Information | |
Gene name: | ptr8 |
Databases ID: | DEG :DEG20090174 OrthoDB:EOG093703C8 UniProt:- |
Organism: | Schizosaccharomyces pombe 972h- |
Function: | transcription factor TFIIH complex ERCC-3 subunit |
Nucleotide sequence: | Length=2415bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGAGCCTAAAGAGAAAAAATAATGCAAGGGAAGGGACACCTGACGAGGATTTAGAAGAATATAGCGATTACAGCGATGTTGACAATTACGGTGAAGAGGATGATGATTCTTACAAGCCTGCACCCAGGATTCGTATAAACAACAATAAAACTAAAGCACAAACCACGACTAATAGCAATGAAGCCCGCCAATCTGGGATTTCTGCTATGTTTGGCCAAAACGATTTTTCTAATTTACTAGGTTTAAAATTGGATCATACGGCTAGGCCACTTTGGATTAATCCAATTGATGGTAGAATTATCCTTGAAGCATTCAGCCCATTGGCTGAGCAAGCTATCGACTTCTTGGTAACAATTTCAGAGCCAGTTTCTCGACCCGCTTTCATTCATGAGTATAGAATTACTGCATATTCACTTTATGCTGCTGTTAGCGTTGGGTTAAAAACTGAAGATATAATAGCAGTCCTTGATAGACTTTCAAAAACCCCAATTCCTCCTTCTATCGTAGACTTTATCCGCGCTTGTACTGTCTCTTACGGTAAGGTCAAACTGGTCTTGAAGAAAAACAGATATTTTATTGAAAGTGGAGATGCAAGTGTTTTACGACTGTTATTAAGAGATCCTGTCATAGGCCCTCTTCGAATCGATTATTCTACCCAGTCTAGCAAGCAGAAGTCTTCAAAGCCTTCCAATGAAGATAATGTGGAAGACAAAAAAGATATCACCAATGATTCCTCAAAAGAAACTGCTGAGAAAAGTTCATCTGATGAACTGTTTTCGGCAGTAGTAGGCTTACAGGAAGAGGAAGATGATGAAGATGCCGTTCATCTTTTCGAAATTAAGCACTCTTCAGTGGAAACTATCAAGAAGAGATGTGCAGAGATTGATTATCCCTTATTGGAAGAGTACGATTTTCGTAATGACAACATCAATCCAGATCTTCCTATAGACCTTAAGCCAAGCACTCAAATTCGTCCATACCAAGAAAAGAGTCTTAGTAAAATGTTTGGAAATGGTAGAGCTCGAAGTGGAATTATTGTATTACCATGTGGAGCTGGTAAAACCTTGGTTGGTATCACAGCGGCTTGTACTATCAAAAAATCAGTAATCGTGCTTTGCACCAGTTCTGTTTCGGTAATGCAATGGCGTCAACAATTTTTACAGTGGAGCAACATCAAGCCTGATCACATTGCGGTTTTTACTGCTGATCACAAAGAACGGTTTCACAGCGAAGCAGGTGTGGTTGTCTCCACGTACTCAATGGTTGCCAATACCAGGAATAGATCCTATGATTCTCAAAAAATGATGGATTTTCTTACGGGACGTGAATGGGGGTTTATCCTATTAGACGAAGTACATGTGGTTCCTGCTGCCATGTTTCGGCGAGTTGTCACCACAATTGCCGCTCACACAAAGCTTGGGTTAACTGCTACGTTAGTTCGTGAGGATGATAAAATTGATGATTTAAATTTTTTGATTGGGCCTAAAATGTACGAAGCAAATTGGATGGATTTGGCACAAAAAGGTCACATCGCTAAGGTTCAATGCGCCGAAGTTTGGTGCGCGATGACCACTGAGTTTTATAATGAATATCTTCGAGAAAACTCCCGAAAAAGAATGCTACTTTATATCATGAATCCTAAAAAATTTCAGGCTTGTCAATTCCTCATCGATTATCACGAAAAACGTGGTGATAAAATTATCGTTTTTTCAGACAATGTCTATGCTTTGCGTGCTTATGCAATAAAATTAGGCAAATATTTTATTTATGGTGGAACTCCACAGCAGGAAAGAATGAGGATTTTGGAAAATTTCCAGTATAATGAACTTGTAAATACCATTTTCCTTTCTAAAGTTGGTGATACGTCTATTGATCTTCCTGAAGCAACCTGTTTGATTCAGATTTCTTCTCATTATGGTTCTAGGCGTCAAGAAGCTCAACGTTTGGGGCGTATTCTTCGTGCCAAGCGACGAAATGATGAAGGCTTTAACGCATTTTTCTATAGCTTGGTATCTAAAGACACTCAGGAAATGTATTATTCCAGTAAACGGCAAGCATTTTTAATTGACCAAGGCTATGCTTTTAAAGTCATCACTAATTTAAAGGGTATGGAGAACTTGCCAAATTTGGCTTACGCCTCCAAAGCGGAGAGACTTGAGCTTTTGCAGGAAGTATTGCTACAAAATGAAGAAGCAGCTGATTTGGATGACGGTGAGGATACTAGCTTTGGATCCAGAAGTCTCTCTAGAGCACCGGCGAAAGCTAAACGTTCTAGTGGTTCTTTAAGTACATTGGCTGGTGCCGACAATATGGCATACGTGGAATATAACAAGAGTGCTAATAAACAGCTGAAAAAGGACAGTAAAGAACATCATGCCTTATTTCGGAAGCACCTGTATACTAAACGTCGCTAG | |
Amino acid sequence: | Length=804bp |
BlastP NCBI nr
MSLKRKNNAREGTPDEDLEEYSDYSDVDNYGEEDDDSYKPAPRIRINNNKTKAQTTTNSNEARQSGISAMFGQNDFSNLLGLKLDHTARPLWINPIDGRIILEAFSPLAEQAIDFLVTISEPVSRPAFIHEYRITAYSLYAAVSVGLKTEDIIAVLDRLSKTPIPPSIVDFIRACTVSYGKVKLVLKKNRYFIESGDASVLRLLLRDPVIGPLRIDYSTQSSKQKSSKPSNEDNVEDKKDITNDSSKETAEKSSSDELFSAVVGLQEEEDDEDAVHLFEIKHSSVETIKKRCAEIDYPLLEEYDFRNDNINPDLPIDLKPSTQIRPYQEKSLSKMFGNGRARSGIIVLPCGAGKTLVGITAACTIKKSVIVLCTSSVSVMQWRQQFLQWSNIKPDHIAVFTADHKERFHSEAGVVVSTYSMVANTRNRSYDSQKMMDFLTGREWGFILLDEVHVVPAAMFRRVVTTIAAHTKLGLTATLVREDDKIDDLNFLIGPKMYEANWMDLAQKGHIAKVQCAEVWCAMTTEFYNEYLRENSRKRMLLYIMNPKKFQACQFLIDYHEKRGDKIIVFSDNVYALRAYAIKLGKYFIYGGTPQQERMRILENFQYNELVNTIFLSKVGDTSIDLPEATCLIQISSHYGSRRQEAQRLGRILRAKRRNDEGFNAFFYSLVSKDTQEMYYSSKRQAFLIDQGYAFKVITNLKGMENLPNLAYASKAERLELLQEVLLQNEEAADLDDGEDTSFGSRSLSRAPAKAKRSSGSLSTLAGADNMAYVEYNKSANKQLKKDSKEHHALFRKHLYTKRR |