Information | |
Gene name: | nup189 |
Databases ID: | DEG :DEG20090330 OrthoDB:EOG09370C6Y UniProt:- |
Organism: | Schizosaccharomyces pombe 972h- |
Function: | nucleoporin Nup98 and Nup96 |
Nucleotide sequence: | Length=5337bp |
BlastN NCBI nr
BlastX NCBI nr
BlastN NCBI Human
ATGTTTGGACAAAACAATTCTTCCGGATTTGGAGGAGGAACCGGTGCTTTCGGTCAAAATAATCAACAAACTGGTGGGTTATTTGGTTCCAACTCCAATACTCCAGGGAACACTTTGTTTGGTTCCCAAAACACTTCTACAACTGGCTTTGGGCAGAACACTACTCAACCCTTGTTTGGATCAAATACGAACGGTGGACTATTTGGAAATAGAAACAACACTACCACGACTGGTGGCACAGGTTTTGGAATGTCCTCTGGGACAGGTATGTTTGGCCAATCCAATACTCCTGCTTTTGGAGGCACGAACAACGCCACAAATCCTAGTGGTGGTGGCCTCTTTGGATCAAATACCGCCAACAACAATGCAAATACTGGAACGTCATTTTCTTTTGGATCGAACGCTGGTTCAACAGGGTTTGGTTCGCAAGGTACTGGTGGTGGCTTGTTTGGTTCGTCCACTACACCCGCTACGACCAACGCTTTCGGAACCTCTGGATTTGTCTCAAGCAATGCAAACGCTGTGAATGGTACAGCTAACCCACCTTATGCGGTAACTTCTGAAAAAGACCCTCAAACAAACGGTACTAGTGTCTTCCAGTCTATAACTTGTATGCCCGCTTATAGATCTTATTCATTTGAAGAGTTGCGTTTACAAGACTATAATCAAGGACGACGTTTTGGCAATGCTTCTAGTACGAACACTACTTCTGCATTTGGTTCAACACCCGCATTTGGAGCTTCAACTACTCCGTTTGGTCAGAATTTGTCAGGTACCACAAATAATGCAACACCGTTTGGTACATCGAATGCTACTAATACCACTCCTGGTTCCGGTCTCTTTGGCGGTGGATCTGCATTTGGTAGTAACACTACCAATACAGGGTTTGGTTCTGGAACAAATAATGCATCCGGTGGGTTATTTGGTCAAAACAATAATACCACCTCAACTCCTTCAACCGGTCTTTTTGGTGGCTCTACATTTAATCAACAAAAACCAGCTTTTTCAGGTTTTGGCTCAACCACTAACACTACCAATACTGGTACAGGAACGGGTCTTTTTGGTTCAAATAACGCAACCAATACAGGAACAGGTCAAACTACGGGTGGCTTATTTGGTGGTGCTGCCACTGGTACGGGTACGGGATTTGGTTCTTCTACTGGGGGGTTTGGAAGCAACACGAATAACCAACCCAATTCAGGTACCATGGGTACAGGTTTGTTTGGTTTTGGCGCTAATAATAATACGGCAAATAATAACACCGCTCCAACATCTACTTTTGGTGGTAACAATAGTAGTAATTTTTCCTTTGGTGCCAATAATAATGCAGCCACTAAGCCTTCTGGATTCGGTTTTGGTTCCACGACCACTACTCCTGCCAGCGGAGGTTTTTCTTTTGGGCAAAATGCTAATAATGCTCCCAAGCCAGCTTTTGGATCCACTGCTACCACTGCTCCTAAACCAGCAGGGACAGGTTTGTTTGGTGGTTTAGGAGCCGGTGCTAATACCAACACAGCTACTAATGCTACCGGCACTGGCGGAAGTTTATTCGGAAATGCGAACACTGCGGGTTCTAACATGTTTGGATCAGCCAACTCCAGTACTCCTGGTACCGGTTTATTTGGCTCTACGCAAACGAATAATGCTACTTCCAATACCGGAACCGGGCTCTTTGGATCCAATAATGCAAACACAACCAATACCGGTGGTAGTTTGTTTAATAAGCCTTCTACTACAACTGGTGGTTTGTTTGGTAACACAACTGCTCAACAACCATCTACAACTACATCTGGATTATTTGGGGCTTCTAATACTAACAACCAAGCACAAACTTCAAATTTTGGTACTGGGTTATTTGGTGGATCTCAAGCTGGACAACAGCAACAACCATTACAGGCCAGTATAGACCAAAACCCTTACGGCAATAATCCCTTATTTTCAAGCACAACTTCACAAGTTGCACCAACTAGTATTCAGGAACCGATAGCTTCACCGTTGACTTCTAAACCGACTCCCAAAAAGGCAGCTTCTCTACCACAATTTTGGTTGTCACCTCGTTCGCATAATACTGCACGTTTGGCTTCTATTTCCTCTTTTGCCAAATCGGCTGTAATGAATTCAACAAGTGCTTCTGGTAAACCGAAATCACTACACCTGTTTGATTCGCTTAACGATGATGTGTTGCTGAGCGCCGATGCTTTTACTCCGAGACAAAACATAAAAAAGCTGGTTATTACCCACAAAATCTCCAAAGATGATATCCTGCAAAATGGTGTGAAAAATGGCAACGATGCCAAATCAGACTCAAAAGTACAAGAAAAAGCACCTCAAAATGAAGCAGATGGCTCTTTAAAGAAAGACGAACATGTAGTTCTATCTGACGATTACTGGATGAAACCCTCAATTGAGGAGCTTTCTAAGTATCCTAAAGAAAAATTATGTTCTGTCCATCAATTCTCTGTCGGTCGCACTGGCTATGGCCAAGTTGCATTTTTAAAACCCGTCGATTTGAGTGGATTCGAAAAGCTTGAAGACATACCTGGCAAGGTCGTTGTTTTTGAGAGAAAGATTTGCGCCGTATATCCTGTTGAGGGATCAAGTCCTCCTTTGGGTGAAGGCCTTAATGTTCCTGCCATAATTACACTTGAAAAAACCTGGCCATTATCTCGAGAGACTCGAGAGCCTATTAAGGATCCTCAGAACCCTAGATACATTCAACATGTAAAGAGACTTCATCGTATTAAAGATACCGAATTTATTGACTTTAATGACGGAAAATGGATCTTCAAGGTTCAGCATTTCTCTAGATACGGTTTGCTGGATGATGAAGAGGAAGAAAACGATATGTCATCAACTAGTAATGAAGCAGGTAATTTAAAAAAGTATGATCAACCAAACTTGAAAGTTTCGGGAAAAAATGATTCATTTGTTACTCACCATACACCAGGTGCATTTCCCAACGACAGTAAGAACAAGGAATTGAACCGCCATTTCCTAAAAGTTGATGATTCTGCCCCTTTGGATGATACTTTTATGTCCAAGAAAGTCAAACTTGATTTTTCTAGCGATTCAAATGTCTCAGAAAGAGGTGACTATGACGATAATGCAAAAAAAGTCGACGAGGTTATTTCTATCGAAAAAGTCGATGGATACTCGAAGGAAAATAACGTTCCACTTTCTGAAGATGACTTATCAAATTCTTCGGAATCTTCTAATGAATCCGTTTATAGCCTAGTAGAAGAGTCTGATGCTAGTTTGGCAGCAGACAATATGGATATTGAGGATATTAGCGAGGAGTCGGACAGGGAGGAACTGTCTTCTATGCGTTTTGGAGCCCAAGATTTTCATGGGCTTGTCGTTACAGATAATTGGAGAGACCAATTAAATTTGAGTGTTCAACGCTCGGCTTTAATAAAAGCTGCTTTTCCTGAAAGTCAATCAAATGCAAATTTAAAAAACTCTAGAGGTATATATTATAACGAACATGATTTAGTGACGGACATTTTTGGAAATCAAAACCTCGACACCGATAGACCTTGGCAATCTTTAGATAAGCCGGGGGCTTTCATACCCTCAAAATTTCATTTTACTGCCAACGGATCATGTATATACGTGCTGAAATCTTCGGATGTAAAAATAAGATCGATATATGATTTTATACCTACCAAAGATCCAAATGGCACGAAGTTGTTAGAGTATCAGCTCGATCAAACAGAAGTTTACTTGGATTTGAGTGGGACCCATGCTGCTTCACCTCGTTCATCTATGACTGTCAAACCTTTATCGCTATGTTCTTCTGGATATGAAAGCATAGTGTGGGATCTGACTTCAATTCTATTTGACCCAAAAAACTACTCCTTGCCTTCAGAACTCTCATCAGAGGCTCGTGAAGTTCTTTATCAAAAGCTTGTACGGGAATCTTTATCTGAATGGATTACTAAGACACTTGAGCATGAAACAACTACATTAGCAAAGGAAGCCGAAACATCAGAAGAACGTATTTACATTTTGTTAACAGGAAACCTTATTGGTCAGGCTTGTGAGGAAGCGGTCCAATCCCAAAATAATCGTTTATCCACGCTTATACCTTTAGTCAATAGTGATGTAGATATCCAGCAAGAGGTGAAACAGCAATTGGAGGAATGGAGAAAACACGGTGATTTACCCTTCATCAATAAATTTACAAGACTAATATTCGAATTGCTTTCTGGTAATACTGATATTGCTGAAGGCTGTGGGACTAAAGGAGATGAGGATTATGTTCAATCTATACCCATTACAAAAAATATGACCTGGTTAAGAGCATTCGGCTTAAAGTTGTGGTACAACACTGATATTAGTATAGGTGAAGCTATGCAATTGTATGTTGAGTCTTTGCAAAAGTTTCCTGAAATCATGCAGAAACCAATCGCCACTAGTGCTGTGCAAGGTATTGAAGTATATGACATTATTTATCTTTTGCTCAAAGCGTATGCTATGGGCACTAGTTTAGAAGAACTTACTATACCGGAAAGCGCTAAATGTTCGCCGCTGAATTACAGAGTAGTATGGCAATTGGCAATTTACTTATCGAAAGCTAGATCCTTATGTGACTTTTCAGATAGAGTGGTGGATATTAACATGGCTGAAGATCTAAAACCTATTAGTGTTCATTCTGATCAATTGACTCTGGCATATGCTTCCCAGTTGGAAGCATCAGGGCAATGGTTATGGTCATTATTTGTTTTATTGCATTTGGAGAATGTAGAAACCCGAACATCGACTATCACTTCATGTTTAGCACGAAACCTTCGTGGGGGATTAGGTGCTGGTGCTGTTGAAATGATTGAAAAGTTATGTATCCCTGAATCCTGGTTAAACGAGGCCAAAGCGTTGTATGCACGTTATGTTGGTGATCACTTAAACGAGCTTTATTTCCTTCAGGAAGCTGCTTTGTATGAAGATGCGCATAAGGTGTTGTTGGATACCTTGGCTCCACAGGCTGTTATAAGTGGTAATAA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| |
Amino acid sequence: | Length=1778bp |
BlastP NCBI nr
MFGQNNSSGFGGGTGAFGQNNQQTGGLFGSNSNTPGNTLFGSQNTSTTGFGQNTTQPLFGSNTNGGLFGNRNNTTTTGGTGFGMSSGTGMFGQSNTPAFGGTNNATNPSGGGLFGSNTANNNANTGTSFSFGSNAGSTGFGSQGTGGGLFGSSTTPATTNAFGTSGFVSSNANAVNGTANPPYAVTSEKDPQTNGTSVFQSITCMPAYRSYSFEELRLQDYNQGRRFGNASSTNTTSAFGSTPAFGASTTPFGQNLSGTTNNATPFGTSNATNTTPGSGLFGGGSAFGSNTTNTGFGSGTNNASGGLFGQNNNTTSTPSTGLFGGSTFNQQKPAFSGFGSTTNTTNTGTGTGLFGSNNATNTGTGQTTGGLFGGAATGTGTGFGSSTGGFGSNTNNQPNSGTMGTGLFGFGANNNTANNNTAPTSTFGGNNSSNFSFGANNNAATKPSGFGFGSTTTTPASGGFSFGQNANNAPKPAFGSTATTAPKPAGTGLFGGLGAGANTNTATNATGTGGSLFGNANTAGSNMFGSANSSTPGTGLFGSTQTNNATSNTGTGLFGSNNANTTNTGGSLFNKPSTTTGGLFGNTTAQQPSTTTSGLFGASNTNNQAQTSNFGTGLFGGSQAGQQQQPLQASIDQNPYGNNPLFSSTTSQVAPTSIQEPIASPLTSKPTPKKAASLPQFWLSPRSHNTARLASISSFAKSAVMNSTSASGKPKSLHLFDSLNDDVLLSADAFTPRQNIKKLVITHKISKDDILQNGVKNGNDAKSDSKVQEKAPQNEADGSLKKDEHVVLSDDYWMKPSIEELSKYPKEKLCSVHQFSVGRTGYGQVAFLKPVDLSGFEKLEDIPGKVVVFERKICAVYPVEGSSPPLGEGLNVPAIITLEKTWPLSRETREPIKDPQNPRYIQHVKRLHRIKDTEFIDFNDGKWIFKVQHFSRYGLLDDEEEENDMSSTSNEAGNLKKYDQPNLKVSGKNDSFVTHHTPGAFPNDSKNKELNRHFLKVDDSAPLDDTFMSKKVKLDFSSDSNVSERGDYDDNAKKVDEVISIEKVDGYSKENNVPLSEDDLSNSSESSNESVYSLVEESDASLAADNMDIEDISEESDREELSSMRFGAQDFHGLVVTDNWRDQLNLSVQRSALIKAAFPESQSNANLKNSRGIYYNEHDLVTDIFGNQNLDTDRPWQSLDKPGAFIPSKFHFTANGSCIYVLKSSDVKIRSIYDFIPTKDPNGTKLLEYQLDQTEVYLDLSGTHAASPRSSMTVKPLSLCSSGYESIVWDLTSILFDPKNYSLPSELSSEAREVLYQKLVRESLSEWITKTLEHETTTLAKEAETSEERIYILLTGNLIGQACEEAVQSQNNRLSTLIPLVNSDVDIQQEVKQQLEEWRKHGDLPFINKFTRLIFELLSGNTDIAEGCGTKGDEDYVQSIPITKNMTWLRAFGLKLWYNTDISIGEAMQLYVESLQKFPEIMQKPIATSAVQGIEVYDIIYLLLKAYAMGTSLEELTIPESAKCSPLNYRVVWQLAIYLSKARSLCDFSDRVVDINMAEDLKPISVHSDQLTLAYASQLEASGQWLWSLFVLLHLENVETRTSTITSCLARNLRGGLGAGAVEMIEKLCIPESWLNEAKALYARYVGDHLNELYFLQEAALYEDAHKVLLDTLAPQAVISGNKTQLKKALEGFNGQTDGLASWRFGGQIYSDYLDLLEGNFDANQELKLFTLRKISVALKELNATNLLQKAALHKISRFVNALCNEESLTDAICNLPLPLADSLANLQNISVQF |