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Gene name: | brr2 |
Databases ID: | DEG :DEG20090142 OrthoDB:EOG0937005A UniProt:- |
Organism: | Schizosaccharomyces pombe 972h- |
Function: | U5 snRNP complex subunit Brr2 (predicted) |
Nucleotide sequence: | Length=6531bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGTCGAGTGCACATCCTAAAGGGGACTCGAAAGAGCCTCCCAAACATGGAAATAGTAAGGAGAAGCCAAACTATGGTCAATCACAGTATAGTTATTCTGCAATGTCAAATTTGGTTACGCAGGCTGATCGAAGATTTGTGTCACGACGTGATGCTGAACCTACAGGCGAACCGGAATCTCTGGTAAATCGAGTTAGTATTGCAGATATGGGTTCTAGAGCGAGAATTGAAAAACCTAGTACCCTTCCTCTCGAATTGACGCAGGAAGTTCAGGAGGTCCGGTTACCTCGTAAAGATGCAGAATCCTTAGAAATTGGTATACGGCAACCTGAACGCGAAAAGCGCTCTTCAGCGATACTTAAATATTTTGATTCTTTTGAAATTTTGAAATATAATCCTCTAACCGACGAGACCCGAGAAGTTTATGATTATATCTTGAGTTTCATTCAACAATACCTTGGCGATCAGTCTCCTGAAATCCTCCGTTCTGCTGCTGATTTGATTATTGAACTTCTTAAGGATAGTTCTTTAGATGAACAAGGTCGTAAAAAGCAAATAGAGGAGGTTTTGAGTACTGAACTCCCACAGGATCGGTTTTCACAGCTCGTTAACTTGGGAAATCGCTTAACAGATTATACAGTTGAGCAAGAAGAAGAGTTAAATGAAGAAGGCGTTAATGAATCTGGCGTACCAGTATTGTTCAATGAAGCCGATGAAGAGGAAGAAGCTGTTGAGGCAATGGAAGAGGATGAAGTGGCAGAAGATGAAGACGTCGTCTTAGAAACTTCCATATCTCAAGAAGAAGAGAAAAAGAATATTGAAAATCCGGATACAGAGGTTACATTTATTTCTGCTGATACCAAAAAAGTTACCGAAATACCCACTGTTCATCCTCGTGAAATCGATGCATTTTGGCTGCAACGAGAAATAGCAAAATATTTTGCTGACGCCGTCGTTTGTCAGGAAAAAACAAATCAAGCGTTTGAGGCACTTTCGGCTGATTACGATCTCGGTGAATTGGAAAATGAATTGATGAGTATTTTTGATTATGAACATTTCTATCTTGTTCAACTTTTGACTAAGAATCGTTGGACAATAGTTTCGTGTACAATGTTAAAACGCGCCGCTACTGATGAAGAACGCTTAGGTGTGGAAGAGCAAATTCGTGCTGCTGGTCGGTCTTGGATTCTCGAAGCTCTACGCCCTGGTGCTATCACTATACCTGATGACGGTTTAAATGAATTAAATAATAATGTTGTTGAGAAAGCTGAACCTGCGCCCGTTTCTGAAATTCCACTTTCGAAAACTTTGACTTCCCATAAAATTGTACCTAAGCACCAAGTTGATCTAGAAAATTATGTGTTTACTGAGGGATCACGTCTCATGTCTAATAAAGCTGTCAAGCTACCTGAAGGCTCGTTTCGTAGGACTGGTAAAGGGTATGAAGAAATACATGTTCCTGCCCCCAACAAAGCCGTACTTGGCGCTGACGAGCGTCTTGTAAAAATCAAGGAACTGCCTGAATGGTCTCATCAAGCTTTTCTTAATACTCAATCTTTAAACCGAATCCAAAGCCATCTTTATCCTATCGCTTTTGGTACTGACGAAAACATCCTTTTATGCGCTCCTACTGGTGCTGGAAAAACAAATGTAGCAATGCTATGTATCCTTAACGAATTACAAAAACATTTACGTGAAGATCTTAGCTTTAACTTACAAAATTTTAAAATTGTTTACATTGCTCCCTTGAAGGCGTTGGTACAAGAGATGGTTAATAATTTCTCAAAGAGGCTTACTCCATACAATATTCGAGTCGCAGAGTTAACTGGTGATAGTCAATTGACTAAACAACAAATTAGTGAAACTCAAATAATTGTAACCACACCCGAGAAGTGGGATATTATAACTCGAAAAGCTAATGATTTATCTTATGTCAATCTAGTCCGTTTAGTTATTATTGATGAGGTTCATTTGCTTCATGATGAACGAGGTCCTGTATTAGAATCTATAGTTGCTCGTATATTTCGCCATCAGGAGGAAACTCTTGAACAAGTTCGATTAGTAGGTTTGTCTGCTACACTTCCTAATTATACCGATGTTGCCAGTTTTTTACATGTCGACCCTAAAAAAGGGCTTTTTTACTTCGATTCGACATATCGTCCATGCCCTTTAAAGCAAGAATTTATAGGCATTACAGAAAAAACACCGTTTAAACGAATGCAGACGACTAATGAAGCTTGTTATGAAAAAGTTATGCAACACGCTGGCAAAAACCAGGTCCTCATATTTGTACATTCGCGCAAAGAAACCGCTAAAACCGCTCGTTTTATAAGAGATAAGGCACTAGAGGAAGAGACCATCGGTCATTTGTTACGCTCTGATGCCGCATCCCGTGAAATTCTTCGGGCTGAAGCCGACTCTACCAGTGATGAAAATTTGAAAGATTTGCTCCCATATGGGTTTGCCATACATCATGCTGGTATGCGACGAGAGGATCGCCAAACGTCTGAAGACCTTTTTGCCGATGGTACTATACAGGTACTAGTGAGTACGGCAACTCTGGCTTGGGGCGTAAACTTACCAGCGCACACAGTGATCATCAAAGGGACCCAAGTTTATTCTCCTGAAAAGGGTATCTGGACAGAACTCTCTCCTCAGGATGTTTTGCAAATGCTTGGCAGAGCTGGTCGCCCACAATTCGACACATATGGTGAAGGAATTATCATTACCGCCCACTCTGAGTTACAGTATTATCTATCACTAATGAATCAGCAGCTTCCAATTGAGTCTCAATTTATGCGCCGTCTAGCTGATTGTTTAAATGCCGAAGTATCGTTAGGAACTGTTCGTAGTATCGAAGATGGCGTAGACTGGCTTGGTTATACATACCTCTATGTTCGAATGTTACGATCCCCTGCCCTATATAGCGTCGGCCCAGAGTATGATGATGACAAATATCTTGTTCAAAAAAGAGCTGACTTACTTCATTCAGCTGCCATTTTATTAGAAAAATGCAAGTTACTAGTGTATAATCGTCAGAGTGGTACGTTGACCGCTACGGAATTGGGAAAAGTTGCTGCAAGTTATTACGTTACTCATAACTCGATGGCCATATATAATCGTCTTTTAATGCAGACAACATCCTTTATCGAGTTATTTCGAGTCTTCAGTTTTTCTGATGAATTTAAGCACATTCCTGTCCGTGAAGAAGAGAAAGTTGAACTCGCGAAGTTGCTGGAAAGAGTACCAATTCCTATTAGGGAAAGATTAGATGAACCTGCTGCCAAGATTAATGCCCTTCTCCAATCATATATATCAAGACAACGCCTGGATGGATTTGCACTTGTGGCAGACATGGTATACGTTACGCAATCAGCGGGTAGAATTATGCGTGCAATATTCGAGATATCATTGAGACGTGGTTGGTCATCTGTTGCAACACTCTCTCTTGATACATGCAAAATGATTGAGAAAAGGCTTTGGCCAACTATGAGCCCCCTTCGACAGTTTCCCAATTGTCCTTCTGAAGTAATACGCCGCGTTGAGAAAAAGGAATTTCCTTGGCAGCGATACTTTGATCTGGACCCTGCTGAATTAGGAGAATTAGTAGGGGTGCCAAAAGAAGGGAGGCGTGTGTACAACATGGTTCAGTCTTTTCCAAGGTTGAGCGTCGAAGCACATGTTCAACCTATCACAAGATCGCTTGTGCGGGTCGAACTTGTTATAAATTCTCAGTTCAACTGGGATGATCATTTAAGCGGCACTTCTGAAGCTTTTTGGATCCTTGTAGAAGACGTGGACGGGGACCGATTGCTACATTATGAACAATTTTTCCTTCTTAAAAAATACAAAGATGATGAGCATATTGTAAATTTTACAGTACCTTTGTTAGAACCTCTTCCTCCTTGTTACTTTATAAAGATAGTTTCAGATCGATGGTTACACTCGATAACTAAGGTACCTCTTTCATTTCAGCGCCTGATAATGCCAGAAAAATTTCCTGCGCCAACACCTCTTCTTGATCTTCAGAACGCCCCGGTCTCTAGTCTTAATAACCCAAGCTTCATTTCCCTCTACCCTAATTTTAAATTTTTTAACAAGATTCAAACACAGGTGTTTAACTCTGTTTATAAAACCAACGATAGTGTTTTTATTGGTGCTCCCAATGGAAGTGGAAAGACTGTTTGTGCCGAACTTGCTTTGTTACATCATTGGAGTCAAGAAGATTATGGTACTGCAGTTTACATTGCCCCAATTCAGGAAATCGTTGATCGTCGATATGAAGAATGGTATGGCAAGTTTTCTGACCTCGGTGATGGGAAAGTTTTGGTAAAATTGACGGGTGAGCGTTCACAAGACTTGAAGCTGATACAAGTTGCTGACTTGATATTTTGCACGCCATCGCAATGGGACTCATTGTCGAAGAGATGGAGAAGTATGCGAAGCATTCAGAAAGTTGATTTTTATATATGTGATGAATTACAATTGCTTGGTGGATTTTATGGTCCATTATACGAAATAGTGATCTCACGGATACGGTACATGGCAGTACAATTAGAAAAAAATATCCGAGTGGTTGGCCTTTCAGTATCTGTTGCTAATGCTCGAGATTTGGGTGAGTGGCTTGGGACTAGTCCACAATGCATATTTAATTTTAGTCCTAAAGACAGGCCTAATCCTCTTACTATTCATTTGCAATCATTCAGTATTACTCATTTCCCTTCCCTTATGTTGGCTATGAGCAAGCCTATATATCGCAGCTTGAAGAACTTTATTTCTCAGAGAAAGTCTACTATTGTATTTACTCCTGACAGGAAAGTAGCGAAACAATTAGCTTTTGATTTAGTTACATTCAGTATGGCTGATGAAGATGAGTATTTGTTTTCGTTAATGGAGAATGAAGCTTTCAATAAAGTTGAAGATGCTGCCTTGCAGCAATCATTGAAGCATGGTATTGCTTATATTAGTGAAATCACATCGTCCAATGATCAGAATATTGT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| |
Amino acid sequence: | Length=2176bp |
BlastP NCBI nr
MSSAHPKGDSKEPPKHGNSKEKPNYGQSQYSYSAMSNLVTQADRRFVSRRDAEPTGEPESLVNRVSIADMGSRARIEKPSTLPLELTQEVQEVRLPRKDAESLEIGIRQPEREKRSSAILKYFDSFEILKYNPLTDETREVYDYILSFIQQYLGDQSPEILRSAADLIIELLKDSSLDEQGRKKQIEEVLSTELPQDRFSQLVNLGNRLTDYTVEQEEELNEEGVNESGVPVLFNEADEEEEAVEAMEEDEVAEDEDVVLETSISQEEEKKNIENPDTEVTFISADTKKVTEIPTVHPREIDAFWLQREIAKYFADAVVCQEKTNQAFEALSADYDLGELENELMSIFDYEHFYLVQLLTKNRWTIVSCTMLKRAATDEERLGVEEQIRAAGRSWILEALRPGAITIPDDGLNELNNNVVEKAEPAPVSEIPLSKTLTSHKIVPKHQVDLENYVFTEGSRLMSNKAVKLPEGSFRRTGKGYEEIHVPAPNKAVLGADERLVKIKELPEWSHQAFLNTQSLNRIQSHLYPIAFGTDENILLCAPTGAGKTNVAMLCILNELQKHLREDLSFNLQNFKIVYIAPLKALVQEMVNNFSKRLTPYNIRVAELTGDSQLTKQQISETQIIVTTPEKWDIITRKANDLSYVNLVRLVIIDEVHLLHDERGPVLESIVARIFRHQEETLEQVRLVGLSATLPNYTDVASFLHVDPKKGLFYFDSTYRPCPLKQEFIGITEKTPFKRMQTTNEACYEKVMQHAGKNQVLIFVHSRKETAKTARFIRDKALEEETIGHLLRSDAASREILRAEADSTSDENLKDLLPYGFAIHHAGMRREDRQTSEDLFADGTIQVLVSTATLAWGVNLPAHTVIIKGTQVYSPEKGIWTELSPQDVLQMLGRAGRPQFDTYGEGIIITAHSELQYYLSLMNQQLPIESQFMRRLADCLNAEVSLGTVRSIEDGVDWLGYTYLYVRMLRSPALYSVGPEYDDDKYLVQKRADLLHSAAILLEKCKLLVYNRQSGTLTATELGKVAASYYVTHNSMAIYNRLLMQTTSFIELFRVFSFSDEFKHIPVREEEKVELAKLLERVPIPIRERLDEPAAKINALLQSYISRQRLDGFALVADMVYVTQSAGRIMRAIFEISLRRGWSSVATLSLDTCKMIEKRLWPTMSPLRQFPNCPSEVIRRVEKKEFPWQRYFDLDPAELGELVGVPKEGRRVYNMVQSFPRLSVEAHVQPITRSLVRVELVINSQFNWDDHLSGTSEAFWILVEDVDGDRLLHYEQFFLLKKYKDDEHIVNFTVPLLEPLPPCYFIKIVSDRWLHSITKVPLSFQRLIMPEKFPAPTPLLDLQNAPVSSLNNPSFISLYPNFKFFNKIQTQVFNSVYKTNDSVFIGAPNGSGKTVCAELALLHHWSQEDYGTAVYIAPIQEIVDRRYEEWYGKFSDLGDGKVLVKLTGERSQDLKLIQVADLIFCTPSQWDSLSKRWRSMRSIQKVDFYICDELQLLGGFYGPLYEIVISRIRYMAVQLEKNIRVVGLSVSVANARDLGEWLGTSPQCIFNFSPKDRPNPLTIHLQSFSITHFPSLMLAMSKPIYRSLKNFISQRKSTIVFTPDRKVAKQLAFDLVTFSMADEDEYLFSLMENEAFNKVEDAALQQSLKHGIAYISEITSSNDQNIVQYLYRHGLIKVLIASRDVIYSLKAKSNAVIVMGTQYYDGKEHRYIDYPISELLQMLGFTASIGSSELSQVILMTVTTKKEYYKKFLNEPLPMESHLQVWLHDAFVSEISTQTIESKQDAVDWLTWSYMYRRLVANPAYYGLQDITHESVSEFLSDLVETTMNDLSEARLITVDDEDDSCVALNLAMIASHYGITYITMQTFALSLSERTKMKGLLEIVTSAAEYEQLPIRKYEDIVLERIHSRLPVRLSNPNYEDPHTKSFILLAAHFSRFELPPGLVIDQKFILTRVHNLLGACVDTLSSEGHLIACIRPMEMSQMVTQALWDRDSPLKQIPYFDDALIERCNKEGVHDVFDIIDLDDEKRTELLHMDNAHLAKCAEFINKYPDIDIDFEIEDSEDVHANSPSVLIVQLTRELEEDEEVDTTVIAPYFPAQKTEHWWLVISDDKTLLAIKKITLGRSLTTKMEFVPPAMGTLKYKLSCFSDSYMGVDYEKEFECNVLEPLDTEMEDGE |