| Information | |
| Gene name: | Col1a1 |
| Databases ID: | DEG :DEG20050055 OrthoDB:EOG093704AJ UniProt:P11087 |
| Organism: | Mus musculus |
| Function: | Collagen alpha-1(I) chain precursor (Alpha-1 type I collagen). [Source:Uniprot/SWISSPROT;Acc:P11087] |
| Nucleotide sequence: | Length=4362bp |
| BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGTTCAGCTTTGTGGACCTCCGGCTCCTGCTCCTCTTAGGGGCCACTGCCCTCCTGACGCATGGCCAAGAAGACATCCCTGAAGTCAGCTGCATACACAATGGCCTAAGGGTCCCCAATGGTGAGACGTGGAAACCCGAGGTATGCTTGATCTGTATCTGCCACAATGGCACGGCTGTGTGCGATGACGTGCAATGCAATGAAGAACTGGACTGTCCCAACCCCCAAAGACGGGAGGGCGAGTGCTGTGCTTTCTGCCCGGAAGAATACGTATCACCAAACTCAGAAGATGTAGGAGTCGAGGGACCCAAGGGAGACCCTGGCCCCCAAGGCCCAAGGGGACCCGTTGGCCCCCCTGGACGAGATGGCATCCCTGGACAGCCTGGACTTCCTGGTCCTCCTGGTCCCCCTGGGCCCCCCGGACCCCCTGGCCTTGGAGGAAACTTTGCTTCCCAGATGTCCTATGGCTATGATGAAAAATCAGCTGGAGTTTCCGTGCCTGGCCCCATGGGTCCTTCTGGTCCTCGTGGTCTCCCTGGCCCCCCTGGTGCACCTGGTCCACAAGGTTTCCAAGGCCCCCCTGGTGAACCTGGCGAGCCTGGCGGTTCAGGTCCAATGGGTCCCCGAGGTCCCCCTGGCCCTCCTGGCAAGAATGGAGATGATGGGGAAGCTGGCAAGCCCGGCCGTCCTGGTGAGCGTGGACCTCCTGGACCTCAGGGTGCTCGTGGATTGCCTGGAACAGCTGGCCTCCCTGGAATGAAGGGACACCGAGGCTTCAGTGGTTTGGATGGTGCCAAAGGAGATGCTGGTCCTGCTGGTCCTAAGGGAGAGCCCGGCAGTCCTGGTGAAAACGGAGCTCCTGGCCAGATGGGTCCCCGAGGTCTGCCCGGTGAGAGAGGTCGCCCTGGACCTCCTGGCACTGCTGGTGCTCGCGGTAACGATGGTGCTGTTGGTGCTGCTGGACCCCCTGGTCCCACCGGCCCCACTGGCCCTCCTGGCTTCCCTGGTGCAGTTGGTGCTAAGGGTGAAGCTGGTCCCCAAGGAGCTAGAGGCTCTGAAGGTCCCCAGGGTGTGCGTGGTGAGCCCGGACCCCCTGGCCCTGCTGGTGCTGCCGGCCCTGCTGGAAACCCTGGTGCTGATGGACAACCTGGCGCTAAAGGTGCCAATGGTGCTCCTGGTATTGCTGGTGCTCCTGGCTTCCCTGGTGCCCGAGGCCCCTCTGGACCCCAGGGCCCCAGCGGCCCTCCAGGTCCCAAGGGTAACAGTGGTGAACCTGGTGCTCCTGGCAACAAAGGAGACACTGGTGCCAAAGGAGAACCCGGTGCTACTGGAGTTCAAGGTCCCCCAGGCCCTGCCGGAGAAGAAGGAAAACGAGGAGCCCGTGGTGAGCCTGGACCTTCCGGACTGCCTGGACCTCCTGGCGAGCGTGGTGGACCTGGTAGCCGTGGTTTCCCTGGTGCTGATGGTGTTGCTGGCCCCAAGGGTCCTTCCGGTGAACGTGGTGCTCCCGGACCTGCTGGTCCCAAAGGTTCTCCTGGTGAAGCTGGTCGCCCCGGTGAAGCTGGTCTCCCTGGTGCCAAGGGTCTCACTGGCAGTCCTGGCAGCCCTGGTCCTGATGGCAAAACCGGCCCCCCTGGTCCCGCTGGTCAAGATGGTCGCCCTGGACCCGCAGGTCCTCCTGGAGCCCGTGGCCAGGCTGGTGTGATGGGATTCCCTGGACCTAAGGGTACCGCTGGAGAACCTGGAAAGGCTGGAGAGCGAGGCCTTCCCGGACCCCCTGGCGCTGTTGGTCCTGCTGGCAAAGATGGAGAAGCTGGAGCTCAGGGAGCCCCTGGCCCTGCTGGTCCTGCTGGTGAGAGAGGTGAACAAGGTCCCGCTGGCTCCCCTGGATTCCAGGGTCTTCCTGGTCCTGCCGGTCCTCCTGGTGAAGCAGGCAAGCCTGGTGAACAGGGTGTTCCTGGAGACCTTGGTGCCCCTGGACCCTCTGGCGCAAGAGGCGAGAGAGGTTTCCCTGGTGAACGTGGTGTACAAGGTCCCCCAGGTCCTGCTGGTCCCCGAGGAAACAATGGTGCCCCCGGCAACGATGGTGCCAAGGGTGATACTGGTGCCCCCGGAGCTCCCGGTAGCCAGGGTGCCCCCGGTCTTCAGGGAATGCCTGGTGAACGTGGTGCAGCTGGTCTTCCAGGTCCTAAGGGTGACAGAGGTGATGCTGGTCCCAAAGGTGCTGATGGTTCTCCTGGTAAAGATGGTGCCCGTGGTCTGACTGGTCCCATTGGTCCTCCTGGCCCTGCTGGTGCCCCTGGTGACAAGGGTGAAGCTGGTCCCAGTGGTCCTCCCGGTCCCACCGGAGCCCGTGGTGCTCCCGGAGACCGTGGTGAGGCTGGTCCCCCTGGTCCTGCTGGCTTTGCCGGCCCCCCTGGTGCTGATGGCCAACCTGGTGCGAAAGGTGAACCTGGTGATACTGGTGTTAAAGGTGATGCTGGTCCTCCTGGCCCTGCTGGTCCTGCTGGACCCCCCGGCCCCATTGGTAACGTTGGTGCTCCTGGACCCAAAGGTCCTCGTGGTGCTGCTGGTCCCCCTGGTGCTACTGGCTTCCCTGGTGCTGCTGGCCGTGTCGGTCCCCCTGGTCCCTCTGGAAATGCTGGACCCCCTGGCCCTCCCGGTCCCGTTGGCAAAGAAGGGGGCAAAGGTCCCCGTGGTGAGACTGGCCCTGCTGGACGTCCTGGTGAAGTTGGTCCCCCAGGTCCCCCCGGTCCTGCTGGTGAGAAAGGATCTCCTGGTGCTGATGGACCTGCTGGCTCTCCTGGTACCCCTGGACCTCAGGGTATTGCTGGACAACGTGGTGTGGTCGGTCTTCCCGGTCAGAGAGGAGAAAGAGGCTTCCCTGGTCTTCCTGGCCCCTCTGGTGAACCTGGCAAACAAGGTCCTTCTGGATCAAGTGGTGAACGCGGTCCCCCTGGCCCCATGGGGCCCCCTGGATTGGCTGGTCCCCCTGGTGAATCTGGACGTGAGGGATCCCCTGGTGCTGAAGGCTCCCCTGGAAGGGATGGTGCTCCCGGGGCCAAGGGTGACCGTGGTGAGACTGGCCCCGCTGGCCCCCCTGGTGCCCCTGGTGCTCCCGGTGCTCCCGGCCCTGTTGGTCCCGCTGGCAAGAATGGCGATCGTGGTGAGACTGGTCCTGCTGGTCCTGCTGGTCCCATTGGCCCTGCTGGTGCCCGTGGCCCTGCTGGACCCCAAGGCCCCCGTGGTGACAAGGGTGAGACAGGCGAACAAGGTGACAGAGGCATAAAGGGTCATCGTGGCTTCTCTGGTCTCCAGGGTCCTCCTGGTTCTCCTGGTTCTCCTGGTGAACAAGGCCCCTCTGGAGCTTCAGGTCCTGCAGGCCCCCGGGGTCCCCCTGGCTCTGCTGGTTCTCCTGGCAAAGACGGACTCAACGGTCTCCCTGGCCCCATTGGTCCCCCTGGTCCTCGAGGTCGCACTGGTGACAGCGGCCCTGCTGGTCCCCCCGGCCCTCCTGGACCCCCTGGCCCTCCTGGACCTCCCAGTGGCGGTTATGACTTCAGCTTCCTGCCTCAGCCACCTCAAGAGAAGTCTCAAGATGGTGGCCGCTACTACCGGGCCGATGATGCTAACGTGGTTCGTGACCGTGACCTTGAGGTGGACACCACCCTCAAGAGCCTGAGTCAGCAGATTGAGAACATCCGCAGCCCCGAAGGCAGCCGCAAGAACCCTGCCCGCACATGCCGCGACCTCAAGATGTGCCACTCTGACTGGAAGAGCGGAGAGTACTGGATCGACCCTAACCAAGGCTGCAACCTGGACGCCATCAAGGTCTACTGCAACATGGAGACAGGTCAGACCTGTGTGTTCCCTACTCAGCCGTCTGTGCCTCAGAAGAACTGGTACATCAGCCCGAACCCCAAGGAAAAGAAGCACGTCTGGTTTGGAGAGAGCATGACCGATGGATTCCCGTTCGAGTACGGAAGCGAGGGCTCCGACCCCGCCGATGTCGCTATCCAGCTGACCTTCCTGCGCCTAATGTCCACCGAGGCCTCCCAGAACATCACCTATCACTGCAAGAACAGCGTAGCCTACATGGACCAGCAGACTGGCAACCTCAAGAAGGCCCTGCTCCTCCAGGGATCCAACGAGATCGAGCTCAGAGGCGAAGGCAACAGTCGCTTCACCTACAGCACCCTTGTGGACGGCTGCACGAGTCACACCGGAACTTGGGGCAAGACAGTCATCGAATACAAAACCACCAAGACCTCCCGCCTGCCCATCATCGATGTGGCTCCCTTGGACATTGGTGCCCCAGACCAGGAATTCGGACTAGACATTGGCCCTGCCTGCTTCGTGTAA | |
| Amino acid sequence: | Length=1453bp |
| BlastP NCBI nr
MFSFVDLRLLLLLGATALLTHGQEDIPEVSCIHNGLRVPNGETWKPEVCLICICHNGTAVCDDVQCNEELDCPNPQRREGECCAFCPEEYVSPNSEDVGVEGPKGDPGPQGPRGPVGPPGRDGIPGQPGLPGPPGPPGPPGPPGLGGNFASQMSYGYDEKSAGVSVPGPMGPSGPRGLPGPPGAPGPQGFQGPPGEPGEPGGSGPMGPRGPPGPPGKNGDDGEAGKPGRPGERGPPGPQGARGLPGTAGLPGMKGHRGFSGLDGAKGDAGPAGPKGEPGSPGENGAPGQMGPRGLPGERGRPGPPGTAGARGNDGAVGAAGPPGPTGPTGPPGFPGAVGAKGEAGPQGARGSEGPQGVRGEPGPPGPAGAAGPAGNPGADGQPGAKGANGAPGIAGAPGFPGARGPSGPQGPSGPPGPKGNSGEPGAPGNKGDTGAKGEPGATGVQGPPGPAGEEGKRGARGEPGPSGLPGPPGERGGPGSRGFPGADGVAGPKGPSGERGAPGPAGPKGSPGEAGRPGEAGLPGAKGLTGSPGSPGPDGKTGPPGPAGQDGRPGPAGPPGARGQAGVMGFPGPKGTAGEPGKAGERGLPGPPGAVGPAGKDGEAGAQGAPGPAGPAGERGEQGPAGSPGFQGLPGPAGPPGEAGKPGEQGVPGDLGAPGPSGARGERGFPGERGVQGPPGPAGPRGNNGAPGNDGAKGDTGAPGAPGSQGAPGLQGMPGERGAAGLPGPKGDRGDAGPKGADGSPGKDGARGLTGPIGPPGPAGAPGDKGEAGPSGPPGPTGARGAPGDRGEAGPPGPAGFAGPPGADGQPGAKGEPGDTGVKGDAGPPGPAGPAGPPGPIGNVGAPGPKGPRGAAGPPGATGFPGAAGRVGPPGPSGNAGPPGPPGPVGKEGGKGPRGETGPAGRPGEVGPPGPPGPAGEKGSPGADGPAGSPGTPGPQGIAGQRGVVGLPGQRGERGFPGLPGPSGEPGKQGPSGSSGERGPPGPMGPPGLAGPPGESGREGSPGAEGSPGRDGAPGAKGDRGETGPAGPPGAPGAPGAPGPVGPAGKNGDRGETGPAGPAGPIGPAGARGPAGPQGPRGDKGETGEQGDRGIKGHRGFSGLQGPPGSPGSPGEQGPSGASGPAGPRGPPGSAGSPGKDGLNGLPGPIGPPGPRGRTGDSGPAGPPGPPGPPGPPGPPSGGYDFSFLPQPPQEKSQDGGRYYRADDANVVRDRDLEVDTTLKSLSQQIENIRSPEGSRKNPARTCRDLKMCHSDWKSGEYWIDPNQGCNLDAIKVYCNMETGQTCVFPTQPSVPQKNWYISPNPKEKKHVWFGESMTDGFPFEYGSEGSDPADVAIQLTFLRLMSTEASQNITYHCKNSVAYMDQQTGNLKKALLLQGSNEIELRGEGNSRFTYSTLVDGCTSHTGTWGKTVIEYKTTKTSRLPIIDVAPLDIGAPDQEFGLDIGPACFV | |