| Information | |
| Gene name: | BRR2 |
| Databases ID: | DEG :DEG20010315 OrthoDB:EOG0937005A UniProt:- |
| Organism: | Saccharomyces cerevisiae |
| Function: | RNA-dependent ATPase RNA helicase (DEIH box); required for disruption of U4/U6 base-pairing in native snRNPs to activate the spliceosome for catalysis; homologous to human U5-200kD |
| Nucleotide sequence: | Length=6492bp |
| BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGACTGAGCATGAAACGAAGGATAAGGCCAAAAAAATTAGAGAAATTTATCGTTATGATGAGATGTCCAATAAGGTGTTGAAAGTTGATAAACGCTTTATGAATACCAGCCAAAATCCTCAAAGGGATGCGGAAATATCACAACCAAAATCCATGAGTGGTAGAATTAGTGCTAAGGATATGGGACAGGGCCTGTGCAATAACATTAATAAAGGACTAAAAGAAAATGATGTAGCCGTTGAAAAAACTGGAAAGAGCGCATCATTGAAAAAAATTCAGCAGCATAACACCATTTTGAATTCTTCCTCCGATTTCAGGTTACATTATTATCCAAAGGATCCCTCAAATGTCGAAACTTACGAGCAGATTTTGCAGTGGGTTACAGAAGTTTTAGGCAATGATATACCCCATGATCTTATTATTGGAACTGCTGATATATTCATCAGACAATTGAAAGAAAATGAGGAAAATGAGGATGGTAATATTGAAGAGCGAAAGGAAAAGATCCAGCATGAGCTAGGCATCAATATAGACTCCCTGAAGTTTAACGAATTAGTTAAACTTATGAAAAACATTACCGATTATGAAACACATCCTGACAATAGCAATAAACAAGCAGTAGCAATTCTTGCCGATGATGAAAAATCAGATGAAGAAGAAGTAACAGAAATGTCCAACAATGCTAATGTTCTTGGGGGAGAAATCAATGATAATGAAGATGATGATGAGGAATATGATTACAATGACGTTGAAGTCAATTCTAAAAAAAAAAACAAGAGGGCATTGCCAAACATTGAAAACGATATAATTAAACTCTCCGATAGTAAAACAAGTAATATCGAGAGCGTTCCGATATACTCAATCGATGAATTTTTTTTGCAGAGAAAACTTCGGTCAGAGCTTGGTTACAAGGATACCTCTGTAATACAAGACCTGTCAGAAAAAATTTTGAATGATATTGAAACACTTGAGCATAATCCAGTAGCGTTGGAGCAGAAGTTGGTTGATCTGCTTAAATTCGAGAATATATCACTGGCTGAATTTATTCTCAAGAATAGATCTACAATTTTTTGGGGCATACGACTGGCGAAGAGCACAGAGAATGAAATACCGAACTTAATAGAGAAAATGGTTGCAAAAGGTTTGAATGATCTTGTGGAACAGTATAAATTTAGAGAAACTACACACTCAAAGCGTGAACTCGATTCCGGTGACGACCAGCCACAGTCTTCGGAAGCAAAAAGAACAAAATTCAGTAATCCAGCAATACCGCCCGTCATAGATTTGGAAAAGATTAAATTCGACGAAAGTTCTAAATTAATGACCGTGACAAAAGTATCCCTACCGGAAGGATCATTCAAAAGGGTGAAACCACAATATGACGAAATACATATTCCAGCTCCTAGCAAACCTGTTATTGATTATGAGTTGAAAGAAATTACTTCTCTACCAGATTGGTGTCAGGAGGCGTTTCCTTCATCGGAAACAACGTCCTTAAACCCTATACAATCAAAGGTTTTTCACGCAGCATTTGAAGGTGATTCAAACATGCTAATATGTGCACCCACTGGTTCAGGTAAGACGAATATCGCGTTATTGACGGTATTGAAAGCCTTATCCCATCATTATAACCCGAAAACTAAGAAATTAAACCTTTCTGCATTTAAAATTGTTTATATAGCACCCTTGAAAGCCTTAGTACAGGAACAAGTCCGAGAATTTCAAAGGAGGTTGGCTTTTCTAGGTATAAAAGTCGCTGAATTGACTGGTGATTCTAGGCTTAGTAGAAAGCAAATTGACGAGACGCAGGTTTTGGTGTCTACGCCAGAGAAATGGGACATAACTACTAGAAATTCAAATAATTTGGCCATCGTAGAACTTGTTCGTTTGTTGATTATAGATGAAATACATTTGTTACATGATGACAGGGGACCAGTATTGGAAAGCATCGTGGCTAGGACATTTTGGGCTTCCAAATATGGCCAGGAATACCCCAGAATAATAGGCCTTTCTGCCACCTTACCAAATTATGAGGATGTCGGTAGGTTTTTAAGAGTTCCGAAGGAAGGATTGTTTTATTTTGACTCCTCATTTAGACCGTGTCCTCTATCTCAACAGTTTTGTGGCATTAAGGAACGGAACTCCTTGAAAAAGCTGAAGGCTATGAATGATGCTTGTTATGAAAAGGTATTGGAATCCATCAATGAAGGTAATCAAATAATCGTGTTTGTTCATTCTCGAAAAGAAACATCACGAACAGCAACATGGTTGAAAAATAAATTTGCTGAAGAGAACATTACTCATAAATTAACCAAAAATGATGCAGGATCGAAGCAGATTTTAAAGACAGAAGCAGCCAACGTACTCGATCCAAGTCTACGAAAGTTGATTGAAAGCGGTATAGGGACGCATCACGCAGGGCTGACCAGAAGTGACAGATCCTTATCTGAAGATTTATTTGCAGACGGGTTGTTGCAAGTATTGGTATGCACTGCGACGTTAGCATGGGGTGTTAATCTACCTGCTCATACAGTGATTATAAAAGGAACAGATGTCTATTCACCTGAAAAGGGGTCCTGGGAACAACTTTCTCCACAAGATGTACTTCAAATGTTAGGTAGAGCAGGCAGACCGAGATATGACACATTTGGCGAGGGTATTATAATAACAGACCAATCGAATGTTCAATATTATCTCTCGGTTTTAAATCAACAATTACCAATAGAATCGCAATTTGTTTCAAAATTAGTTGACAACTTAAATGCAGAAGTTGTCGCGGGTAACATTAAGTGCAGGAATGATGCTGTGAATTGGTTGGCGTATACTTACCTATATGTCAGAATGTTAGCTTCCCCTATGCTTTACAAAGTACCTGATATTTCAAGTGATGGGCAATTGAAAAAGTTTAGAGAAAGCTTAGTCCATTCGGCCCTATGCATTTTAAAAGAACAAGAGTTGGTGTTATATGATGCTGAAAATGATGTAATTGAGGCGACCGATCTAGGAAATATAGCGTCGTCATTTTACATAAATCATGCTTCCATGGATGTTTACAATAGAGAGTTAGATGAACATACAACTCAGATTGATCTTTTTAGAATATTCTCAATGTCGGAAGAGTTTAAGTACGTATCGGTGAGATATGAAGAGAAAAGAGAACTAAAACAACTTCTAGAGAAAGCACCCATTCCTATCAGAGAAGATATTGATGATCCTTTAGCAAAAGTGAATGTACTACTGCAGTCTTATTTTTCCCAGCTAAAGTTCGAAGGTTTTGCACTTAATTCTGATATAGTGTTTATTCACCAAAATGCTGGTAGGTTATTGCGTGCTATGTTTGAAATATGCTTGAAGAGAGGATGGGGACATCCCACACGGATGTTGTTAAATCTTTGCAAATCTGCCACAACTAAAATGTGGCCAACAAACTGTCCTTTAAGACAGTTTAAAACATGCCCTGTCGAAGTGATTAAAAGGCTGGAAGCCTCTACAGTACCGTGGGGAGATTATCTACAGCTAGAAACACCTGCCGAAGTTGGTCGTGCAATCAGATCTGAAAAATATGGAAAACAGGTTTACGATTTATTGAAAAGATTTCCCAAAATGTCCGTAACATGCAACGCTCAGCCAATTACCCGTAGCGTTATGAGGTTCAACATTGAAATAATAGCCGACTGGATATGGGATATGAATGTACACGGTTCCCTTGAACCTTTTTTGCTCATGCTAGAAGACACTGATGGTGATTCAATACTTTATTATGACGTACTATTCATCACTCCAGATATAGTTGGTCATGAATTTACCTTATCCTTTACTTATGAGTTAAAGCAGCACAATCAAAATAACTTACCACCTAATTTCTTCCTTACTTTGATATCAGAAAATTGGTGGCACAGTGAATTCGAGATTCCAGTTTCCTTCAATGGATTTAAACTTCCGAAAAAATTTCCTCCTCCTACTCCCCTTCTGGAGAATATTAGTATTTCAACATCAGAGCTTGGCAATGATGATTTTTCCGAAGTATTTGAATTTAAAACTTTCAACAAGATTCAGAGCCAGGTCTTCGAGTCTCTCTACAATTCGAATGACTCGGTCTTTGTAGGTTCAGGAAAGGGCACAGGTAAAACAGCTATGGCTGAATTAGCACTGTTAAATCATTGGAGACAGAATAAAGGAAGAGCGGTTTATATCAATCCGTCTGGGGAAAAAATTGATTTTTTGCTATCTGATTGGAATAAAAGGTTCTCTCATCTTGCTGGTGGTAAGATAATAAATAAGCTAGGAAATGATCCTTCACTAAATTTAAAATTATTAGCAAAAAGCCATGTTCTCTTGGCTACCCCCGTGCAATTTGAGCTTTTGTCACGTCGTTGGAGACAAAGGAAGAACATCCAAAGTTTAGAATTAATGATATATGATGACGCTCATGAGATTAGCCAAGGTGTTTACGGTGCTGTGTATGAAACGCTAATTTCTAGAATGATATTTATAGCAACCCAACTTGAAAAGAAAATTCGATTTGTTTGCCTTTCGAACTGTTTGGCAAATGCTCGTGATTTTGGTGAATGGGCTGGTATGACGAAGTCAAACATCTACAACTTTTCTCCAAGCGAAAGAATTGAGCCTCTTGAAATTAATATTCAGTCATTTAAAGATGTTGAGCACATATCATTCAATTTTTCGATGCTTCAAATGGCATTTGAAGCATCTGCTGCTGCAGCGGGAAATCGTAATTCCAGTTCGGTGTTCTTACCATCTAGAAAGGATTGTATGGAAGTTGCGTCTGCATTTATGAAGTTTTCAAAAGCAATTGAATGGGATATGTTGAACGTTGAAGAAGAGCAAATTGTACCATACATTGAAAAGTTAACAGATGGTCATCTAAGAGCACCTTTAAAACACGGTGTTGGTATTTTGTATAAGGGGATGGCATCAAATGATGAAAGAATTGTGAAAAGGTTATACGAATATGGTGCGGTATCGGTTTTACTCATTTC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| |
| Amino acid sequence: | Length=2163bp |
| BlastP NCBI nr
MTEHETKDKAKKIREIYRYDEMSNKVLKVDKRFMNTSQNPQRDAEISQPKSMSGRISAKDMGQGLCNNINKGLKENDVAVEKTGKSASLKKIQQHNTILNSSSDFRLHYYPKDPSNVETYEQILQWVTEVLGNDIPHDLIIGTADIFIRQLKENEENEDGNIEERKEKIQHELGINIDSLKFNELVKLMKNITDYETHPDNSNKQAVAILADDEKSDEEEVTEMSNNANVLGGEINDNEDDDEEYDYNDVEVNSKKKNKRALPNIENDIIKLSDSKTSNIESVPIYSIDEFFLQRKLRSELGYKDTSVIQDLSEKILNDIETLEHNPVALEQKLVDLLKFENISLAEFILKNRSTIFWGIRLAKSTENEIPNLIEKMVAKGLNDLVEQYKFRETTHSKRELDSGDDQPQSSEAKRTKFSNPAIPPVIDLEKIKFDESSKLMTVTKVSLPEGSFKRVKPQYDEIHIPAPSKPVIDYELKEITSLPDWCQEAFPSSETTSLNPIQSKVFHAAFEGDSNMLICAPTGSGKTNIALLTVLKALSHHYNPKTKKLNLSAFKIVYIAPLKALVQEQVREFQRRLAFLGIKVAELTGDSRLSRKQIDETQVLVSTPEKWDITTRNSNNLAIVELVRLLIIDEIHLLHDDRGPVLESIVARTFWASKYGQEYPRIIGLSATLPNYEDVGRFLRVPKEGLFYFDSSFRPCPLSQQFCGIKERNSLKKLKAMNDACYEKVLESINEGNQIIVFVHSRKETSRTATWLKNKFAEENITHKLTKNDAGSKQILKTEAANVLDPSLRKLIESGIGTHHAGLTRSDRSLSEDLFADGLLQVLVCTATLAWGVNLPAHTVIIKGTDVYSPEKGSWEQLSPQDVLQMLGRAGRPRYDTFGEGIIITDQSNVQYYLSVLNQQLPIESQFVSKLVDNLNAEVVAGNIKCRNDAVNWLAYTYLYVRMLASPMLYKVPDISSDGQLKKFRESLVHSALCILKEQELVLYDAENDVIEATDLGNIASSFYINHASMDVYNRELDEHTTQIDLFRIFSMSEEFKYVSVRYEEKRELKQLLEKAPIPIREDIDDPLAKVNVLLQSYFSQLKFEGFALNSDIVFIHQNAGRLLRAMFEICLKRGWGHPTRMLLNLCKSATTKMWPTNCPLRQFKTCPVEVIKRLEASTVPWGDYLQLETPAEVGRAIRSEKYGKQVYDLLKRFPKMSVTCNAQPITRSVMRFNIEIIADWIWDMNVHGSLEPFLLMLEDTDGDSILYYDVLFITPDIVGHEFTLSFTYELKQHNQNNLPPNFFLTLISENWWHSEFEIPVSFNGFKLPKKFPPPTPLLENISISTSELGNDDFSEVFEFKTFNKIQSQVFESLYNSNDSVFVGSGKGTGKTAMAELALLNHWRQNKGRAVYINPSGEKIDFLLSDWNKRFSHLAGGKIINKLGNDPSLNLKLLAKSHVLLATPVQFELLSRRWRQRKNIQSLELMIYDDAHEISQGVYGAVYETLISRMIFIATQLEKKIRFVCLSNCLANARDFGEWAGMTKSNIYNFSPSERIEPLEINIQSFKDVEHISFNFSMLQMAFEASAAAAGNRNSSSVFLPSRKDCMEVASAFMKFSKAIEWDMLNVEEEQIVPYIEKLTDGHLRAPLKHGVGILYKGMASNDERIVKRLYEYGAVSVLLISKDCSAFACKTDEVIILGTNLYDGAEHKYMPYTINELLEMVGLASGNDSMAGKVLILTSHNMKAYYKKFLIEPLPTESYLQYIIHDTLNNEIANSIIQSKQDCVDWFTYSYFYRRIHVNPSYYGVRDTSPHGISVFLSNLVETCLNDLVESSFIEIDDTEAEVTAEVNGGDDEATEIISTLSNGLIASHYGVSFFTIQSFVSSLSNTSTLKNMLYVLSTAVEFESVPLRKGDRALLVKLSKRLPLRFPEHTSSGSVSFKVFLLLQAYFSRLELPVDFQNDLKDILEKVVPLINVVVDILSANGYLNATTAMDLAQMLIQGVWDVDNPLRQIPHFNNKILEKCKEINVETVYDIMALEDEERDEILTLTDSQLAQVAAFVNNYPNVELTYSLNNSDSLISGVKQKITIQLTRDVEPENLQVTSEKYPFDKLESWWLVLGEVSKKELYAIKKVTLNKETQQYELEFDTPTSGKHNLTIWCVCDSYLDADKELSFEINVK | |