAAACCTCTTGATGTCTGTTGTTGGGCAGGTTCCTGTGGATGAGTTGGTTGAAGAAGTTGAGAGACGCAATCGCCTTAAACTTTTGCTGCCCTATTTGGAATCTCTTTTGCAATCTGGTAGTCAAGATCGTGCTATTTATGACGCACTTGCCAAGATATATATTGATTCCAATAACAATCCTGAAGTATTTTTGAAAGAAAACAACTTTTATGATACTCTTACGGTTGGTAAATACTGTGAAAAGCGTGATCCCTATTTGGCTTTCATCGCTTATGAGAAGGGTGGTAATGATACTGAAATCATTAACCTATGTAACGAAAACTCAATGTTCAAACAGTTAGCTCGTTATCTTCTTAAGCGCAGTGACTCTAACCTTTGGTCCGAGGTTTTGCAAGACAGTGCTTACCGCCGTCCTTTGTTGGACCAGGTTATCGCAACTGCAGTTCCCGAATCTTCAGATCCTGAAGCAGTTTCAATTGTAGTGAAAGCTTTAATGGAAGTAGATCTTCCTTCACAGCTCATTGAATTATTGGAGAAGATTGTTTTGCAACCTTCATCCTTCAGCGAAAATGCCAATCTTCAAAACTTGTTGTTTTTGACTGCCATTAAAGCTGATAAATCACGTGTTATGGAGTATATCGATAAGTTGGATAAGTACGATGTCGATGAGATTGCCGAAATTGCTATTGAAAATGGCCTTTATGAAGAGGCTTTCAGAATTTACAAGATTCACAACAAGCATGAACAGGCTATGAAGGTATTAGTTGAGGACATTGTTAGTCTCGATCGTGCTCAAGACTATGCCGAAACAGTTGAACAGCCTGAAGTTTGGTCTCGCCTTGCTAAGGCCCAATTGGATGGAATTAGAATTCCGGATGCTATTGAATCATATTTGAAGGCAGATGATCCTTCGAATTACTCAGAGGTAATTGAATTAGCTTCTCGTGCTGGTAAGTATGAGGAATTGATCAAATATCTTTTGATGGCAAGAAGCAAGATGCATGAGCCTGATGTCGATAGCGCTCTTCTTATTGCCTATGCAAAGACCAACCAATTGACTGAAATGGAAACCTTCTTGATCGGCTCTAACGTTGCTGATGTCAAGGCAGTCGGTGATGAATGCTTTGAAAGCAAAAACTATGAGGCAGCAAAGCTTATGTATTCCAGCATTTCCAATTGGTCTATGCTTGCCACTACTTTAGTCTATCTTGGAGAATATCAGGGAGCTGTTGATTGTGCTCGTAAGGCCAATTCCATTAAGGTTTGGAAACAAGTTGGTACCGCTTGTATAGACAAGCGTGAGTTTAGACTTGCTCAAATTTGTGGTTTGAATCTTATCGTCCATGCTGAGGAACTTCCTGGCCTCATCCGACTTTACGAAGAGCGTGGTTATTTCGAAGAGGTTATCTCGTTAATGGAAGCTGGTTTGGGTTTGGAGCGTGCTCATATGGCTTTCTACACCGAACTCGCTATTTTATATGCTAAATACAAGCCCGAGCGTATGATGGAGCATTTGAAACTGTTCTGGGGTAGACTCAATATGGCCAAAGTTATTAGAGCTTGTGATCAAATGCATTTGTGGAATGAAGCTGTTTTCTTATATGTTCATGACCAAAGTTACGATAATGCCGCAGCTGTGATGATGGAGCAACCCGAGGCGTTTGATCATCAATCCTTCAAGGACATTATTGTTCATGTTGCTAATCTCGAGCTTTATTATCGTGCACTTAACTTCTATCTGGAGCAACATCCCATGCTTCTAACTGATTTGTTAGCTGCCCTTACTCCTCGCATCGATCATCCTCGTGTAATTCGTATTTTTGAGAAATCCGAAAATACACCACTTATTTTGAACTTTATGGTTGCCATTCAACATCTTAATATTCAAGCTGTTAACCATGCCTATAATGACTTACTTATTGAGATGGAAGATTACCAATCCTTGCAAGATTCTATTGAGAATTATGATCATTTTGATGCGATTGCTTTGGCCAGACGTCTTGAGAAGCATTCTTTATTGGAGTTTAGACGTATCGCCGCTTACATTTATAGAAAGAACAAACGTTGGACACAATCAATTGAACTTTCCAAGCAAGACCGTTTTTACAAGGATGCCATTATTACTGCCCGCGATTCCGATCAGACTACCATTGCCGAGGATTTAATGAAGTACTTTGTGGAAATTGGCAACTATGAGTGTTTCGCTGCTATTCTATATACTTGCTATCACTTGTTGCGCAACGATTTAGTAATGGAAATTAGCTGGCGTAAGGGCTTACAAGATTACGCTTACCCCTACTTTATTAATTTCCAATGTGAAATGTTTTCAAAAGTTCTCAATTTAGAAAAGGACTTGAAGGATCGACAAGCCGTTAAGTCGGAAGAGGAATCAGCTAGTACAATTGGTGCCGGAATACTTGGCAATACGTTAATGCTTACCCAAGGACCCATGGCTAACAATAATGACCAATTTGATTCTTTCCAACAAGCATCCCCAATGCCAAGACTTGGTAATTTTTAG | |
Amino acid sequence: | Length=1666bp |
BlastP NCBI nr
MAQQLPIRFSEVLQLASVGIQPSSFGFANVTLESDKYVCVRDNPNGVNQVVIVDLEDPSNVLRRPISADSVILHPKKKIIALKAQRQLQVFDLEAKAKINSYVMNQDVVYWTWISDSVIGMVTDTSVFHWTVSGSDPVKMFDRHSSLNGTQIISYKSNYNEEWFTLIGISSRDNRIAGNLQLYSKKRKVSQPLESHASAFAVIQPEGVDHEVQVLALASRLPTGSKLSIVEVDRNPNNPAFATKTVDLFFPPEAVNDFPIAIEIGSTYNVAYVVTKYGFIHVYDLETAKCIYMNRVSGESIFVTTAHKSVNGLMAINRKGQVLSVSINPETIIPYILSNLNDPGLAVRMASHANLPGADNLYMQQFQQLMAQGNYSEAAKVAASSPRGILRTSQVIDQFKLIQAAPGQIAPILQYFGTLLDKGPLNEHETIELARPVLAQNRIQLLEKWYGENKLACTEALGDLVKPYNTPFALKIYETANVPNKVVMCLSELGDFGKLATYTSQQNITPDYVSLLQNLVRVNPDQAAEFATQMFNSNPSINLEKIVDIFMSQNLVQQATAFLLDALKDDNPEHSHLQTRLLEINLINAPQVADAILGNQMFTHFDRAVIASLCERAGLVQRALELYDKPADIKRVIVHSNLLNPEWLMNYFSRFSPDEVYDYLREMLRSNLRQNLQIVVQIATRYSDLVGAQRIIEMFEKFKTFEGLYYYLGSIVNITEDPEVVYKYIQAACLMNQFTEVERICRDNNVYNPEKVKNLLKEAKLADQLPLILVCDRYDFVNDLVFYLFRNNMFQFIEIYVQRINPSKTPQVVGALLDIDCDEELVQNLLMSVVGQVPVDELVEEVERRNRLKLLLPYLESLLQSGSQDRAIYDALAKIYIDSNNNPEVFLKENNFYDTLTVGKYCEKRDPYLAFIAYEKGGNDTEIINLCNENSMFKQLARYLLKRSDSNLWSEVLQDSAYRRPLLDQVIATAVPESSDPEAVSIVVKALMEVDLPSQLIELLEKIVLQPSSFSENANLQNLLFLTAIKADKSRVMEYIDKLDKYDVDEIAEIAIENGLYEEAFRIYKIHNKHEQAMKVLVEDIVSLDRAQDYAETVEQPEVWSRLAKAQLDGIRIPDAIESYLKADDPSNYSEVIELASRAGKYEELIKYLLMARSKMHEPDVDSALLIAYAKTNQLTEMETFLIGSNVADVKAVGDECFESKNYEAAKLMYSSISNWSMLATTLVYLGEYQGAVDCARKANSIKVWKQVGTACIDKREFRLAQICGLNLIVHAEELPGLIRLYEERGYFEEVISLMEAGLGLERAHMAFYTELAILYAKYKPERMMEHLKLFWGRLNMAKVIRACDQMHLWNEAVFLYVHDQSYDNAAAVMMEQPEAFDHQSFKDIIVHVANLELYYRALNFYLEQHPMLLTDLLAALTPRIDHPRVIRIFEKSENTPLILNFMVAIQHLNIQAVNHAYNDLLIEMEDYQSLQDSIENYDHFDAIALARRLEKHSLLEFRRIAAYIYRKNKRWTQSIELSKQDRFYKDAIITARDSDQTTIAEDLMKYFVEIGNYECFAAILYTCYHLLRNDLVMEISWRKGLQDYAYPYFINFQCEMFSKVLNLEKDLKDRQAVKSEEESASTIGAGILGNTLMLTQGPMANNNDQFDSFQQASPMPRLGNF |