Information | |
Gene name: | mtr4 |
Databases ID: | DEG :DEG20090124 OrthoDB:EOG093701NS UniProt:- |
Organism: | Schizosaccharomyces pombe 972h- |
Function: | ATP-dependent RNA helicase, TRAMP complex subunit Mtr4 |
Nucleotide sequence: | Length=3354bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGTTTGGTGGTGAGTTAGATGATGCTTTTGGAGTCTTTGAAGGTAAAGTTCCAAAAAGCTTAAAGGAGGAATCTAAAAATTCACAAAATTCACAAAATTCACAAAAAATAAAGCGTACTTTAACAGATAAAAATGCCTCTAACCAAGAGCAAGGTACAAAAAAGTTGGAGTCTTCAGTAGGGGAACAAGAATCTGCAACTAAAAGAGCTAAAATCGAAAATCTGAAGGATAACCAAGACCTTATTCCTAACAATGATGTTAACGGAATTCATATTAACAATTCTGCAGTCGCTGATACCAAACATAAGCCAAAAATAGGAGACATTGCTGCTGATGATATTTCCAATGAAGTATCTATAAAAAACGAAGGCGATACTATACCTGAGGCTACGGTAGCTGATTCTTTTGAGCAGGAAGCATCATTACAAGTTGCTGGGAAGGTTGGGATGACCGAAGCTAAATCATCTACTGAAGAAGTTGTAGAACTTCGTCATCAGGTCCGTCATCAAGTCTCTATTCCTCCAAATTATGATTATGTACCTATCTCTAAACATAAAAGTCCCATACCCCCTGCGCGCACATATCCCTTCACTTTGGATCCTTTTCAAGCAGTGTCTATTGCCTGTATTGAGCGTCAAGAATCAGTTTTGGTCAGTGCTCATACATCTGCTGGTAAAACTGTTGTTGCAGAATATGCAGTTGCTCAATCGCTTCGTGATAAACAGAGAGTTATTTATACAAGTCCTATCAAAGCTTTAAGTAATCAAAAGTATCGAGAACTTCTTGCTGAATTTGGAGATGTCGGTCTTATGACTGGTGATGTTACTATTAATCCAGATGCTACTTGTTTGGTTATGACCACTGAAATTCTCCGTTCAATGTTGTATCGTGGTTCAGAGGTTATGCGTGAAGTTGCGTGGGTTATTTTTGATGAGATTCACTACATGCGTGACAAAGAGCGCGGTGTTGTTTGGGAAGAGACCATTATCTTATTACCCGACAAATCACATTTTGTCTTCCTGTCTGCTACAATTCCAAATGCTATGCAATTTGCTGAATGGATTACAAAAATTCATCGTCAGCCTTGTCATGTAGTTTATACAGATTTTCGACCTACGCCTCTTCAACATTACCTATTCCCTAGCGGTAGCGATGGCATTCATTTAGTGGTTGATGAGAAAAGTAATTTCCGAGAAGAAAACTTTCAAAGAGCAATGAGTGCATTGATGGAAAAACAAGGCGATGACCCTGCCGCTATGGCTACTAAAGGTAATGCAAAGAAAGGAAAGACCGGAAAAGGCGGTGTCAAAGGACCTTCTGATATTTACAAAATCGTAAAAATGATTATGGTGAAAAATTATAACCCGGTTATTGTATTTAGCTTTAGCAAAAGAGAATGTGAAGCTTTGGCCTTGCAAATGTCAAAGTTAGACATGAACGACCAAACTGAGCGAGATTTGGTCACCACGATTTTTAATAATGCAGTGAACCAATTATCGGAGAAGGATAGAGAGTTACCACAAATAGAGCATATTTTACCTCTTCTTAGACGTGGTATTGGTATTCATCATTCTGGTTTATTGCCAATTTTGAAAGAAGTCATCGAGATTTTGTTTCAGGAAGGCCTTTTAAAGGTTTTGTTCGCTACAGAAACATTTTCTATTGGACTAAATATGCCTGCAAAAACTGTCGTATTTACAAACGTTCGAAAATTCGATGGTAAAACTTTTCGTTGGATATCAGGTGGTGAATACATTCAAATGAGCGGTCGTGCTGGTCGTCGTGGTTTGGATGACCGTGGTATTGTAATTTTAATGATTGACGAAAAAATGGATCCGCCTGTTGCAAAAAGTATGCTTAAAGGTGAAGCTGACCGATTAGATTCTGCATTCCACTTAAGCTACAACATGATTCTTAACCTATTGCGAGTAGAGGGAATTTCCCCCGAGTTCATGCTGGAAAGATGTTTCTTCCAATTTCAGAACAGTTTAGAGGTTCCAAAATTGGAGGCAAAGTTAGAGGAGTCTCAGCAACATTATGATTCTTTTACAATACTTGATGAGCGCCCCTTGGAAGAATATCACACATTAAAAACTCAATTGGAAAGATATCGAACAGATGTTCGTACTGTCGTCAACCACCCCAACTTTTGTCTTTCTTTTTTGCAAGGAGGTCGCCTTGTGCGTGTTAAAGTTGGAAATGAAGACTTTGATTGGGGCGTCGTCGTAAATGTTTCTAAGCGACCACTTCCTAAAGGGCAGTCAAATGAGTACTTACCCCAAGAATCATATATAGTACATACTCTTGTAATGGTGGCTAGCGACACAGGGCCATTGCGTATTAGAAGTGGTCATCTGCCTGAAGTGCATCCACCTGCTGCAGAGGACAAAGGGAAATTTGAAGTTGTTCCCTTTTTATTGTCCTCTTTAGATGGTATTGCCCATATTCGCGTATTTTTACCTAATGATTTAAAGTCTCAAGGTCAAAAGCTTACAGTCGGGAAAGCCTTATCGGAGGTCAAAAGACGCTTTCCTGAAGGAATTACTTTACTAGATCCTGTGGAAAATATGAACATTAAGGAACCTACTTTTATTAAGCTTATGAAGAAAGTAAATATTTTAGAGTCAAGATTGTTGTCAAATCCATTGCATAATTTTTCTGAATTGGAAGAAAAATACGCCGAGTATTTGAGAAAATTAGCCTTACTCGAAGAGGTTAAAGACCTAAAGAAAAAACTTTCCAAAGCTCGCTCGATTATGCAATTAGATGAGCTCAATAGTCGTAAGCGTGTTCTACGTCGTCTCGGATTTACCACTTCTGACGACGTTATTGAAGTTAAGGGCCGTGTAGCTTGCGAGATAAGTTCCGGTGATGGTTTATTATTAACTGAGCTGATCTTCAACGGTATGTTTAACGATTTGACCCCAGAACAATGTGCTGCTCTCCTAAGTTGCTTGGTGTTTCAAGAAAAGAGTGAAGTAGAAAACCAAAGAATGAAAGAAGAGCTTGCCGGTCCTTTGAAAATCTTGCAAGAGATGGCACGTCGGATTGCTAAAGTTTCCAAGGAAAGTAAGCAAGAACTTAATGAAGAGGAATATGTTAATAGTTTTAAGCCATCTCTAATGGAGGTTGTTTATGCTTGGGCACATGGAGCCTCTTTTGCTCAAATCTGCAAAATGACTGATGTTTATGAAGGTTCACTGATCCGCATGTTCAGAAGGCTTGAAGAACTTATACGACAAATGGTTGATGCTGCGAAGGTTATAGGTAATACTTCTTTGCAGCAAAAAATGGAAGACACTATCGCATGCATACATCGGGATATTGTTTTTAGTGCATCACTATATTTGTAG | |
Amino acid sequence: | Length=1117bp |
BlastP NCBI nr
MFGGELDDAFGVFEGKVPKSLKEESKNSQNSQNSQKIKRTLTDKNASNQEQGTKKLESSVGEQESATKRAKIENLKDNQDLIPNNDVNGIHINNSAVADTKHKPKIGDIAADDISNEVSIKNEGDTIPEATVADSFEQEASLQVAGKVGMTEAKSSTEEVVELRHQVRHQVSIPPNYDYVPISKHKSPIPPARTYPFTLDPFQAVSIACIERQESVLVSAHTSAGKTVVAEYAVAQSLRDKQRVIYTSPIKALSNQKYRELLAEFGDVGLMTGDVTINPDATCLVMTTEILRSMLYRGSEVMREVAWVIFDEIHYMRDKERGVVWEETIILLPDKSHFVFLSATIPNAMQFAEWITKIHRQPCHVVYTDFRPTPLQHYLFPSGSDGIHLVVDEKSNFREENFQRAMSALMEKQGDDPAAMATKGNAKKGKTGKGGVKGPSDIYKIVKMIMVKNYNPVIVFSFSKRECEALALQMSKLDMNDQTERDLVTTIFNNAVNQLSEKDRELPQIEHILPLLRRGIGIHHSGLLPILKEVIEILFQEGLLKVLFATETFSIGLNMPAKTVVFTNVRKFDGKTFRWISGGEYIQMSGRAGRRGLDDRGIVILMIDEKMDPPVAKSMLKGEADRLDSAFHLSYNMILNLLRVEGISPEFMLERCFFQFQNSLEVPKLEAKLEESQQHYDSFTILDERPLEEYHTLKTQLERYRTDVRTVVNHPNFCLSFLQGGRLVRVKVGNEDFDWGVVVNVSKRPLPKGQSNEYLPQESYIVHTLVMVASDTGPLRIRSGHLPEVHPPAAEDKGKFEVVPFLLSSLDGIAHIRVFLPNDLKSQGQKLTVGKALSEVKRRFPEGITLLDPVENMNIKEPTFIKLMKKVNILESRLLSNPLHNFSELEEKYAEYLRKLALLEEVKDLKKKLSKARSIMQLDELNSRKRVLRRLGFTTSDDVIEVKGRVACEISSGDGLLLTELIFNGMFNDLTPEQCAALLSCLVFQEKSEVENQRMKEELAGPLKILQEMARRIAKVSKESKQELNEEEYVNSFKPSLMEVVYAWAHGASFAQICKMTDVYEGSLIRMFRRLEELIRQMVDAAKVIGNTSLQQKMEDTIACIHRDIVFSASLYL |