Information
Gene name:SCN9A
Databases ID:DEG :DEG20101928       OrthoDB:EOG093700BU     UniProt:Q15858
Organism:Homo sapiens
Function:sodium channel, voltage gated, type IX alpha subunit
Nucleotide sequence:Length=5970bp
BlastN NCBI nr BlastX NCBI nr BlastN NCBI Human
ATGGCAATGTTGCCTCCCCCAGGACCTCAGAGCTTTGTCCATTTCACAAAACAGTCTCTTGCCCTCATTGAACAACGCATTGCTGAAAGAAAATCAAAGGAACCCAAAGAAGAAAAGAAAGATGATGATGAAGAAGCCCCAAAGCCAAGCAGTGACTTGGAAGCTGGCAAACAGCTGCCCTTCATCTATGGGGACATTCCTCCCGGCATGGTGTCAGAGCCCCTGGAGGACTTGGACCCCTACTATGCAGACAAAAAGACTTTCATAGTATTGAACAAAGGGAAAACAATCTTCCGTTTCAATGCCACACCTGCTTTATATATGCTTTCTCCTTTCAGTCCTCTAAGAAGAATATCTATTAAGATTTTAGTACACTCTACCTTATTCAGCATGCTCATCATGTGCACTATTCTGACAAACTGCATATTTATGACCATGAATAACCCACCGGACTGGACCAAAAATGTCGAGTACACTTTTACTGGAATATATACTTTTGAATCACTTGTAAAAATCCTTGCAAGAGGCTTCTGTGTAGGAGAATTCACTTTTCTTCGTGACCCGTGGAACTGGCTGGATTTTGTCGTCATTGTTTTTGCGTATTTAACAGAATTTGTAAACCTAGGCAATGTTTCAGCTCTTCGAACTTTCAGAGTATTGAGAGCTTTGAAAACTATTTCTGTAATCCCAGGCCTGAAGACAATTGTAGGGGCTTTGATCCAGTCAGTGAAGAAGCTTTCTGATGTCATGATCCTGACTGTGTTCTGTCTGAGTGTGTTTGCACTAATTGGACTACAGCTGTTCATGGGAAACCTGAAGCATAAATGTTTTCGAAATTCACTTGAAAATAATGAAACATTAGAAAGCATAATGAATACCCTAGAGAGTGAAGAAGACTTTAGAAAATATTTTTATTACTTGGAAGGATCCAAAGATGCTCTCCTTTGTGGTTTCAGCACAGATTCAGGTCAGTGTCCAGAGGGGTACACCTGTGTGAAAATTGGCAGAAACCCTGATTATGGCTACACGAGCTTTGACACTTTCAGCTGGGCCTTCTTAGCCTTGTTTAGGCTAATGACCCAAGATTACTGGGAAAACCTTTACCAACAGACGCTGCGTGCTGCTGGCAAAACCTACATGATCTTCTTTGTCGTAGTGATTTTCCTGGGCTCCTTTTATCTAATAAACTTGATCCTGGCTGTGGTTGCCATGGCATATGAAGAACAGAACCAGGCAAACATTGAAGAAGCTAAACAGAAAGAATTAGAATTTCAACAGATGTTAGACCGTCTTAAAAAAGAGCAAGAAGAAGCTGAGGCAATTGCAGCGGCAGCGGCTGAATATACAAGTATTAGGAGAAGCAGAATTATGGGCCTCTCAGAGAGTTCTTCTGAAACATCCAAACTGAGCTCTAAAAGTGCTAAAGAAAGAAGAAACAGAAGAAAGAAAAAGAATCAAAAGAAGCTCTCCAGTGGAGAGGAAAAGGGAGATGCTGAGAAATTGTCGAAATCAGAATCAGAGGACAGCATCAGAAGAAAAAGTTTCCACCTTGGTGTCGAAGGGCATAGGCGAGCACATGAAAAGAGGTTGTCTACCCCCAATCAGTCACCACTCAGCATTCGTGGCTCCTTGTTTTCTGCAAGGCGAAGCAGCAGAACAAGTCTTTTTAGTTTCAAAGGCAGAGGAAGAGATATAGGATCTGAGACTGAATTTGCCGATGATGAGCACAGCATTTTTGGAGACAATGAGAGCAGAAGGGGCTCACTGTTTGTGCCCCACAGACCCCAGGAGCGACGCAGCAGTAACATCAGCCAAGCCAGTAGGTCCCCACCAATGCTGCCGGTGAACGGGAAAATGCACAGTGCTGTGGACTGCAACGGTGTGGTCTCCCTGGTTGATGGACGCTCAGCCCTCATGCTCCCCAATGGACAGCTTCTGCCAGAGGTGATAATAGATAAGGCAACTTCTGATGACAGCGGCACGACCAATCAAATACACAAGAAAAGGCGTTGTAGTTCCTATCTCCTTTCAGAGGATATGCTGAATGATCCCAACCTCAGACAGAGAGCAATGAGTAGAGCAAGCATATTAACAAACACTGTGGAAGAACTTGAAGAGTCCAGACAAAAATGTCCACCTTGGTGGTACAGATTTGCACACAAATTCTTGATCTGGAATTGCTCTCCATATTGGATAAAATTCAAAAAGTGTATCTATTTTATTGTAATGGATCCTTTTGTAGATCTTGCAATTACCATTTGCATAGTTTTAAACACATTATTTATGGCTATGGAACACCACCCAATGACTGAGGAATTCAAAAATGTACTTGCTATAGGAAATTTGGTCTTTACTGGAATCTTTGCAGCTGAAATGGTATTAAAACTGATTGCCATGGATCCATATGAGTATTTCCAAGTAGGCTGGAATATTTTTGACAGCCTTATTGTGACTTTAAGTTTAGTGGAGCTCTTTCTAGCAGATGTGGAAGGATTGTCAGTTCTGCGATCATTCAGACTGCTCCGAGTCTTCAAGTTGGCAAAATCCTGGCCAACATTGAACATGCTGATTAAGATCATTGGTAACTCAGTAGGGGCTCTAGGTAACCTCACCTTAGTGTTGGCCATCATCGTCTTCATTTTTGCTGTGGTCGGCATGCAGCTCTTTGGTAAGAGCTACAAAGAATGTGTCTGCAAGATCAATGATGACTGTACGCTCCCACGGTGGCACATGAACGACTTCTTCCACTCCTTCCTGATTGTGTTCCGCGTGCTGTGTGGAGAGTGGATAGAGACCATGTGGGACTGTATGGAGGTCGCTGGTCAAGCTATGTGCCTTATTGTTTACATGATGGTCATGGTCATTGGAAACCTGGTGGTCCTAAACCTATTTCTGGCCTTATTATTGAGCTCATTTAGTTCAGACAATCTTACAGCAATTGAAGAAGACCCTGATGCAAACAACCTCCAGATTGCAGTGACTAGAATTAAAAAGGGAATAAATTATGTGAAACAAACCTTACGTGAATTTATTCTAAAAGCATTTTCCAAAAAGCCAAAGATTTCCAGGGAGATAAGACAAGCAGAAGATCTGAATACTAAGAAGGAAAACTATATTTCTAACCATACACTTGCTGAAATGAGCAAAGGTCACAATTTCCTCAAGGAAAAAGATAAAATCAGTGGTTTTGGAAGCAGCGTGGACAAACACTTGATGGAAGACAGTGATGGTCAATCATTTATTCACAATCCCAGCCTCACAGTGACAGTGCCAATTGCACCTGGGGAATCCGATTTGGAAAATATGAATGCTGAGGAACTTAGCAGTGATTCGGATAGTGAATACAGCAAAGTGAGATTAAACCGGTCAAGCTCCTCAGAGTGCAGCACAGTTGATAACCCTTTGCCTGGAGAAGGAGAAGAAGCAGAGGCTGAACCTATGAATTCCGATGAGCCAGAGGCCTGTTTCACAGATGGTTGTGTATGGAGGTTCTCATGCTGCCAAGTTAACATAGAGTCAGGGAAAGGAAAAATCTGGTGGAACATCAGGAAAACCTGCTACAAGATTGTTGAACACAGTTGGTTTGAAAGCTTCATTGTCCTCATGATCCTGCTCAGCAGTGGTGCCCTGGCTTTTGAAGATATTTATATTGAAAGGAAAAAGACCATTAAGATTATCCTGGAGTATGCAGACAAGATCTTCACTTACATCTTCATTCTGGAAATGCTTCTAAAATGGATAGCATATGGTTATAAAACATATTTCACCAATGCCTGGTGTTGGCTGGATTTCCTAATTGTTGATGTTTCTTTGGTTACTTTAGTGGCAAACACTCTTGGCTACTCAGATCTTGGCCCCATTAAATCCCTTCGGACACTGAGAGCTTTAAGACCTCTAAGAGCCTTATCTAGATTTGAAGGAATGAGGGTCGTTGTGAATGCACTCATAGGAGCAATTCCTTCCATCATGAATGTGCTACTTGTGTGTCTTATATTCTGGCTGATATTCAGCATCATGGGAGTAAATTTGTTTGCTGGCAAGTTCTATGAGTGTATTAACACCACAGATGGGTCACGGTTTCCTGCAAGTCAAGTTCCAAATCGTTCCGAATGTTTTGCCCTTATGAATGTTAGTCAAAATGTGCGATGGAAAAACCTGAAAGTGAACTTTGATAATGTCGGACTTGGTTACCTATCTCTGCTTCAAGTTGCAACTTTTAAGGGATGGACGATTATTATGTATGCAGCAGTGGATTCTGTTAATGTAGACAAGCAGCCCAAATATGAATATAGCCTCTACATGTATATTTATTTTGTCGTCTTTATCATCTTTGGGTCATTCTTCACTTTGAACTTGTTCATTGGTGTCATCATAGATAATTTCAACCAACAGAAAAAGAAGCTTGGAGGTCAAGACATCTTTATGACAGAAGAACAGAAGAAATACTATAATGCAATGAAAAAGCTGGGGTCCAAGAAGCCACAAAAGCCAATTCCTCGACCAGGGAACAAAATCCAAGGATGTATATTTGACCTAGTGACAAATCAAGCCTTTGATATTAGTATCATGGTTCTTATCTGTCTCAACATGGTAACCATGATGGTAGAAAAGGAGGGTCAAAGTCAACATATGACTGAAGTTTTATATTGGATAAATGTGGTTTTTATAATCCTTTTCACTGGAGAATGTGTGCTAAAACTGATCTCCCTCAGACACTACTACTTCACTGTAGGATGGAATATTTTTGATTTTGTGGTTGTGATTATCTCCATTGTAGGTATGTTTCTAGCTGATTTGATTGAAACGTATTTTGTGTCCCCTACCCTGTTCCGAGTGATCCGTCTTGCCAGGATTGGCCGAATCCTACGTCTAGTCAAAGGAGCAAAGGGGATCCGCACGCTGCTCTTTGCTTTGATGATGTCCCTTCCTGCGTTGTTTAACATCGGCCTCCTGCTCTTCCTGGTCATGTTCATCTACGCCATCTTTGGAATGTCCAACTT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Amino acid sequence:Length=1989bp
BlastP NCBI nr
MAMLPPPGPQSFVHFTKQSLALIEQRIAERKSKEPKEEKKDDDEEAPKPSSDLEAGKQLPFIYGDIPPGMVSEPLEDLDPYYADKKTFIVLNKGKTIFRFNATPALYMLSPFSPLRRISIKILVHSTLFSMLIMCTILTNCIFMTMNNPPDWTKNVEYTFTGIYTFESLVKILARGFCVGEFTFLRDPWNWLDFVVIVFAYLTEFVNLGNVSALRTFRVLRALKTISVIPGLKTIVGALIQSVKKLSDVMILTVFCLSVFALIGLQLFMGNLKHKCFRNSLENNETLESIMNTLESEEDFRKYFYYLEGSKDALLCGFSTDSGQCPEGYTCVKIGRNPDYGYTSFDTFSWAFLALFRLMTQDYWENLYQQTLRAAGKTYMIFFVVVIFLGSFYLINLILAVVAMAYEEQNQANIEEAKQKELEFQQMLDRLKKEQEEAEAIAAAAAEYTSIRRSRIMGLSESSSETSKLSSKSAKERRNRRKKKNQKKLSSGEEKGDAEKLSKSESEDSIRRKSFHLGVEGHRRAHEKRLSTPNQSPLSIRGSLFSARRSSRTSLFSFKGRGRDIGSETEFADDEHSIFGDNESRRGSLFVPHRPQERRSSNISQASRSPPMLPVNGKMHSAVDCNGVVSLVDGRSALMLPNGQLLPEVIIDKATSDDSGTTNQIHKKRRCSSYLLSEDMLNDPNLRQRAMSRASILTNTVEELEESRQKCPPWWYRFAHKFLIWNCSPYWIKFKKCIYFIVMDPFVDLAITICIVLNTLFMAMEHHPMTEEFKNVLAIGNLVFTGIFAAEMVLKLIAMDPYEYFQVGWNIFDSLIVTLSLVELFLADVEGLSVLRSFRLLRVFKLAKSWPTLNMLIKIIGNSVGALGNLTLVLAIIVFIFAVVGMQLFGKSYKECVCKINDDCTLPRWHMNDFFHSFLIVFRVLCGEWIETMWDCMEVAGQAMCLIVYMMVMVIGNLVVLNLFLALLLSSFSSDNLTAIEEDPDANNLQIAVTRIKKGINYVKQTLREFILKAFSKKPKISREIRQAEDLNTKKENYISNHTLAEMSKGHNFLKEKDKISGFGSSVDKHLMEDSDGQSFIHNPSLTVTVPIAPGESDLENMNAEELSSDSDSEYSKVRLNRSSSSECSTVDNPLPGEGEEAEAEPMNSDEPEACFTDGCVWRFSCCQVNIESGKGKIWWNIRKTCYKIVEHSWFESFIVLMILLSSGALAFEDIYIERKKTIKIILEYADKIFTYIFILEMLLKWIAYGYKTYFTNAWCWLDFLIVDVSLVTLVANTLGYSDLGPIKSLRTLRALRPLRALSRFEGMRVVVNALIGAIPSIMNVLLVCLIFWLIFSIMGVNLFAGKFYECINTTDGSRFPASQVPNRSECFALMNVSQNVRWKNLKVNFDNVGLGYLSLLQVATFKGWTIIMYAAVDSVNVDKQPKYEYSLYMYIYFVVFIIFGSFFTLNLFIGVIIDNFNQQKKKLGGQDIFMTEEQKKYYNAMKKLGSKKPQKPIPRPGNKIQGCIFDLVTNQAFDISIMVLICLNMVTMMVEKEGQSQHMTEVLYWINVVFIILFTGECVLKLISLRHYYFTVGWNIFDFVVVIISIVGMFLADLIETYFVSPTLFRVIRLARIGRILRLVKGAKGIRTLLFALMMSLPALFNIGLLLFLVMFIYAIFGMSNFAYVKKEDGINDMFNFETFGNSMICLFQITTSAGWDGLLAPILNSKPPDCDPKKVHPGSSVEGDCGNPSVGIFYFVSYIIISFLVVVNMYIAVILENFSVATEESTEPLSEDDFEMFYEVWEKFDPDATQFIEFSKLSDFAAALDPPLLIAKPNKVQLIAMDLPMVSGDRIHCLDILFAFTKRVLGESGEMDSLRSQMEERFMSANPSKVSYEPITTTLKRKQEDVSATVIQRAYRRYRLRQNVKNISSIYIKDGDRDDDLLNKKDMAFDNVNENSSPEKTDATSSTTSPPSYDSVTKPDKEKYEQDRTEKEDKGKDSKESKK